52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_0943 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010424  Daud_0943  dipicolinate synthase subunit A  100 
 
 
310 aa  612  9.999999999999999e-175  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3168  dipicolinate synthase subunit A  52.1 
 
 
303 aa  278  1e-73  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0344441  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3662  dipicolinate synthase subunit A  47.9 
 
 
303 aa  251  9.000000000000001e-66  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.189177  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0348  dipicolinic acid synthetase, A subunit  48.07 
 
 
298 aa  238  6.999999999999999e-62  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1943  dipicolinate synthase subunit A  44.76 
 
 
300 aa  238  1e-61  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.388369  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1064  dipicolinate synthase subunit A  42.66 
 
 
297 aa  220  3e-56  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.189136  hitchhiker  0.00191942 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1272  dipicolinate synthase subunit A  40.21 
 
 
304 aa  219  6e-56  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00345659  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1446  dipicolinic acid synthetase, A subunit  39.37 
 
 
302 aa  194  2e-48  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.527023  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2058  dipicolinate synthase subunit A  36.91 
 
 
301 aa  189  4e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08650  dipicolinate synthase subunit A  35.21 
 
 
321 aa  186  6e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.866181  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1165  dipicolinate synthase subunit A  36.15 
 
 
300 aa  184  1.0000000000000001e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00398415  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2455  dipicolinate synthase subunit A  34.02 
 
 
300 aa  177  2e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00908156  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0420  dipicolinate synthase subunit A  33.81 
 
 
290 aa  177  3e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3840  dipicolinate synthase subunit A  33.33 
 
 
300 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3814  dipicolinate synthase subunit A  33.33 
 
 
300 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  8.15193e-62 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3850  dipicolinate synthase subunit A  33.33 
 
 
300 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000115985  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3939  dipicolinate synthase subunit A  33.33 
 
 
300 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.385927  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3654  dipicolinate synthase subunit A  33.33 
 
 
300 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3544  dipicolinate synthase subunit A  33.33 
 
 
300 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3625  dipicolinate synthase subunit A  32.99 
 
 
300 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1705  dipicolinate synthase subunit A  34.95 
 
 
291 aa  174  1.9999999999999998e-42  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00515237  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3562  dipicolinate synthase subunit A  33.33 
 
 
300 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3901  dipicolinate synthase subunit A  32.99 
 
 
300 aa  174  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00675499  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1343  dipicolinate synthase subunit A  32.99 
 
 
300 aa  174  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.552593 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1456  dipicolinate synthase subunit A  35.59 
 
 
292 aa  172  5.999999999999999e-42  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.1375  normal  0.482837 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0978  dipicolinate synthase subunit A  32.18 
 
 
292 aa  148  1.0000000000000001e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.953632  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1249  dipicolinate synthase subunit A  28.67 
 
 
294 aa  135  9.999999999999999e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.342925  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6049  Shikimate/quinate 5-dehydrogenase  30.72 
 
 
296 aa  105  1e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.289518  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1660  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  26.8 
 
 
322 aa  47.4  0.0003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.653624  normal  0.0436541 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2454  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase, NAD-binding  31.01 
 
 
354 aa  46.6  0.0005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.738154  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0343  NADP-dependent alcohol dehydrogenase  38.82 
 
 
360 aa  46.6  0.0005  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.082465  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1533  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  37.5 
 
 
358 aa  46.6  0.0006  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.712764  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1719  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  39.73 
 
 
358 aa  45.8  0.0008  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0992  cyclohexadienyl dehydrogenase  26.77 
 
 
312 aa  45.4  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1575  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase, NAD-binding  28.57 
 
 
320 aa  45.4  0.001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0139499  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3483  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  30.93 
 
 
318 aa  44.7  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3848  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  37.5 
 
 
350 aa  43.9  0.003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.12634  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1883  alcohol dehydrogenase  30.11 
 
 
350 aa  44.3  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1836  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  30.11 
 
 
350 aa  44.3  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0104  alanine dehydrogenase  25.14 
 
 
374 aa  43.9  0.003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1817  alcohol dehydrogenase  29.79 
 
 
350 aa  43.9  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.304058  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1914  cyclohexadienyl dehydrogenase  25.98 
 
 
321 aa  43.5  0.004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0219  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  30.77 
 
 
360 aa  43.5  0.005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2346  putative dehydrogenase  25.6 
 
 
335 aa  43.5  0.005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1905  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  35 
 
 
358 aa  43.5  0.005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4323  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase, NAD-binding  26.43 
 
 
309 aa  43.1  0.006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0315  putative dehydrogenase  33.03 
 
 
329 aa  43.1  0.006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0632  putative NADP-dependent alcohol dehydrogenase oxidoreductase protein  38.89 
 
 
352 aa  43.1  0.006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3401  adenosylhomocysteinase  34.12 
 
 
406 aa  43.1  0.007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1694  alcohol dehydrogenase  36.11 
 
 
348 aa  42.7  0.008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1988  cyclohexadienyl dehydrogenase  25 
 
 
321 aa  42.7  0.008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1049  alanine dehydrogenase  26.9 
 
 
374 aa  42.4  0.01  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>