27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_2089 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013173  Dbac_2089  hypothetical protein  100 
 
 
509 aa  1030    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2628  hypothetical protein  34.22 
 
 
591 aa  264  3e-69  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1025  hypothetical protein  32.16 
 
 
509 aa  258  2e-67  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00624579  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3125  hypothetical protein  32.18 
 
 
517 aa  250  4e-65  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2328  hypothetical protein  30.99 
 
 
521 aa  221  1.9999999999999999e-56  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000215933 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1642  hypothetical protein  27.47 
 
 
492 aa  164  3e-39  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.44937  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1138  hypothetical protein  24.95 
 
 
536 aa  141  1.9999999999999998e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.119813  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45100  hypothetical protein  24.41 
 
 
551 aa  109  1e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1727  hypothetical protein  24.18 
 
 
551 aa  109  2e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3838  hypothetical protein  24.43 
 
 
551 aa  106  1e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.131459  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0710  hypothetical protein  25.15 
 
 
550 aa  105  2e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2708  hypothetical protein  23.29 
 
 
550 aa  105  2e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4465  hypothetical protein  23.75 
 
 
545 aa  99.8  1e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2491  hypothetical protein  23.27 
 
 
552 aa  98.2  3e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3625  hypothetical protein  25.2 
 
 
542 aa  95.1  3e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0319  mucoidy inhibitor-like protein  21.22 
 
 
538 aa  92.8  1e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.623253  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1827  hypothetical protein  24.19 
 
 
551 aa  92.4  2e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.120538  normal  0.954748 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2776  hypothetical protein  24.91 
 
 
545 aa  92.4  2e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1732  hypothetical protein  22.42 
 
 
624 aa  88.6  3e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1091  hypothetical protein  24.62 
 
 
552 aa  88.2  4e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000808246  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2320  putative mucoidy inhibitor A  25.15 
 
 
548 aa  87.4  5e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0480516 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3422  hypothetical protein  22 
 
 
558 aa  87.4  5e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000000443439  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0431  hypothetical protein  25.32 
 
 
586 aa  82.8  0.00000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.672639 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2312  hypothetical protein  21.01 
 
 
555 aa  77.8  0.0000000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0113  hypothetical protein  29.7 
 
 
553 aa  67.4  0.0000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6526  hypothetical protein  24.28 
 
 
578 aa  54.7  0.000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.122318 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3460  hypothetical protein  22.42 
 
 
547 aa  51.6  0.00004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>