76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_R0048 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_R0048  tRNA-Gly  100 
 
 		 75 bp  149  1.0000000000000001e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_R0005  tRNA-Gly  92.86 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0096  tRNA-Gly  88 
 
 		 75 bp  77.8  0.0000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000000621353  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0003  tRNA-Gly  88 
 
 		 75 bp  77.8  0.0000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_R0048  tRNA-Gly  91.07 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00105769  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0055  tRNA-Gly  86.67 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000000930206  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_AR0002  tRNA-Gly  95.12 
 
 		 74 bp  65.9  0.000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_R0030  tRNA-Gly  86.84 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.121021  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_R0024  tRNA-Gly  85.33 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_4305  tRNA-Gly  92.68 
 
 		 74 bp  58  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_R0069  tRNA-Gly  92.68 
 
 		 74 bp  58  0.0000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.448955  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_R0022  tRNA-Gly  92.68 
 
 		 74 bp  58  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_R0012  tRNA-Gly  92.68 
 
 		 74 bp  58  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.286348 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_R0010  tRNA-Gly  92.68 
 
 		 74 bp  58  0.0000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_R0009  tRNA-Gly  92.68 
 
 		 74 bp  58  0.0000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.256172  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_R0049  tRNA-Gly  92.68 
 
 		 74 bp  58  0.0000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.83946 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_R0007  tRNA-Gly  92.68 
 
 		 74 bp  58  0.0000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0031  tRNA-Gly  85.29 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0675454  normal  0.168417 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0855  tRNA-Gly  85.29 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.627024  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_R0017  tRNA-Gly  85.29 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0117925 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0028  tRNA-Gly  85.29 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.706726  normal  0.167752 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0069  tRNA-Gly  85.29 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.494624  hitchhiker  0.00109102 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_R0005  tRNA-Gly  85.29 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.000151844  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_AR0025  tRNA-Gly  85.29 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.404716  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0033  tRNA-Gly  85.29 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0406258  normal  0.16961 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_R0031  tRNA-Gly  85.29 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0035  tRNA-Gly  85.29 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0213758  normal  0.172215 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_R0017  tRNA-Gly  85.29 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000592681  hitchhiker  0.00000010486 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0037  tRNA-Gly  85.29 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0254902  normal  0.171485 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0010  tRNA-Gly  84 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0010  tRNA-Gly  84 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_R0050  tRNA-Gly  96.77 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_R0044  tRNA-Gly  96.77 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000000615289  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0002  tRNA-Gly  84 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00924229  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_R0021  tRNA-Gly  96.77 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_R0032  tRNA-Gly  96.77 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0070  tRNA-Gly  84 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_R0044  tRNA-Gly  96.77 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_R0012  tRNA-Gly  96.77 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000114825  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_R0061  tRNA-Gly  88 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_R0059  tRNA-Gly  84.72 
 
 		 71 bp  48.1  0.0003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.000543343  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0014  tRNA-Gly  93.75 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000685902  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0048  tRNA-Gly  84.21 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0106217  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_R0003  tRNA-Gly  90 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.564977  normal  0.743111 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_R0003  tRNA-Gly  90 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4556  tRNA-Gly  90 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0052  tRNA-Gly  93.75 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000418671  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0037  tRNA-Gly  93.75 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000929008  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_R0002  tRNA-Gly  87.5 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.367155  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_R0020  tRNA-Gly  85.71 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000165408  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_R0028  tRNA-Gly  85.71 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000313605  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0048  tRNA-Gly  84.21 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000863907  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0039  tRNA-Gly  87.5 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.936837  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_tGly02  tRNA-Gly  85.71 
 
 		 79 bp  48.1  0.0003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_R0024  tRNA-Gly  90 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.663952  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0044  tRNA-Gly  83.82 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00255441  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0073  tRNA-Gly  83.82 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.611784  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0072  tRNA-Gly  83.82 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.827056  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_R0038  tRNA-Gly  93.55 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.236319  normal  0.351853 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_t23  tRNA-Gly  93.55 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_R0023  tRNA-Gly  100 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00977111  normal  0.654981 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_R0015  tRNA-Gly  93.55 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000000209319  hitchhiker  0.00483772 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_AR0056  tRNA-Gly  93.55 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00797069  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_AR0057  tRNA-Gly  93.55 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000972569  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_14070  tRNA-Gly  86.27 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26280  tRNA-Gly  84 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.15189 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_R0043  tRNA-Gly  100 
 
 		 71 bp  46.1  0.001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.11456  normal  0.782815 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0054  tRNA-Gly  82.67 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_R0040  tRNA-Gly  100 
 
 		 71 bp  46.1  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.697667  normal  0.123512 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_R0019  tRNA-Gly  93.55 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000527729  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_R0039  tRNA-Gly  93.55 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.169853  normal  0.361721 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0061  tRNA-Gly  88.1 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_R0059  tRNA-Gly  88.1 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_R0035  tRNA-Gly  93.33 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.801401  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_R0018  tRNA-Gly  93.33 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1317  phenylacetic acid degradation-related protein  93.33 
 
 		 519 bp  44.1  0.004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>