264 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_1843 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007519  Dde_1843  Iron-sulfur cluster binding protein  100 
 
 
480 aa  996    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000340116  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0396  iron-sulfur cluster binding protein  74.58 
 
 
475 aa  750    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0924401 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1376  iron-sulfur cluster binding protein  73.75 
 
 
475 aa  731    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.204617  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1764  Iron-sulfur cluster binding protein  56.93 
 
 
480 aa  544  1e-153  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0751  Iron-sulfur cluster binding protein  57.69 
 
 
484 aa  543  1e-153  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.214888 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43090  iron-sulfur cluster binding protein-like protein  57.36 
 
 
482 aa  535  1e-151  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4688  iron-sulfur cluster-binding protein  56.71 
 
 
492 aa  529  1e-149  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1716  iron-sulfur cluster binding protein  56.84 
 
 
479 aa  530  1e-149  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1412  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  55.21 
 
 
484 aa  526  1e-148  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0326413  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0365  iron-sulfur cluster binding protein  59.26 
 
 
480 aa  521  1e-146  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.146775  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1420  iron-sulfur cluster binding protein  55.89 
 
 
486 aa  518  1.0000000000000001e-145  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0199  Iron-sulfur cluster binding protein  54.39 
 
 
477 aa  503  1e-141  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5897  iron-sulfur cluster binding protein  54.29 
 
 
481 aa  502  1e-141  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.566043  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5446  Iron-sulfur cluster binding protein  52.02 
 
 
481 aa  499  1e-140  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.776184  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6083  Iron-sulfur cluster binding protein  52.23 
 
 
481 aa  499  1e-140  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.472054  normal  0.412867 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2805  iron-sulfur cluster binding protein  51.8 
 
 
481 aa  495  1e-139  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5376  iron-sulfur cluster binding protein  52.02 
 
 
481 aa  495  1e-139  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.75829 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2672  iron-sulfur cluster binding protein  51.38 
 
 
481 aa  492  9.999999999999999e-139  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0885  iron-sulfur cluster binding protein  43.37 
 
 
474 aa  408  1.0000000000000001e-112  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0070  iron-sulfur cluster binding protein  44.14 
 
 
479 aa  402  1e-111  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0085  iron-sulfur cluster binding protein  44.14 
 
 
479 aa  402  1e-111  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0111  iron-sulfur cluster binding protein  44.14 
 
 
479 aa  402  9.999999999999999e-111  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1453  putative iron-sulfur cluster binding protein  43.67 
 
 
471 aa  394  1e-108  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00604252  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4816  iron-sulfur cluster binding protein  45.7 
 
 
479 aa  375  1e-103  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4459  iron-sulfur cluster binding protein  42.74 
 
 
470 aa  367  1e-100  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.187768 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3165  iron-sulfur cluster binding protein  47.21 
 
 
475 aa  367  1e-100  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0817  iron-sulfur cluster binding protein  42.48 
 
 
464 aa  366  1e-100  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.244426  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0811  iron-sulfur cluster binding protein  42.62 
 
 
470 aa  365  1e-99  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.016821 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2000  iron-sulfur cluster binding protein  43.42 
 
 
481 aa  359  5e-98  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000090477  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0368  iron-sulfur cluster binding protein  39.79 
 
 
478 aa  359  7e-98  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2719  iron-sulfur cluster binding protein  42.2 
 
 
473 aa  358  9.999999999999999e-98  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3731  iron-sulfur cluster binding protein  45.66 
 
 
494 aa  358  1.9999999999999998e-97  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.210686  normal  0.445104 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19830  (4Fe-4S) cluster-containing protein  46.79 
 
 
528 aa  355  1e-96  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37070  (4Fe-4S) cluster-containing protein  42.95 
 
 
475 aa  355  1e-96  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.621566  normal  0.014795 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3260  iron-sulfur cluster binding protein  39.54 
 
 
480 aa  355  1e-96  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0890  iron-sulfur cluster binding protein  42.68 
 
 
510 aa  353  2.9999999999999997e-96  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.850775  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1095  iron-sulfur cluster binding protein  41.36 
 
 
463 aa  353  4e-96  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2957  iron-sulfur cluster-binding protein  40.17 
 
 
470 aa  352  5.9999999999999994e-96  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5227  iron-sulfur cluster binding protein  46.23 
 
 
493 aa  352  5.9999999999999994e-96  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1033  iron-sulfur cluster binding protein  45.64 
 
 
493 aa  352  7e-96  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.768116  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3244  iron-sulfur cluster binding protein  42.41 
 
 
479 aa  352  1e-95  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.968259  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3262  iron-sulfur cluster-binding protein  39.96 
 
 
470 aa  351  1e-95  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1207  Iron-sulfur cluster binding protein  38.02 
 
 
470 aa  351  1e-95  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.112405 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3562  iron-sulfur cluster binding protein  46.23 
 
 
501 aa  351  1e-95  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0176735  hitchhiker  0.00702325 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3036  iron-sulfur cluster-binding protein  39.96 
 
 
470 aa  350  2e-95  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3269  iron-sulfur cluster-binding protein  39.96 
 
 
470 aa  350  2e-95  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0716  iron-sulfur cluster binding protein  39.92 
 
 
472 aa  351  2e-95  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04080  (4Fe-4S) cluster-containing protein  43.84 
 
 
493 aa  350  3e-95  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.066804 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2281  iron-sulfur cluster binding protein  43.92 
 
 
476 aa  350  3e-95  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4767  iron-sulfur cluster binding protein  47.66 
 
 
484 aa  350  5e-95  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4386  Iron-sulfur cluster binding protein  47.66 
 
 
484 aa  350  5e-95  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.707954  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4473  iron-sulfur cluster binding protein  47.66 
 
 
484 aa  350  5e-95  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.905918 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1311  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  38.43 
 
 
470 aa  349  8e-95  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2897  hypothetical protein  41.16 
 
 
473 aa  349  8e-95  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00038131  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1754  iron-sulfur cluster binding protein  43.89 
 
 
512 aa  349  8e-95  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.258831  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1606  protein of unknown function DUF162  38.83 
 
 
469 aa  348  1e-94  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.143052  normal  0.308482 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2183  iron-sulfur cluster-binding protein  40.68 
 
 
477 aa  348  1e-94  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1430  iron-sulfur cluster binding protein  40.68 
 
 
482 aa  348  1e-94  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.461528  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0868  iron-sulfur cluster-binding protein  40.68 
 
 
477 aa  348  1e-94  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.307451  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0556  iron-sulfur cluster binding protein  40.68 
 
 
477 aa  348  1e-94  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0459  iron-sulfur cluster-binding protein  40.68 
 
 
477 aa  348  1e-94  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3103  iron-sulfur cluster binding protein  41.44 
 
 
490 aa  347  2e-94  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3703  iron-sulfur cluster binding protein  45.87 
 
 
496 aa  347  3e-94  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0892333  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1217  iron-sulfur cluster binding protein  44.16 
 
 
481 aa  347  3e-94  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.49103  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1874  iron-sulfur cluster binding protein  40.47 
 
 
482 aa  347  4e-94  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7369  iron-sulfur cluster binding protein  42.8 
 
 
470 aa  346  4e-94  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0359328  normal  0.809068 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1548  putative iron-sulfur binding protein  38.36 
 
 
471 aa  346  5e-94  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.360609  normal  0.0421236 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1463  iron-sulfur cluster binding protein  42.51 
 
 
485 aa  345  8e-94  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0261337  normal  0.617254 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1768  hypothetical protein  42.95 
 
 
490 aa  345  8.999999999999999e-94  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.215438  normal  0.0554235 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1140  hypothetical protein  38.67 
 
 
470 aa  345  1e-93  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.344454  normal  0.667086 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1934  iron-sulfur cluster binding protein  38.83 
 
 
469 aa  344  2e-93  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.628498  normal  0.020498 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2899  iron-sulfur cluster binding protein  42.36 
 
 
478 aa  345  2e-93  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.154798  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05120  (4Fe-4S) cluster-containing protein  48.31 
 
 
545 aa  343  2.9999999999999997e-93  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2925  iron-sulfur cluster binding protein  41.54 
 
 
471 aa  343  4e-93  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.117393  normal  0.697669 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2079  iron-sulfur cluster binding protein  40.25 
 
 
482 aa  342  5.999999999999999e-93  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.293755  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2584  protein of unknown function DUF162  38.16 
 
 
471 aa  343  5.999999999999999e-93  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.31363  hitchhiker  0.000668194 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5436  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  38.46 
 
 
470 aa  342  7e-93  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0384157  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2147  hypothetical protein  38.64 
 
 
470 aa  342  7e-93  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.68355  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5947  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  38.64 
 
 
470 aa  342  8e-93  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.127817  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2130  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  38.64 
 
 
470 aa  342  8e-93  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.350099  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2451  Iron-sulfur cluster binding protein  42.35 
 
 
498 aa  342  1e-92  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.131234  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2710  iron-sulfur cluster binding protein  42.23 
 
 
486 aa  340  2.9999999999999998e-92  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.105822 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3605  Iron-sulfur cluster binding protein  40.12 
 
 
472 aa  339  5.9999999999999996e-92  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2167  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  38.67 
 
 
470 aa  339  7e-92  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.928776  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2040  hypothetical protein  38.28 
 
 
470 aa  339  8e-92  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0339  iron-sulfur cluster binding protein  43.23 
 
 
475 aa  339  8e-92  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00263  predicted amino acid dehydrogenase with NAD(P)-binding domain and ferridoxin-like domain  43.57 
 
 
475 aa  338  9.999999999999999e-92  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3298  iron-sulfur cluster binding protein  43.57 
 
 
475 aa  338  9.999999999999999e-92  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00267  hypothetical protein  43.57 
 
 
475 aa  338  9.999999999999999e-92  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0932  protein of unknown function DUF162  39.65 
 
 
458 aa  338  9.999999999999999e-92  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3315  iron-sulfur cluster binding protein  43.57 
 
 
475 aa  338  9.999999999999999e-92  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0360  iron-sulfur cluster binding protein  43.57 
 
 
475 aa  337  1.9999999999999998e-91  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.400129 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0360  iron-sulfur cluster binding protein  43.57 
 
 
475 aa  337  1.9999999999999998e-91  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.53651  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0322  iron-sulfur cluster binding protein  43.57 
 
 
475 aa  337  1.9999999999999998e-91  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1612  putative iron-sulfur binding protein  37.92 
 
 
469 aa  337  2.9999999999999997e-91  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1463  hypothetical protein  37.82 
 
 
470 aa  337  3.9999999999999995e-91  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.57968  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3037  protein of unknown function DUF162  40.9 
 
 
467 aa  336  5e-91  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.779274  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0670  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  38.17 
 
 
480 aa  336  5e-91  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.88512  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2678  iron-sulfur cluster binding protein  43.26 
 
 
473 aa  336  5.999999999999999e-91  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1871  iron-sulfur cluster binding protein  37.37 
 
 
522 aa  336  5.999999999999999e-91  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.287018  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>