263 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_1785 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012880  Dd703_1750  L-lactate transport  89.34 
 
 
516 aa  917    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0680792  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1785  L-lactate transport  100 
 
 
516 aa  1007    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2676  L-lactate transport  78.53 
 
 
517 aa  751    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0307  L-lactate permease  46.58 
 
 
510 aa  403  1e-111  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.284912  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0302  L-lactate permease  45.36 
 
 
507 aa  394  1e-108  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0970  L-lactate transport  44.27 
 
 
506 aa  372  1e-101  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.486731  normal  0.0114366 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0381  L-lactate transport  44.27 
 
 
506 aa  367  1e-100  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0849809 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1074  L-lactate transport  44.47 
 
 
506 aa  363  3e-99  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0618  L-lactate permease  41.03 
 
 
500 aa  339  7e-92  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1719  L-lactate permease  40.2 
 
 
507 aa  334  3e-90  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.533287 
 
 
-
 
NC_002950  PG1340  L-lactate permease  38.34 
 
 
516 aa  306  5.0000000000000004e-82  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3408  L-lactate transport  36.08 
 
 
552 aa  284  3.0000000000000004e-75  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.432982  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4736  L-lactate transport  32.89 
 
 
556 aa  260  4e-68  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4735  L-lactate transport  32.31 
 
 
556 aa  260  5.0000000000000005e-68  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.168353  hitchhiker  0.00377155 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4601  L-lactate transport  32.31 
 
 
556 aa  260  5.0000000000000005e-68  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0523719  normal  0.0421821 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5610  L-lactate permease  32.14 
 
 
553 aa  258  2e-67  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000380023  hitchhiker  2.4648700000000003e-18 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0696  L-lactate transport  32.89 
 
 
556 aa  258  2e-67  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.91775  hitchhiker  0.00000653044 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5349  L-lactate permease  32.33 
 
 
553 aa  256  8e-67  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000100445  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0648  L-lactate permease  33.2 
 
 
539 aa  255  2.0000000000000002e-66  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000119534  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3763  L-lactate permease  31.14 
 
 
553 aa  254  3e-66  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0623058  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0739  L-lactate permease  33.2 
 
 
539 aa  254  3e-66  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000128008  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4690  L-lactate permease  33.2 
 
 
539 aa  253  5.000000000000001e-66  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000129192  hitchhiker  1.76852e-23 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63080  L-lactate permease  34.07 
 
 
560 aa  252  1e-65  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0133297  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5400  L-lactate permease  31.95 
 
 
552 aa  252  1e-65  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000507113  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1276  L-lactate transport  34.86 
 
 
557 aa  251  2e-65  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5342  L-lactate permease  32.14 
 
 
552 aa  250  4e-65  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000594028  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5077  L-lactate permease  31.77 
 
 
552 aa  250  5e-65  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000746346  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4909  L-lactate permease  31.77 
 
 
552 aa  250  5e-65  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000494573  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4924  L-lactate permease  31.77 
 
 
552 aa  250  5e-65  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000193163  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5464  L-lactate permease  31.77 
 
 
552 aa  250  5e-65  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000341601  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0521  L-lactate permease  33.2 
 
 
539 aa  249  6e-65  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  1.74068e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0666  L-lactate permease  33.2 
 
 
539 aa  249  6e-65  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.48305e-60 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0678  L-lactate permease  32.82 
 
 
539 aa  249  1e-64  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000280788  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5019  L-lactate transport  31.38 
 
 
553 aa  249  1e-64  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000505988  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5317  L-lactate permease  31.58 
 
 
552 aa  248  1e-64  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.99986e-40 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02843  glycolate transporter  32.58 
 
 
560 aa  248  2e-64  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0149329  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3147  glycolate transporter  32.58 
 
 
560 aa  248  2e-64  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0521  L-lactate permease  33.01 
 
 
539 aa  248  2e-64  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000214943  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02793  hypothetical protein  32.58 
 
 
560 aa  248  2e-64  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0141341  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0726  glycolate transporter  32.58 
 
 
560 aa  248  2e-64  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0087  L-lactate permease  35.12 
 
 
560 aa  248  2e-64  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3252  glycolate transporter  32.58 
 
 
560 aa  248  2e-64  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43260  L-lactate permease, Lldp  34.02 
 
 
561 aa  248  3e-64  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0650163  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3434  glycolate transporter  32.58 
 
 
560 aa  248  3e-64  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0753  L-lactate permease  32.71 
 
 
564 aa  246  4.9999999999999997e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.226744 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3406  L-lactate transport  35.44 
 
 
554 aa  246  4.9999999999999997e-64  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000381383  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0722  L-lactate transport  32.58 
 
 
560 aa  246  9e-64  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0827  L-lactate permease  33.66 
 
 
545 aa  246  9.999999999999999e-64  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0527  L-lactate permease  32.44 
 
 
539 aa  245  1.9999999999999999e-63  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000130016  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0072  L-lactate permease  35.12 
 
 
565 aa  244  3e-63  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3939  L-lactate transport  34.82 
 
 
515 aa  244  3e-63  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2301  L-lactate transport  34.03 
 
 
561 aa  244  3e-63  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.422272  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0113  L-lactate permease  35.12 
 
 
560 aa  244  3e-63  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.610577  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2303  L-lactate transport  32.92 
 
 
592 aa  244  3.9999999999999997e-63  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.922577  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0524  L-lactate transport  32.43 
 
 
539 aa  243  9e-63  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000690012  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4078  L-lactate permease  32.56 
 
 
551 aa  242  9e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0577  L-lactate permease  32.38 
 
 
539 aa  242  1e-62  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000954326  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4016  L-lactate permease  32.56 
 
 
551 aa  242  1e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0610  L-lactate permease  32.38 
 
 
539 aa  242  1e-62  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000298254  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3971  L-lactate permease  32.56 
 
 
551 aa  242  1e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.737729 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3893  L-lactate permease  32.56 
 
 
551 aa  242  1e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5490  L-lactate permease  33.15 
 
 
557 aa  241  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2190  L-lactate transport  31.3 
 
 
576 aa  238  2e-61  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.330322  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2077  lactate permease family protein  30.35 
 
 
573 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.407091  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43070  L-lactate permease  30.94 
 
 
562 aa  234  2.0000000000000002e-60  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.357177  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6084  L-lactate transporter  31.85 
 
 
570 aa  234  3e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.592385  normal  0.721141 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5445  L-lactate permease  31.16 
 
 
569 aa  234  4.0000000000000004e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.654018  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2362  L-lactate transport  33.27 
 
 
552 aa  233  6e-60  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5295  L-lactate transport  32.41 
 
 
552 aa  233  8.000000000000001e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0106  L-lactate transport  30.77 
 
 
543 aa  232  1e-59  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.636834  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0132  L-lactate permease  32.95 
 
 
551 aa  231  3e-59  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2170  L-lactate transport  30.36 
 
 
545 aa  230  6e-59  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.882764  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0394  L-lactate transport  32.32 
 
 
558 aa  229  6e-59  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3909  L-lactate permease  32.5 
 
 
551 aa  229  1e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0564  L-lactate transport  31.93 
 
 
575 aa  228  2e-58  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.374965  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2806  L-lactate transport  32.96 
 
 
566 aa  227  3e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0102  L-lactate transport  32.76 
 
 
551 aa  226  9e-58  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3815  L-lactate permease  32.76 
 
 
551 aa  226  9e-58  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5796  L-lactate transport  34.45 
 
 
553 aa  226  9e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.325715 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0105  L-lactate permease  32.76 
 
 
551 aa  226  9e-58  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1455  L-lactate permease  34.35 
 
 
551 aa  226  1e-57  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.24148  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5896  glycolate transporter  31.52 
 
 
566 aa  226  1e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0963775  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2673  L-lactate transport  32.59 
 
 
566 aa  225  1e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.750265  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03461  L-lactate permease  32.56 
 
 
551 aa  225  2e-57  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4029  L-lactate permease  32.56 
 
 
551 aa  225  2e-57  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03412  hypothetical protein  32.56 
 
 
551 aa  225  2e-57  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4350  L-lactate transport  33.55 
 
 
561 aa  224  2e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.807127  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3940  L-lactate permease  32.56 
 
 
551 aa  225  2e-57  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4107  L-lactate permease  32.56 
 
 
551 aa  225  2e-57  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4976  L-lactate permease  32.56 
 
 
551 aa  225  2e-57  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1121  L-lactate transport  31.91 
 
 
545 aa  224  3e-57  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.155911 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2129  L-lactate transport  30.54 
 
 
551 aa  224  4e-57  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4693  L-lactate transport  32.54 
 
 
589 aa  223  4.9999999999999996e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.880222  normal  0.0242756 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5225  L-lactate transport  30.29 
 
 
563 aa  223  7e-57  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1035  L-lactate transport  30.29 
 
 
563 aa  223  7e-57  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4723  L-lactate transport  33.02 
 
 
553 aa  223  7e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2529  L-lactate transport  31.09 
 
 
540 aa  223  7e-57  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3344  L-lactate permease  30.3 
 
 
560 aa  223  8e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.542026  normal  0.656646 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0490  L-lactate transport  31.52 
 
 
541 aa  223  9e-57  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0467  lactate permease (LctP) family protein  34.44 
 
 
548 aa  220  3.9999999999999997e-56  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0000751768  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>