60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_1745 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011883  Ddes_1745  protein of unknown function DUF343  100 
 
 
73 aa  148  2e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3093  hypothetical protein  57.63 
 
 
70 aa  63.5  0.0000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2304  hypothetical protein  56.45 
 
 
87 aa  60.8  0.000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.274836 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3220  protein of unknown function DUF343  48.53 
 
 
65 aa  60.8  0.000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0718  protein of unknown function DUF343  47.89 
 
 
67 aa  58.5  0.00000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.021704  normal  0.638292 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2346  hypothetical protein  50.94 
 
 
62 aa  57  0.00000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3227  hypothetical protein  52.83 
 
 
56 aa  56.2  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2647  protein of unknown function DUF343  51.72 
 
 
66 aa  56.6  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3635  hypothetical protein  45.28 
 
 
57 aa  55.1  0.0000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.566085  normal  0.472948 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0488  protein of unknown function DUF343  47.17 
 
 
61 aa  52  0.000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2257  hypothetical protein  49.02 
 
 
58 aa  52  0.000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.523879  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0650  protein of unknown function DUF343  43.1 
 
 
60 aa  49.7  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0490  hypothetical protein  43.1 
 
 
60 aa  49.7  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.768534  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0815  protein of unknown function DUF343  42.31 
 
 
58 aa  49.3  0.00002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000232843  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1914  hypothetical protein  47.06 
 
 
58 aa  48.5  0.00003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.354879  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1506  tetraacyldisaccharide-1-P 4'-kinase  52 
 
 
62 aa  48.1  0.00004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.225187  normal  0.166181 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0634  hypothetical protein  49.02 
 
 
70 aa  47.8  0.00005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.797017  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1262  hypothetical protein  49.06 
 
 
65 aa  47.8  0.00005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2677  hypothetical protein  47.06 
 
 
59 aa  47  0.00008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.270272  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3029  hypothetical protein  42.37 
 
 
58 aa  47  0.00009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1388  hypothetical protein  54.9 
 
 
57 aa  47  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.341245 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7603  protein of unknown function DUF343  50.98 
 
 
57 aa  45.8  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.737133 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4062  protein of unknown function DUF343  51.02 
 
 
58 aa  45.4  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.167292  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3207  hypothetical protein  44.9 
 
 
58 aa  45.1  0.0003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00232767  normal  0.26354 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1426  hypothetical protein  46 
 
 
56 aa  45.1  0.0004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.425865  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0910  hypothetical protein  43.14 
 
 
59 aa  44.7  0.0005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2575  hypothetical protein  46 
 
 
70 aa  43.5  0.0009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.745341  normal  0.0666419 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0752  hypothetical protein  44.9 
 
 
65 aa  42.7  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0750  hypothetical protein  41.27 
 
 
64 aa  43.1  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.112207  normal  0.419915 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3214  protein of unknown function DUF343  46.94 
 
 
63 aa  42.4  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0757  hypothetical protein  46.94 
 
 
57 aa  42.4  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.154426  normal  0.127771 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0592  hypothetical protein  46.94 
 
 
67 aa  42.4  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.000872604  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0899  hypothetical protein  38.18 
 
 
61 aa  42  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0245559 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5877  hypothetical protein  39.68 
 
 
64 aa  42  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.140063  normal  0.412867 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2464  hypothetical protein  46.94 
 
 
67 aa  42  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00142603 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0537  hypothetical protein  46.94 
 
 
67 aa  42  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.199917  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3197  protein of unknown function DUF343  46.94 
 
 
67 aa  42  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.333049 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2789  protein of unknown function DUF343  44 
 
 
56 aa  41.6  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2608  hypothetical protein  42.59 
 
 
56 aa  42  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0375272  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0765  hypothetical protein  46.94 
 
 
67 aa  42  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0534  hypothetical protein  46.94 
 
 
69 aa  42  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00103839  hitchhiker  0.00000763093 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2594  hypothetical protein  46.94 
 
 
67 aa  42  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.129771  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2152  hypothetical protein  44.9 
 
 
68 aa  41.6  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0445417  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2274  hypothetical protein  44.9 
 
 
68 aa  41.6  0.004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00194763  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1082  tetraacyldisaccharide-1-P 4-kinase  44.9 
 
 
68 aa  41.6  0.004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00991384  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0741  hypothetical protein  44.9 
 
 
68 aa  41.2  0.004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0570  hypothetical protein  44.9 
 
 
68 aa  41.6  0.004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000126228  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1047  hypothetical protein  44.9 
 
 
68 aa  41.6  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.0000350171  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0926  hypothetical protein  44.9 
 
 
68 aa  41.6  0.004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0134205  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0929  hypothetical protein  44.9 
 
 
68 aa  41.6  0.004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0283  hypothetical protein  43.14 
 
 
60 aa  41.6  0.004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1934  hypothetical protein  38.1 
 
 
64 aa  41.2  0.005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.109309  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2546  hypothetical protein  38.1 
 
 
64 aa  41.2  0.005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0641671  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2570  hypothetical protein  38.1 
 
 
64 aa  41.2  0.005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.522503  normal  0.285708 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2694  protein of unknown function DUF343  40.74 
 
 
56 aa  40.8  0.006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4297  protein of unknown function DUF343  40.35 
 
 
73 aa  40.8  0.007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.925532  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2531  hypothetical protein  42.86 
 
 
62 aa  40.4  0.007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0793629 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2808  protein of unknown function DUF343  42.86 
 
 
62 aa  40.4  0.008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.106746  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2402  protein of unknown function DUF343  42.86 
 
 
62 aa  40.4  0.008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.213254  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4499  protein of unknown function DUF343  47.27 
 
 
86 aa  40  0.01  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>