41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_4092 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_4092  signal peptide protein  100 
 
 		 156 aa  318  1.9999999999999998e-86  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1050  signal peptide protein  45.7 
 
 		 193 aa  149  1e-35  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0908  signal peptide protein  47.01 
 
 		 160 aa  132  1.9999999999999998e-30  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0327  signal peptide protein  43.42 
 
 		 166 aa  127  7.000000000000001e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2904  signal peptide protein  32.5 
 
 		 175 aa  92.8  2e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0905187 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1023  putative signal peptide protein  33.12 
 
 		 165 aa  91.3  5e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2995  hypothetical protein  32.7 
 
 		 159 aa  90.9  7e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.399401  normal  0.194797 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4532  putative thiol-disulfide isomerase/thioredoxins-like protein  29.63 
 
 		 165 aa  87.4  6e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.287811  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0487  hypothetical protein  29.22 
 
 		 176 aa  81.6  0.000000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.933254  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0872  hypothetical protein  31.82 
 
 		 160 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.528865  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0884  hypothetical protein  31.37 
 
 		 160 aa  73.9  0.0000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.11048  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4120  hypothetical protein  29.22 
 
 		 160 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000520793  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05314  signal peptide protein  29.61 
 
 		 167 aa  70.9  0.000000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.450709 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2933  hypothetical protein  33.85 
 
 		 165 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.123525  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2997  hypothetical protein  32.33 
 
 		 165 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.566272  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0678  redoxin domain-containing protein  24.2 
 
 		 158 aa  67.4  0.00000000007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.118036  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1600  hypothetical protein  28.85 
 
 		 162 aa  65.5  0.0000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.319881  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2386  hypothetical protein  28.39 
 
 		 161 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0148  hypothetical protein  31.78 
 
 		 162 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2628  hypothetical protein  31.78 
 
 		 162 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.282554  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0998  hypothetical protein  31.78 
 
 		 162 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0475  hypothetical protein  31.78 
 
 		 162 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4138  putative signal peptide protein  26.47 
 
 		 168 aa  58.5  0.00000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.915643  normal  0.809952 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4250  signal peptide protein  26.47 
 
 		 168 aa  58.5  0.00000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.148773  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1975  thioredoxin-like protein  25.33 
 
 		 170 aa  52  0.000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.570342 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1180  RecJ exonuclease  27.34 
 
 		 160 aa  46.2  0.0002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0271144 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1383  thioredoxin family protein  28.45 
 
 		 168 aa  45.8  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.12426  normal  0.0879111 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1793  thioredoxin family protein  29.77 
 
 		 184 aa  44.7  0.0005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3551  thioredoxin family protein  29.77 
 
 		 184 aa  44.7  0.0006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1435  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  28.43 
 
 		 168 aa  44.3  0.0006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0354049 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0860  Redoxin domain protein  28.95 
 
 		 162 aa  44.7  0.0006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00216693  normal  0.0861373 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1906  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  24.46 
 
 		 160 aa  43.5  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.114781  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1789  Redoxin domain protein  25.62 
 
 		 165 aa  42.4  0.002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0841  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  29.69 
 
 		 174 aa  41.6  0.004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3550  redoxin domain-containing protein  25.36 
 
 		 278 aa  41.2  0.006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.054429 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2010  redoxin domain-containing protein  29.89 
 
 		 178 aa  41.2  0.006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1906  hypothetical protein  31.82 
 
 		 153 aa  40.8  0.007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.203094 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1730  Redoxin domain-containing protein  26.21 
 
 		 200 aa  40.4  0.008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.686612  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1197  thiol-disulfide oxidoreductase  30.63 
 
 		 173 aa  40.4  0.009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0468  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  27.03 
 
 		 589 aa  40.4  0.009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00332396  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4240  redoxin domain-containing protein  31.53 
 
 		 332 aa  40.4  0.01  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0223129  normal  0.219177 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>