30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_1725 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012912  Dd1591_1725  putative lipoprotein  100 
 
 
102 aa  213  7e-55  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0939304  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1692  putative lipoprotein  61.76 
 
 
98 aa  129  1.0000000000000001e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.155098  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2379  putative lipoprotein  56.86 
 
 
105 aa  118  3e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.163248  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2663  hypothetical protein  55.88 
 
 
105 aa  116  7.999999999999999e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0170256  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1771  putative lipoprotein  51.92 
 
 
105 aa  108  3e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0555699  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2556  putative lipoprotein  51.92 
 
 
105 aa  108  3e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0857422  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1879  hypothetical protein  51.92 
 
 
104 aa  108  3e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.116549  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2217  putative lipoprotein  45.54 
 
 
100 aa  101  4e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000479557 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1809  lysozyme inhibitor  42.86 
 
 
122 aa  84  7e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0953992  hitchhiker  0.00103718 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1544  lysozyme inhibitor  40 
 
 
107 aa  80.1  0.000000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.412708  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1617  lysozyme inhibitor  40 
 
 
107 aa  80.1  0.000000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.26226  normal  0.640497 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1896  lysozyme inhibitor  40 
 
 
107 aa  80.1  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.537377  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1727  lysozyme inhibitor  40 
 
 
109 aa  79.7  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0360001  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1557  lysozyme inhibitor  40 
 
 
109 aa  79.7  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.833119 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2351  lysozyme inhibitor  45.71 
 
 
107 aa  77.8  0.00000000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0205035  normal  0.919705 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1990  lysozyme inhibitor  44.76 
 
 
107 aa  77.4  0.00000000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00364612 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1715  lysozyme inhibitor  44.76 
 
 
107 aa  77.4  0.00000000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.19796  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2001  putative lipoprotein  44.76 
 
 
107 aa  77.4  0.00000000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000221904  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01609  predicted lipoprotein  44.76 
 
 
109 aa  77  0.00000000000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01599  hypothetical protein  44.76 
 
 
109 aa  77  0.00000000000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1560  lysozyme inhibitor  42.86 
 
 
109 aa  75.9  0.0000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1831  lysozyme inhibitor  42.86 
 
 
107 aa  75.9  0.0000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.927133  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1849  lysozyme inhibitor  42.86 
 
 
107 aa  75.9  0.0000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000107016  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0960  periplasmic protein  28.26 
 
 
127 aa  42.4  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0866  putative lipoprotein  28.83 
 
 
108 aa  42.4  0.002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2496  putative signal peptide protein  32.39 
 
 
151 aa  42.4  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.538855 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5010  lipoprotein  32.26 
 
 
109 aa  42  0.003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.569821 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4834  hypothetical protein  32.26 
 
 
109 aa  41.6  0.004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2453  secreted protein-like protein  41.67 
 
 
215 aa  41.6  0.004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4961  putative lipoprotein  32.26 
 
 
109 aa  41.6  0.004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>