64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_2280 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_2280  tetrahydromethanopterin S-methyltransferase subunit A  100 
 
 		 380 aa  769    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.882488 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2174  tetrahydromethanopterin S-methyltransferase subunit A  43.31 
 
 		 248 aa  133  5e-30  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.894903 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2172  tetrahydromethanopterin S-methyltransferase subunit A  43.23 
 
 		 244 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1554  tetrahydromethanopterin S-methyltransferase subunit A  40.26 
 
 		 246 aa  123  5e-27  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.139393  hitchhiker  0.0000615765 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1556  tetrahydromethanopterin S-methyltransferase subunit A  41.56 
 
 		 245 aa  122  7e-27  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.345756  hitchhiker  0.000057533 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2073  methyltransferase  36.17 
 
 		 197 aa  120  4.9999999999999996e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.829747 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0567  tetrahydromethanopterin S-methyltransferase subunit A  42.21 
 
 		 246 aa  118  1.9999999999999998e-25  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.369286  normal  0.231372 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0569  tetrahydromethanopterin S-methyltransferase subunit A  41.56 
 
 		 241 aa  117  1.9999999999999998e-25  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.779596  normal  0.240938 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0608  tetrahydromethanopterin S-methyltransferase subunit A  34.89 
 
 		 240 aa  117  3.9999999999999997e-25  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.545185  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2314  tetrahydromethanopterin S-methyltransferase subunit A  32.1 
 
 		 240 aa  113  5e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.457639 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0606  tetrahydromethanopterin S-methyltransferase subunit A  38.31 
 
 		 245 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.160267  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2316  tetrahydromethanopterin S-methyltransferase subunit A  33.85 
 
 		 245 aa  110  3e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.725882 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1713  tetrahydromethanopterin S-methyltransferase subunit A  38.27 
 
 		 182 aa  107  3e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0103969  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1381  tetrahydromethanopterin S-methyltransferase subunit A  37.74 
 
 		 243 aa  107  5e-22  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1258  tetrahydromethanopterin S-methyltransferase subunit A  37.01 
 
 		 240 aa  99.4  9e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1521  tetrahydromethanopterin S-methyltransferase subunit A  35.29 
 
 		 241 aa  97.1  5e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000089411  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0877  tetrahydromethanopterin S-methyltransferase subunit A  40.37 
 
 		 239 aa  93.6  5e-18  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0012  tetrahydromethanopterin S-methyltransferase subunit A  41.61 
 
 		 239 aa  93.2  6e-18  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.316661  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0011  tetrahydromethanopterin S-methyltransferase subunit A  41.61 
 
 		 253 aa  92.4  1e-17  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.25652  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0878  tetrahydromethanopterin S-methyltransferase subunit A  40.37 
 
 		 253 aa  92.4  1e-17  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1106  tetrahydromethanopterin S-methyltransferase subunit A  41.03 
 
 		 239 aa  91.7  2e-17  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  decreased coverage  0.000297969  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0811  tetrahydromethanopterin S-methyltransferase subunit A  40.65 
 
 		 239 aa  90.9  3e-17  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0812  tetrahydromethanopterin S-methyltransferase subunit A  42.04 
 
 		 253 aa  90.9  3e-17  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.779681  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1105  tetrahydromethanopterin S-methyltransferase subunit A  42.68 
 
 		 253 aa  91.3  3e-17  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  hitchhiker  0.00015052  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1273  tetrahydromethanopterin S-methyltransferase subunit A  32.87 
 
 		 240 aa  87  4e-16  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0410  tetrahydromethanopterin S-methyltransferase subunit A  34.01 
 
 		 188 aa  85.5  0.000000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.117541  normal  0.885996 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1274  tetrahydromethanopterin S-methyltransferase subunit A  38.36 
 
 		 254 aa  85.1  0.000000000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2572  tetrahydromethanopterin S-methyltransferase subunit A  35.71 
 
 		 227 aa  78.2  0.0000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1747  tetrahydromethanopterin S-methyltransferase subunit A  29.37 
 
 		 155 aa  76.6  0.0000000000007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0605  dihydropteroate synthase-related protein  33.33 
 
 		 530 aa  72.4  0.00000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0827  dihydropteroate synthase-related protein  36.08 
 
 		 523 aa  66.6  0.0000000007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.376775  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1090  dihydropteroate synthase-related protein  35.05 
 
 		 523 aa  65.9  0.000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0516227  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0892  dihydropteroate synthase-related protein  35.11 
 
 		 523 aa  63.2  0.000000007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3193  hypothetical protein  34.13 
 
 		 129 aa  62  0.00000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.522367  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1829  dihydropteroate synthase-related protein  34.69 
 
 		 523 aa  60.1  0.00000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1188  AP-4-A phosphorylase II-like protein  33.87 
 
 		 130 aa  59.7  0.00000009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.13202  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2341  hypothetical protein  38.68 
 
 		 135 aa  59.3  0.0000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0717  dihydropteroate synthase-related protein  59.18 
 
 		 482 aa  58.5  0.0000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2583  hypothetical protein  33.33 
 
 		 127 aa  57.8  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3523  hypothetical protein  33.33 
 
 		 127 aa  57.8  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0805  hypothetical protein  31.75 
 
 		 127 aa  57  0.0000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0582  hypothetical protein  35.24 
 
 		 137 aa  56.2  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.837008  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1276  thymidylate synthase  29.46 
 
 		 508 aa  56.2  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0565083 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0190  hypothetical protein  40 
 
 		 493 aa  55.1  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0034  hypothetical protein  30.48 
 
 		 127 aa  54.3  0.000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.308035  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0306  dihydropteroate synthase  52.08 
 
 		 489 aa  54.3  0.000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01171  hypothetical protein  36.79 
 
 		 134 aa  54.3  0.000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.792165 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0351  hypothetical protein  36.79 
 
 		 134 aa  53.1  0.000007  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3380  hypothetical protein  33.65 
 
 		 126 aa  53.1  0.000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.6614 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0215  dihydropteroate synthase-related protein  50 
 
 		 470 aa  52.8  0.000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0815  thymidylate synthase  38.82 
 
 		 508 aa  52.8  0.000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.148226 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01191  hypothetical protein  30.77 
 
 		 128 aa  52.4  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.15525  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01201  hypothetical protein  30.77 
 
 		 128 aa  52.4  0.00001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0107  hypothetical protein  30.77 
 
 		 128 aa  52  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.519753  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01161  hypothetical protein  30.77 
 
 		 128 aa  52  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0704273  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02121  hypothetical protein  37.5 
 
 		 123 aa  51.6  0.00003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1673  hypothetical protein  48 
 
 		 475 aa  51.2  0.00003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.293824  hitchhiker  0.0000000161519 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01741  hypothetical protein  32.8 
 
 		 133 aa  49.7  0.00008  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.134787  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1471  hypothetical protein  32.31 
 
 		 133 aa  49.3  0.0001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1245  thymidylate synthase  26.36 
 
 		 497 aa  48.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2712  dihydropteroate synthase DHPS  47.83 
 
 		 471 aa  47  0.0005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0726  thymidylate synthase  38.33 
 
 		 512 aa  46.6  0.0007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2299  dihydropteroate synthase-related protein  41.18 
 
 		 474 aa  45.8  0.001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0948  thymidylate synthase-like  43.75 
 
 		 460 aa  43.5  0.006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0109013  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>