More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_0700 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013173  Dbac_0700  aspartate kinase  100 
 
 
365 aa  729    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.367067  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0504  aspartate kinase  58.48 
 
 
422 aa  268  8e-71  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0282  aspartate kinase  56.33 
 
 
434 aa  263  3e-69  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04060  aspartate kinase  54.32 
 
 
427 aa  257  3e-67  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.53456 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04740  aspartate kinase  56.5 
 
 
435 aa  254  1.0000000000000001e-66  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.230747  normal  0.356353 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5257  aspartate kinase  55.96 
 
 
421 aa  254  2.0000000000000002e-66  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.541049 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4889  aspartate kinase  55.96 
 
 
421 aa  254  2.0000000000000002e-66  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.213019  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4978  aspartate kinase  55.96 
 
 
421 aa  254  2.0000000000000002e-66  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.922524  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5504  aspartate kinase  55.6 
 
 
421 aa  253  3e-66  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0983688 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1304  aspartate kinase  55.23 
 
 
440 aa  252  6e-66  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.928497 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2702  aspartate kinase  53.06 
 
 
426 aa  252  7e-66  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0493  aspartate kinase  54.09 
 
 
421 aa  251  2e-65  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.481845  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13741  aspartate kinase  58.26 
 
 
421 aa  248  9e-65  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.500059  normal  0.255092 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08040  aspartate kinase  50.83 
 
 
427 aa  248  1e-64  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000887302  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0567  aspartate kinase  48.4 
 
 
408 aa  248  2e-64  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.475671  normal  0.793189 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2012  aspartate kinase  56.79 
 
 
422 aa  247  2e-64  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.506578  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3528  aspartate kinase  56.91 
 
 
424 aa  246  4e-64  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.305275  normal  0.739035 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1740  aspartate kinase  49.6 
 
 
586 aa  245  8e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0419  aspartate kinase  54.25 
 
 
424 aa  245  8e-64  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.736746 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0694  aspartate kinase  60.33 
 
 
421 aa  244  9.999999999999999e-64  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18571  aspartate kinase  49.2 
 
 
586 aa  245  9.999999999999999e-64  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.137718  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1167  aspartate kinase  53.14 
 
 
412 aa  244  9.999999999999999e-64  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000835866  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0043  aspartate kinase  57.32 
 
 
423 aa  243  3e-63  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18381  aspartate kinase  49.2 
 
 
586 aa  243  3e-63  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4886  aspartate kinase  54.38 
 
 
422 aa  242  7.999999999999999e-63  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36380  aspartate kinase  55.84 
 
 
420 aa  241  1e-62  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.881518 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0217  aspartate kinase  54.15 
 
 
421 aa  241  2e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0559  aspartate kinase  47.84 
 
 
424 aa  240  2.9999999999999997e-62  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0262  aspartate kinase  58.85 
 
 
422 aa  239  4e-62  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.852173 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0685  aspartate kinase  48.36 
 
 
400 aa  239  5e-62  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.985937  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2515  aspartate kinase  44.6 
 
 
406 aa  239  5.999999999999999e-62  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00310544  normal  0.299295 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3655  aspartate kinase  56.61 
 
 
387 aa  239  5.999999999999999e-62  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.190051  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9311  Aspartate kinase  57.96 
 
 
424 aa  239  6.999999999999999e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.202676  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3589  aspartate kinase  56.2 
 
 
387 aa  238  9e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3729  aspartate kinase  56.2 
 
 
387 aa  238  9e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1087  aspartate kinase  48.15 
 
 
400 aa  238  1e-61  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0265  aspartate kinase  53.96 
 
 
421 aa  238  1e-61  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.472998  hitchhiker  0.00161342 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0552  aspartate kinase  58.33 
 
 
452 aa  238  1e-61  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0689  aspartate kinase  56.97 
 
 
452 aa  238  2e-61  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1285  aspartokinase  51.78 
 
 
254 aa  237  2e-61  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0610  aspartate kinase  47.54 
 
 
400 aa  237  3e-61  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0462  aspartate kinase  58.85 
 
 
421 aa  237  3e-61  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.173887  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9025  aspartate kinase  55.47 
 
 
422 aa  236  4e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3982  aspartate kinase  58.26 
 
 
421 aa  236  4e-61  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0226  aspartate kinase  53.43 
 
 
421 aa  236  4e-61  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3243  aspartate kinase  53.88 
 
 
601 aa  236  5.0000000000000005e-61  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1639  aspartate kinase  43.25 
 
 
428 aa  236  5.0000000000000005e-61  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.0000145942  hitchhiker  0.000682871 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1461  aspartate kinase  43.25 
 
 
428 aa  235  9e-61  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000357046  hitchhiker  0.0000374387 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0111  aspartate kinase  53.04 
 
 
411 aa  235  9e-61  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.357195  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18381  aspartate kinase  48.4 
 
 
586 aa  235  1.0000000000000001e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1786  aspartate kinase  57.14 
 
 
397 aa  235  1.0000000000000001e-60  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00455709  normal  0.595189 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0669  aspartate kinase  48.56 
 
 
400 aa  235  1.0000000000000001e-60  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6573  aspartate kinase  57.61 
 
 
422 aa  234  2.0000000000000002e-60  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52580  aspartate kinase  46.56 
 
 
412 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4473  aspartate kinase  44.83 
 
 
411 aa  233  3e-60  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.246043 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1442  aspartate kinase  44.83 
 
 
411 aa  233  3e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0731797  normal  0.880113 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0321  aspartate kinase  52.54 
 
 
424 aa  233  3e-60  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.559818  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5290  aspartate kinase  58.09 
 
 
415 aa  233  4.0000000000000004e-60  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28320  aspartate kinase  57.49 
 
 
455 aa  233  4.0000000000000004e-60  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1515  aspartate kinase, monofunctional class  45.45 
 
 
405 aa  233  5e-60  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.000000000110315  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4611  aspartate kinase  46.18 
 
 
412 aa  233  5e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0463  aspartate kinase  57.79 
 
 
446 aa  233  5e-60  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.27288 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1246  aspartate kinase  49.19 
 
 
588 aa  231  1e-59  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0595781  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0969  aspartate kinase  45.52 
 
 
409 aa  231  1e-59  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3762  aspartate kinase  44.83 
 
 
411 aa  231  1e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.216913  normal  0.392085 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0927  aspartate kinase  46.93 
 
 
413 aa  231  1e-59  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3978  aspartate kinase  44.06 
 
 
411 aa  231  1e-59  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1941  aspartate kinase  47.5 
 
 
409 aa  231  1e-59  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.122463  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1304  aspartate kinase  49.81 
 
 
405 aa  231  2e-59  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.506172 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0999  aspartate kinase  45.91 
 
 
401 aa  230  2e-59  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.419107  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1378  aspartate kinase  44.36 
 
 
405 aa  230  3e-59  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.0000000455127  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0571  aspartate kinase  52.24 
 
 
408 aa  230  3e-59  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0407  aspartate kinase, monofunctional class  52.24 
 
 
408 aa  230  3e-59  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34450  aspartate kinase  45.21 
 
 
411 aa  229  5e-59  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0250796  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21161  aspartate kinase  48.79 
 
 
588 aa  229  5e-59  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.926226  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3119  aspartate kinase  46.98 
 
 
421 aa  229  6e-59  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000795424 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0390  aspartate kinase  46.47 
 
 
720 aa  229  7e-59  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.150199  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1145  aspartate kinase  48.69 
 
 
599 aa  229  8e-59  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3627  aspartate kinase  49.8 
 
 
413 aa  229  8e-59  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.0000937685  decreased coverage  0.000000109716 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4813  aspartate kinase  55.28 
 
 
423 aa  229  8e-59  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2221  aspartate kinase  49.8 
 
 
599 aa  228  9e-59  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.175544  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1633  aspartate kinase  44.73 
 
 
405 aa  228  1e-58  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.0000255158  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2117  aspartate kinase  49.42 
 
 
404 aa  228  1e-58  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.203177 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1843  aspartate kinase, monofunctional class  44.83 
 
 
410 aa  228  2e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.369756  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2609  aspartate kinase  49.18 
 
 
407 aa  228  2e-58  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0578539  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3555  aspartate kinase  44.83 
 
 
410 aa  227  2e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00961214  normal  0.594079 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0373  aspartate kinase  46.06 
 
 
739 aa  228  2e-58  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0075  aspartate kinase  49.38 
 
 
400 aa  226  4e-58  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1075  aspartate kinase  53.33 
 
 
410 aa  226  7e-58  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.352103  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3710  aspartate kinase  54.32 
 
 
387 aa  224  2e-57  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.989057 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2902  aspartate kinase  44.27 
 
 
424 aa  224  2e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1961  aspartate kinase  51.22 
 
 
409 aa  224  2e-57  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000119099  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1377  aspartate kinase  46.09 
 
 
400 aa  224  2e-57  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000378473  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1116  aspartate kinase  43.58 
 
 
404 aa  224  2e-57  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  unclonable  0.0000000000216352  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3379  aspartate kinase  48.01 
 
 
410 aa  224  2e-57  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.0000124538  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1612  aspartate kinase  50.67 
 
 
427 aa  223  3e-57  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.000000000435622  hitchhiker  0.0000000129841 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17741  aspartate kinase  50 
 
 
588 aa  222  6e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1044  aspartate kinase  48.78 
 
 
411 aa  222  9e-57  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1412  aspartate kinase  48.56 
 
 
401 aa  221  9.999999999999999e-57  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0255759  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1425  aspartate kinase  46.72 
 
 
599 aa  222  9.999999999999999e-57  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>