12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_3436 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_3436  hypothetical protein  100 
 
 		 229 aa  481  1e-135  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2553  Type II secretory pathway component PulJ-like  25 
 
 		 236 aa  65.5  0.0000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.562028  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0965  N-terminal methylation  25.21 
 
 		 227 aa  52.8  0.000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2942  fimbrial biogenesis protein  29.84 
 
 		 227 aa  47.4  0.0002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.661552 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0487  Tfp pilus assembly protein PilW-like protein  23.58 
 
 		 259 aa  45.1  0.0009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000390624  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1084  hypothetical protein  34.92 
 
 		 377 aa  45.1  0.0009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0969  type IV pilin, putative  34.92 
 
 		 377 aa  45.1  0.0009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3227  hypothetical protein  30.3 
 
 		 341 aa  43.9  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0868  Tfp pilus assembly protein PilW-like  28.79 
 
 		 429 aa  42.7  0.004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0553182  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0961  hypothetical protein  32.79 
 
 		 550 aa  42.7  0.005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.209127  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0386  hypothetical protein  25.3 
 
 		 200 aa  42.4  0.006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0859  prepilin-type cleavage/methylation-like protein  25.5 
 
 		 212 aa  42  0.008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>