44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_0709 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010424  Daud_0709  hypothetical protein  100 
 
 
382 aa  778    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0250  hypothetical protein  54.07 
 
 
380 aa  450  1e-125  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.178621  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0837  conserved hypothetical protein (DUF450 domain protein)  39.09 
 
 
347 aa  233  6e-60  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.0000053845  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1227  hypothetical protein  35.49 
 
 
356 aa  223  3e-57  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.888396  normal  0.616229 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3124  protein of unknown function DUF450  36.97 
 
 
363 aa  221  1.9999999999999999e-56  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.579922  normal  0.419432 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5317  protein of unknown function DUF450  37.98 
 
 
364 aa  220  3e-56  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0984182  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6984  protein of unknown function DUF450  37.16 
 
 
362 aa  213  4.9999999999999996e-54  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00893267  hitchhiker  0.0000001532 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4924  hypothetical protein  38.21 
 
 
361 aa  206  4e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1591  hypothetical protein  34.95 
 
 
365 aa  204  1e-51  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.330641 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0309  hypothetical protein  37.23 
 
 
395 aa  204  1e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4039  hypothetical protein  39.88 
 
 
353 aa  202  7e-51  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.400799  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2922  protein of unknown function DUF450  36.26 
 
 
374 aa  201  1.9999999999999998e-50  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1887  hypothetical protein  38.4 
 
 
356 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.132794  normal  0.576975 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1839  hypothetical protein  38.4 
 
 
356 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00358423  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1853  hypothetical protein  38.4 
 
 
356 aa  200  3e-50  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3692  hypothetical protein  35.28 
 
 
362 aa  200  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.877955 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0499  hypothetical protein  34.86 
 
 
357 aa  198  2.0000000000000003e-49  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0768136  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0961  hypothetical protein  37.72 
 
 
354 aa  197  3e-49  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0478229  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3528  protein of unknown function DUF450  34.64 
 
 
375 aa  191  2e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0402721  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03510  prophage Lp2 protein 6  33.63 
 
 
426 aa  189  9e-47  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3361  putative restriction endonuclease or methylase  34.9 
 
 
355 aa  189  1e-46  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1326  hypothetical protein  35.21 
 
 
361 aa  188  2e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0657  prophage Lp2 protein 6  48.94 
 
 
245 aa  187  3e-46  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1111  hypothetical protein  36.44 
 
 
357 aa  187  3e-46  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3005  hypothetical protein  33.24 
 
 
351 aa  186  5e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.826636  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3350  protein of unknown function DUF450  34.09 
 
 
363 aa  184  2.0000000000000003e-45  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4251  protein of unknown function DUF450  32.84 
 
 
378 aa  182  6e-45  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1269  protein of unknown function DUF450  35.47 
 
 
356 aa  182  7e-45  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0165219  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3617  hypothetical protein  33.43 
 
 
363 aa  180  4e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0242  protein of unknown function DUF450  34.41 
 
 
370 aa  177  3e-43  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4887  hypothetical protein  30.22 
 
 
387 aa  124  3e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.180443  normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0879  type I restriction enzyme r protein (hsdr_n)  35.9 
 
 
394 aa  115  1.0000000000000001e-24  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  hitchhiker  0.000202052  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0839  hypothetical protein  30.31 
 
 
281 aa  109  6e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.51863  normal  0.567303 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0515  protein of unknown function DUF450  33.49 
 
 
360 aa  90.5  5e-17  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0510  hypothetical protein  35.29 
 
 
349 aa  81.3  0.00000000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0842  hypothetical protein  52.05 
 
 
85 aa  79.3  0.0000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.210656 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0986  hypothetical protein  26.87 
 
 
372 aa  71.2  0.00000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.432153  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2571  protein of unknown function DUF450  31.63 
 
 
268 aa  59.7  0.00000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.280266  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0296  hypothetical protein  32.11 
 
 
375 aa  54.3  0.000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0698  hypothetical protein  25.26 
 
 
248 aa  43.9  0.005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1333  protein of unknown function DUF450  27.2 
 
 
995 aa  43.5  0.006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.126844  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4557  hypothetical protein  26.62 
 
 
249 aa  43.5  0.006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.515775  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0215  protein of unknown function DUF450  30.91 
 
 
207 aa  43.1  0.007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0207783  hitchhiker  0.00936489 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0218  protein of unknown function DUF450  30.91 
 
 
207 aa  43.1  0.007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>