26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_2195 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010424  Daud_2195  FmdB family regulatory protein  100 
 
 		 80 aa  164  2.9999999999999998e-40  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0086  regulatory protein, FmdB family  61.73 
 
 		 81 aa  108  3e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.576483  hitchhiker  0.00282506 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2088  regulatory protein, FmdB family  59.74 
 
 		 79 aa  98.6  3e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1596  hypothetical protein  56.96 
 
 		 81 aa  96.7  1e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000000473565  normal  0.661888 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2544  FmdB family regulatory protein  40 
 
 		 85 aa  68.2  0.00000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.278642  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1512  hypothetical protein  32.5 
 
 		 94 aa  50.1  0.000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000051814  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2798  regulatory protein, FmdB family  38.46 
 
 		 88 aa  47.8  0.00005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.821801  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0204  regulatory protein, FmdB family  35.8 
 
 		 81 aa  46.2  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0297929 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0427  FmdB family regulatory protein  38.46 
 
 		 99 aa  46.6  0.0001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.953461  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1970  hypothetical protein  36.25 
 
 		 81 aa  45.4  0.0003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2392  regulatory protein, FmdB family  41.3 
 
 		 85 aa  44.7  0.0004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0773  regulatory protein, FmdB family  30.3 
 
 		 84 aa  45.1  0.0004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1775  FmdB family regulatory protein  37.5 
 
 		 69 aa  43.5  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1467  regulatory protein, FmdB family  32.69 
 
 		 138 aa  42.7  0.001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0195  regulatory protein, FmdB family  46.3 
 
 		 81 aa  42.7  0.002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0601  type I antifreeze protein  41.51 
 
 		 97 aa  42.7  0.002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2275  regulatory protein, FmdB family  41.07 
 
 		 66 aa  42.7  0.002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1422  FmdB family regulatory protein  43.18 
 
 		 70 aa  42  0.003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1544  regulatory protein, FmdB family  36.36 
 
 		 72 aa  42  0.003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00857595  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1172  FmdB family regulatory protein  40.74 
 
 		 71 aa  41.2  0.005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0094  regulatory protein, FmdB family  39.62 
 
 		 113 aa  41.2  0.005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2386  hypothetical protein  33.96 
 
 		 83 aa  40.8  0.006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.954945  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3203  hypothetical protein  31.65 
 
 		 77 aa  40.8  0.006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0920  FmdB family regulatory protein  36.21 
 
 		 65 aa  40.8  0.007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000112194  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2555  FmdB family regulatory protein  30.86 
 
 		 85 aa  40.4  0.008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0169359  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1009  hypothetical protein  39.53 
 
 		 73 aa  40.4  0.008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0112421  normal  0.0977193 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>