23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_2960 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_2960  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 1154 aa  2334    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0470  TPR repeat-containing protein  45.5 
 
 		 1070 aa  721    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.524501  normal  0.148928 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1325  TPR repeat-containing protein  44.14 
 
 		 1122 aa  728    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00379611 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3225  Tetratricopeptide domain protein  35.39 
 
 		 1031 aa  491  1e-137  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1304  hypothetical protein  35.73 
 
 		 982 aa  481  1e-134  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1506  tetratricopeptide TPR_4  25.71 
 
 		 729 aa  55.1  0.000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1517  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  20.31 
 
 		 1000 aa  52.4  0.00005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.261003  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1052  TPR repeat-containing protein  26.53 
 
 		 1019 aa  52.4  0.00006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.273667 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0425  TPR repeat-containing protein  26.72 
 
 		 566 aa  51.2  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1778  TPR domain-containing protein  26.72 
 
 		 425 aa  50.1  0.0003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.128909  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0201  TPR repeat-containing protein  29.73 
 
 		 275 aa  49.7  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000441439  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4842  tol-pal system protein YbgF  26.14 
 
 		 341 aa  47.8  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.29028  normal  0.989146 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5310  tol-pal system protein YbgF  26.14 
 
 		 341 aa  48.1  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5489  tol-pal system protein YbgF  26.97 
 
 		 304 aa  47.4  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.39153  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3308  Tetratricopeptide domain protein  25.42 
 
 		 714 aa  46.2  0.003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3090  TPR repeat-containing protein  25.77 
 
 		 304 aa  46.2  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0758398  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0410  hypothetical protein  35.38 
 
 		 222 aa  46.6  0.003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000196847  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0147  TPR repeat-containing protein  30.53 
 
 		 257 aa  46.2  0.003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK02410  general transcriptional repressor, putative  24.34 
 
 		 1101 aa  46.6  0.003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0281  tol-pal system protein YbgF  26.97 
 
 		 313 aa  45.4  0.007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.433103  normal  0.0147653 
 
 
-
 
NC_004310  BR1693  hypothetical protein  25.44 
 
 		 488 aa  45.1  0.008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1637  TPR repeat-containing molluscan rhodopsin  25.44 
 
 		 488 aa  45.1  0.008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1463  TPR repeat-containing protein  23.7 
 
 		 329 aa  44.7  0.01  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000951693  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>