19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_3599 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012912  Dd1591_3599  Hemolysin-type calcium-binding region  100 
 
 
585 aa  1176    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2323  Hemolysin-type calcium-binding region  34.29 
 
 
704 aa  248  2e-64  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8279  Hemolysin-type calcium-binding region  25.36 
 
 
509 aa  55.8  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.325429  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4058  hemolysin-type calcium-binding region  30.56 
 
 
1072 aa  52  0.00003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.402749  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2909  Serralysin  48.28 
 
 
474 aa  50.1  0.0001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0791  heme peroxidase  26.01 
 
 
2950 aa  48.5  0.0004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1663  Hemolysin-type calcium-binding region  28.99 
 
 
824 aa  47.8  0.0006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.157908  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4306  hemolysin-type calcium-binding region  25.22 
 
 
682 aa  46.2  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0651981 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0612  hemolysin-type calcium-binding region  25.62 
 
 
12741 aa  46.2  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1553  Serralysin  44.83 
 
 
476 aa  45.4  0.003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2206  Cadherin  25.71 
 
 
928 aa  45.4  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.802036  normal 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3695  proprotein convertase P  26.13 
 
 
2911 aa  45.1  0.004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.523637 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1349  hemolysin-type calcium-binding region  46.43 
 
 
744 aa  45.1  0.004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.156878  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2387  serralysin  54.55 
 
 
490 aa  45.1  0.004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.590992  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3615  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  36.84 
 
 
868 aa  44.7  0.004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.705484  normal  0.0425486 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0514  RTX toxins and related Ca2+-binding protein  24.07 
 
 
1279 aa  44.7  0.005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2425  hypothetical protein  39.33 
 
 
559 aa  43.9  0.008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.306646  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4753  Hemolysin-type calcium-binding region  31.08 
 
 
724 aa  43.9  0.009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.321529  normal  0.052918 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2786  hemolysin-type calcium-binding region  38.03 
 
 
518 aa  43.5  0.01  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.248121  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>