20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_0683 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_0683  hypothetical protein  100 
 
 		 463 aa  947    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3333  hypothetical protein  40.63 
 
 		 449 aa  311  2e-83  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.437943  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4459  hypothetical protein  31.43 
 
 		 454 aa  205  1e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.448682  normal  0.0102439 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04087  hypothetical protein  32.98 
 
 		 422 aa  199  1.0000000000000001e-49  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01805  hypothetical protein  27.16 
 
 		 436 aa  171  3e-41  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3608  hypothetical protein  29.3 
 
 		 417 aa  169  1e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.789533  decreased coverage  0.0000392195 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3775  hypothetical protein  29.01 
 
 		 436 aa  163  6e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5323  hypothetical protein  26.27 
 
 		 482 aa  137  4e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.17294 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3359  hypothetical protein  26.53 
 
 		 491 aa  125  2e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.796012 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2049  multi-copper enzyme maturase ABC-type transport system permease component-like protein  24.11 
 
 		 452 aa  71.6  0.00000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04086  hypothetical protein  26.45 
 
 		 475 aa  64.7  0.000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3360  hypothetical protein  27.21 
 
 		 465 aa  61.6  0.00000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.435546 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3332  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation permease component-like protein  22.03 
 
 		 483 aa  53.1  0.00001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.300875  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3774  hypothetical protein  32.05 
 
 		 480 aa  53.1  0.00001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01806  Delta 1-pyrroline-5-carboxylate reductase  22.93 
 
 		 480 aa  52.8  0.00001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0684  ABC-type transport system involved in multi- copper enzyme maturation permease component-like protein  24.5 
 
 		 479 aa  52.4  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.507224 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2048  hypothetical protein  24.38 
 
 		 487 aa  51.6  0.00003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.598539  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1578  hypothetical protein  28.08 
 
 		 359 aa  50.8  0.00006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2874  ABC transporter permease protein  27.21 
 
 		 321 aa  47  0.0006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.77039  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3358  putative ABC-2 type transport system permease protein  25.52 
 
 		 301 aa  43.9  0.006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0148865  normal  0.0936569 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>