23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_3380 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_3380  hypothetical protein  100 
 
 
126 aa  261  2e-69  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.6614 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3523  hypothetical protein  74.02 
 
 
127 aa  199  9.999999999999999e-51  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2583  hypothetical protein  73.23 
 
 
127 aa  197  3e-50  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0805  hypothetical protein  70.08 
 
 
127 aa  192  1e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0034  hypothetical protein  67.72 
 
 
127 aa  184  5e-46  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.308035  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3193  hypothetical protein  64.57 
 
 
129 aa  178  2e-44  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.522367  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0582  hypothetical protein  64.57 
 
 
137 aa  173  7e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.837008  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1188  AP-4-A phosphorylase II-like protein  56.56 
 
 
130 aa  148  2e-35  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.13202  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02121  hypothetical protein  45.16 
 
 
123 aa  112  1.0000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1471  hypothetical protein  42.74 
 
 
133 aa  112  2.0000000000000002e-24  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01741  hypothetical protein  42.74 
 
 
133 aa  110  9e-24  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.134787  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01171  hypothetical protein  44.8 
 
 
134 aa  107  7.000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.792165 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2341  hypothetical protein  44.63 
 
 
135 aa  106  1e-22  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0107  hypothetical protein  45.69 
 
 
128 aa  104  5e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.519753  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01201  hypothetical protein  45.69 
 
 
128 aa  103  8e-22  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01191  hypothetical protein  45.69 
 
 
128 aa  103  9e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.15525  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01161  hypothetical protein  41.94 
 
 
128 aa  102  3e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0704273  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0351  hypothetical protein  43.22 
 
 
134 aa  99.8  1e-20  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2280  tetrahydromethanopterin S-methyltransferase subunit A  33.65 
 
 
380 aa  53.1  0.000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.882488 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0726  thymidylate synthase  33.96 
 
 
512 aa  49.7  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0815  thymidylate synthase  35.24 
 
 
508 aa  45.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.148226 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1276  thymidylate synthase  31.58 
 
 
508 aa  42  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0565083 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0605  dihydropteroate synthase-related protein  27.2 
 
 
530 aa  40.4  0.008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>