39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_1804 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010424  Daud_1804  hypothetical protein  100 
 
 
240 aa  475  1e-133  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0981  protein of unknown function DUF324  50.42 
 
 
237 aa  219  1.9999999999999999e-56  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1439  hypothetical protein  29 
 
 
223 aa  74.7  0.000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0111191 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0984  CRISPR-associated RAMP protein, SSO1426 family  34.54 
 
 
274 aa  68.6  0.00000000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1801  CRISPR-associated Csm3 family protein  33.5 
 
 
282 aa  67.4  0.0000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2385  hypothetical protein  26.98 
 
 
252 aa  65.9  0.0000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0985  protein of unknown function DUF324  30.73 
 
 
298 aa  63.9  0.000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2054  hypothetical protein  21.7 
 
 
181 aa  64.3  0.000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0740  hypothetical protein  28.43 
 
 
257 aa  62.8  0.000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0101279  normal  0.181235 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5586  CRISPR-associated RAMP protein, SSO1426 family  30.2 
 
 
280 aa  62.8  0.000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.199853  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1288  CRISPR-associated Csm3 family protein  30.36 
 
 
307 aa  61.2  0.00000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0685165  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1800  hypothetical protein  31.05 
 
 
299 aa  60.1  0.00000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0365  CRISPR-associated Csm3 family protein  28.05 
 
 
289 aa  57.8  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00395983 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0368  hypothetical protein  30.89 
 
 
217 aa  56.2  0.0000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00100802 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2050  CRISPR-associated Csm3 family protein  25.6 
 
 
279 aa  55.8  0.0000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2051  CRISPR-associated Csm3 family protein  25.25 
 
 
260 aa  54.7  0.000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1442  CRISPR-associated Csm3 family protein  29.33 
 
 
267 aa  55.1  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.141545 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5584  protein of unknown function DUF324  28.16 
 
 
649 aa  53.5  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0191  hypothetical protein  29.79 
 
 
214 aa  53.1  0.000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.667263  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0744  hypothetical protein  24.66 
 
 
219 aa  52.4  0.000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0162344  normal  0.584982 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0188  CRISPR-associated Csm3 family protein  27.6 
 
 
288 aa  51.2  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2390  SSO1426 family CRISPR-associated RAMP protein  27.37 
 
 
299 aa  50.1  0.00003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.293028  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1161  CRISPR-associated Csx7 family protein  27.8 
 
 
282 aa  50.1  0.00003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.59336  hitchhiker  0.00757758 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1287  CRISPR-associated Csm3 family protein  30 
 
 
237 aa  49.3  0.00006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.609283  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1443  hypothetical protein  32 
 
 
294 aa  47.4  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0712178 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1291  hypothetical protein  32.17 
 
 
222 aa  47.8  0.0002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.296488  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1160  CRISPR-associated Csx7 family protein  24.64 
 
 
254 aa  46.2  0.0005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.791227  normal  0.0434649 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2392  hypothetical protein  22.75 
 
 
338 aa  45.8  0.0006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.556583  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1070  protein of unknown function DUF324  27.62 
 
 
597 aa  45.4  0.0008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.478197  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0739  hypothetical protein  29.41 
 
 
429 aa  45.4  0.0009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0332728  normal  0.187894 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2702  CRISPR-associated RAMP protein, Csm3 family  29.92 
 
 
266 aa  43.9  0.002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1859  hypothetical protein  27.98 
 
 
594 aa  44.3  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5587  protein of unknown function DUF324  27.6 
 
 
315 aa  43.9  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.366064  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0610  CRISPR-associated RAMP protein, Csm3 family  23.33 
 
 
249 aa  43.5  0.003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1011  CRISPR-associated RAMP Csm3 family protein  35.38 
 
 
247 aa  43.5  0.003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1095  CRISPR-associated RAMP Csm3 family protein  35.38 
 
 
247 aa  43.5  0.003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1293  hypothetical protein  34.45 
 
 
288 aa  43.5  0.003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20530  uncharacterized RAMP superfamily protein probably involved in DNA repair  29.61 
 
 
415 aa  42.7  0.005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.587198 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1081  CRISPR-associated RAMP Csm3 family protein  25.45 
 
 
242 aa  42  0.008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0192235  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>