45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_2696 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012880  Dd703_2696  regulator of competence-specific genes  100 
 
 		 208 aa  427  1e-119  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000067417  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1211  regulator of competence-specific genes  70.71 
 
 		 209 aa  297  6e-80  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000136601  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2547  regulator of competence-specific genes  66.02 
 
 		 206 aa  286  1e-76  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.000620558  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2856  regulator of competence-specific genes  65.53 
 
 		 206 aa  281  6.000000000000001e-75  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0000863171  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3201  hypothetical protein  52.76 
 
 		 211 aa  207  8e-53  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000064968  hitchhiker  0.00612838 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2628  regulator of competence-specific genes  52.76 
 
 		 211 aa  207  8e-53  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000000928932  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2539  DNA transformation protein tfoX  52.76 
 
 		 211 aa  207  8e-53  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000195264  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1756  regulator of competence-specific genes  48.26 
 
 		 219 aa  194  8.000000000000001e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000590312  hitchhiker  0.0000249336 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1471  regulator of competence-specific genes  44.71 
 
 		 208 aa  178  4e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000187987  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1030  TfoX family protein  45.69 
 
 		 201 aa  170  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000000638519  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1135  TfoX family protein  45.69 
 
 		 201 aa  170  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0564701  normal  0.981873 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1181  TfoX family protein  45.69 
 
 		 201 aa  170  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.249194  normal  0.494674 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1113  TfoX family protein  45.69 
 
 		 201 aa  170  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00655233  hitchhiker  0.000555107 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1147  TfoX family protein  45.69 
 
 		 201 aa  170  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.303148  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1068  TfoX family protein  45.18 
 
 		 209 aa  167  1e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000144107  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2159  TfoX family protein  45.18 
 
 		 209 aa  166  2e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000143241  normal  0.451422 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2637  regulator of competence-specific genes  45.18 
 
 		 209 aa  166  2e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00582565  hitchhiker  0.000000482749 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1124  TfoX family protein  45.18 
 
 		 209 aa  166  2e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000094765  normal  0.380229 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00970  hypothetical protein  45.18 
 
 		 209 aa  166  2e-40  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000688807  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2684  regulator of competence-specific genes  45.18 
 
 		 209 aa  166  2e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000124441  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1075  TfoX family protein  45.18 
 
 		 209 aa  166  2e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.00000000000055454  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00963  hypothetical protein  45.18 
 
 		 209 aa  166  2e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000316322  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01580  hypothetical protein  37.5 
 
 		 196 aa  131  6.999999999999999e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003942  DNA transformation protein TfoX  37.02 
 
 		 187 aa  128  6e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1325  hypothetical protein  36.72 
 
 		 195 aa  116  1.9999999999999998e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0134682  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1982  putative DNA transformation protein TfoX  36.27 
 
 		 195 aa  115  3.9999999999999997e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.42956  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2355  TfoX family protein  46.08 
 
 		 114 aa  91.7  7e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000106232  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02628  hypothetical protein  32 
 
 		 195 aa  81.6  0.000000000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0723  hypothetical protein  28.73 
 
 		 202 aa  78.2  0.00000000000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003753  DNA transformation protein TfoX  28.07 
 
 		 195 aa  75.5  0.0000000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1715  DNA transformation protein  31.65 
 
 		 238 aa  67.8  0.0000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.00000000335694  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3473  regulator of competence-specific genes  23.79 
 
 		 217 aa  60.1  0.00000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0302  hypothetical protein  34.57 
 
 		 84 aa  59.7  0.00000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.516262  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1766  TfoX domain-containing protein  31.78 
 
 		 108 aa  59.3  0.00000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2034  hypothetical protein  33.33 
 
 		 91 aa  56.2  0.0000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.81797  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1931  TfoX domain protein  34.57 
 
 		 84 aa  52  0.000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4493  hypothetical protein  30.49 
 
 		 126 aa  47.4  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2987  TfoX-like  38.98 
 
 		 133 aa  47  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0478922 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1864  TfoX-like protein  29.73 
 
 		 108 aa  46.2  0.0003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.726376  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1698  TfoX domain protein  27.85 
 
 		 128 aa  45.8  0.0005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.263995  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2753  TfoX domain protein  30.95 
 
 		 168 aa  45.8  0.0005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.150667  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0665  TfoX-like  32.74 
 
 		 171 aa  45.1  0.0007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.917152  normal  0.475374 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3336  TfoX domain protein  29.29 
 
 		 152 aa  44.3  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3659  TfoX domain protein  29.29 
 
 		 155 aa  44.3  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1480  TfoX domain-containing protein  23.86 
 
 		 105 aa  41.2  0.01  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.322278  hitchhiker  0.00610766 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>