34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_0389 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011883  Ddes_0389  putative chemotaxis phosphatase, CheZ  100 
 
 		 211 aa  425  1e-118  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.0037983  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2148  chemotaxis protein CheZ, putative  48.8 
 
 		 242 aa  178  4.999999999999999e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.992761  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1621  putative chemotaxis phosphatase, CheZ  46.73 
 
 		 248 aa  176  3e-43  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0261  putative chemotaxis phosphatase, CheZ  43.26 
 
 		 248 aa  167  1e-40  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.046719 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0481  putative chemotaxis phosphatase, CheZ  43.4 
 
 		 242 aa  157  9e-38  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06211  chemotaxis phosphatase CheZ  31.29 
 
 		 208 aa  62.4  0.000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.695232  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00955  chemotaxis phosphatase CheZ  31.29 
 
 		 208 aa  62.4  0.000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.417483  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0211  hypothetical protein  31.18 
 
 		 253 aa  57  0.0000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.730473  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2288  chemotaxis protein CheZ  26.55 
 
 		 239 aa  53.1  0.000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1652  chemotaxis protein CheZ  24.77 
 
 		 239 aa  53.1  0.000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00206146  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0475  chemotaxis phosphatase, CheZ  25.76 
 
 		 261 aa  52.8  0.000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.51709  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0387  putative chemotaxis phosphatase, CheZ  28.48 
 
 		 196 aa  51.6  0.000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03142  hypothetical protein  28.57 
 
 		 246 aa  50.4  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2836  hypothetical protein  30.51 
 
 		 259 aa  50.1  0.00003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2224  putative chemotaxis phosphatase, CheZ  31.06 
 
 		 197 aa  47.4  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.659574  normal  0.116449 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002834  chemotaxis response - phosphatase CheZ  25.12 
 
 		 246 aa  47.4  0.0002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00740148  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1565  chemotaxis phosphatase, CheZ  26.67 
 
 		 262 aa  46.2  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.058559  normal  0.0518536 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0749  chemotaxis phosphatase, CheZ  28.87 
 
 		 217 aa  46.2  0.0004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45610  chemotaxis protein CheZ  25.65 
 
 		 262 aa  45.8  0.0004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0109918  normal  0.241564 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1735  hypothetical protein  30.77 
 
 		 254 aa  45.8  0.0005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.9552  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3212  hypothetical protein  32.32 
 
 		 256 aa  45.1  0.0008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0889  hypothetical protein  34.69 
 
 		 399 aa  45.1  0.0009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.135602 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0849  hypothetical protein  34.69 
 
 		 399 aa  45.1  0.0009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00517849 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0815  hypothetical protein  34.69 
 
 		 435 aa  45.1  0.0009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.872238  normal  0.105867 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3665  chemotaxis phosphatase, CheZ  26.46 
 
 		 262 aa  44.7  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00761761  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0192  putative chemotaxis phosphatase, CheZ  26.55 
 
 		 186 aa  44.3  0.001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00264382  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2803  chemotaxis phosphatase, CheZ  27.07 
 
 		 262 aa  44.3  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.402968  normal  0.192895 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1860  putative chemotaxis phosphatase, CheZ  31.29 
 
 		 201 aa  43.9  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.339469  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2571  hypothetical protein  32.98 
 
 		 259 aa  44.3  0.002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.352522  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0987  chemotaxis phosphatase, CheZ  24.78 
 
 		 253 aa  42.7  0.004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.413841 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3870  chemotaxis protein CheZ  28.7 
 
 		 262 aa  42.4  0.005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.158166  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4931  hypothetical protein  32.35 
 
 		 288 aa  42.4  0.005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.154084  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3105  putative chemotaxis phosphatase, CheZ  33.65 
 
 		 241 aa  42  0.007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.163127  normal  0.170192 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2879  hypothetical protein  33.65 
 
 		 241 aa  42  0.007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.364633  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>