33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_2415 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007519  Dde_2415  hypothetical protein  100 
 
 
656 aa  1353    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.174354  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3113  protein of unknown function DUF115  46 
 
 
589 aa  506  9.999999999999999e-143  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00213149 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0451  hypothetical protein  23.18 
 
 
623 aa  108  2e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2235  hypothetical protein  21.57 
 
 
648 aa  98.2  5e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17040  hypothetical protein  21.13 
 
 
618 aa  85.5  0.000000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0762  hypothetical protein  26.24 
 
 
629 aa  84.3  0.000000000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.211386 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1315  hypothetical protein  21.44 
 
 
578 aa  78.2  0.0000000000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1780  hypothetical protein  23.16 
 
 
626 aa  78.2  0.0000000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1917  protein of unknown function DUF115  24.22 
 
 
616 aa  77  0.0000000000009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2233  hypothetical protein  23.24 
 
 
470 aa  70.1  0.0000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0199  hypothetical protein  21.79 
 
 
671 aa  63.5  0.00000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1525  motility accessory factor  21.31 
 
 
635 aa  62  0.00000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1522  motility accessory factor  21.32 
 
 
653 aa  62  0.00000004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.199304  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1336  hypothetical protein  22.67 
 
 
431 aa  57  0.000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1335  motility accessory factor  22.2 
 
 
604 aa  54.7  0.000005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0373  motility accessory factor  19.28 
 
 
629 aa  53.9  0.000008  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0370  motility accessory factor  23.46 
 
 
605 aa  53.5  0.00001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0167  motility accessory factor  27.44 
 
 
578 aa  52.8  0.00002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.0000316837  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0376  motility accessory factor  23.87 
 
 
647 aa  51.6  0.00004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1530  motility accessory factor  23.15 
 
 
607 aa  52  0.00004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.459783  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1638  motility accessory factor  20.57 
 
 
661 aa  51.2  0.00006  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1337  PseE  23.82 
 
 
632 aa  51.2  0.00006  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0374  motility accessory factor  21.13 
 
 
649 aa  50.8  0.00007  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0168  motility accessory factor  23.66 
 
 
638 aa  50.4  0.0001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  decreased coverage  0.0000847186  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3220  protein of unknown function DUF115  23.9 
 
 
758 aa  49.3  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1524  motility accessory factor  20.15 
 
 
638 aa  49.7  0.0002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.710571  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0629  protein of unknown function DUF115  23.9 
 
 
645 aa  49.3  0.0002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.822878  hitchhiker  0.000000292404 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2630  hypothetical protein  20.83 
 
 
821 aa  48.9  0.0003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.227202  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0566  motility accessory factor  25.97 
 
 
666 aa  48.5  0.0004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1523  motility accessory factor  21.68 
 
 
626 aa  45.4  0.003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3115  hypothetical protein  24.67 
 
 
435 aa  45.4  0.003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2971  hypothetical protein  24.67 
 
 
435 aa  45.4  0.003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0669  protein of unknown function DUF115  22.49 
 
 
891 aa  45.1  0.004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.700262  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>