28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMN2A_1471 on replicon NC_007335
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL2A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007335  PMN2A_1471  hypothetical protein  100 
 
 
133 aa  270  7e-72  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01741  hypothetical protein  96.24 
 
 
133 aa  256  7e-68  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.134787  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02121  hypothetical protein  55.74 
 
 
123 aa  160  4.0000000000000004e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0351  hypothetical protein  58.47 
 
 
134 aa  146  1.0000000000000001e-34  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2341  hypothetical protein  50.38 
 
 
135 aa  141  3e-33  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01171  hypothetical protein  54.33 
 
 
134 aa  139  9.999999999999999e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.792165 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1188  AP-4-A phosphorylase II-like protein  45.11 
 
 
130 aa  130  6.999999999999999e-30  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.13202  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01201  hypothetical protein  49.57 
 
 
128 aa  127  5.0000000000000004e-29  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0107  hypothetical protein  49.57 
 
 
128 aa  125  3e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.519753  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01191  hypothetical protein  49.57 
 
 
128 aa  124  5e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.15525  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01161  hypothetical protein  50.43 
 
 
128 aa  123  8.000000000000001e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0704273  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0034  hypothetical protein  49.57 
 
 
127 aa  120  6e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.308035  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2583  hypothetical protein  42.74 
 
 
127 aa  115  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0805  hypothetical protein  40.32 
 
 
127 aa  115  1.9999999999999998e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3523  hypothetical protein  42.74 
 
 
127 aa  115  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3193  hypothetical protein  41.13 
 
 
129 aa  114  5e-25  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.522367  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3380  hypothetical protein  42.74 
 
 
126 aa  112  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.6614 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0582  hypothetical protein  42.74 
 
 
137 aa  107  7.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.837008  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0815  thymidylate synthase  34.29 
 
 
508 aa  52.4  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.148226 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0726  thymidylate synthase  32.26 
 
 
512 aa  50.1  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5011  thymidylate synthase  34.29 
 
 
497 aa  48.9  0.00002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2280  tetrahydromethanopterin S-methyltransferase subunit A  32.31 
 
 
380 aa  49.3  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.882488 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1276  thymidylate synthase  31.13 
 
 
508 aa  47  0.00008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0565083 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0605  dihydropteroate synthase-related protein  38.36 
 
 
530 aa  44.7  0.0004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0892  dihydropteroate synthase-related protein  31.78 
 
 
523 aa  44.3  0.0005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0827  dihydropteroate synthase-related protein  29.17 
 
 
523 aa  43.1  0.001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.376775  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1090  dihydropteroate synthase-related protein  29.17 
 
 
523 aa  42.4  0.002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0516227  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0717  dihydropteroate synthase-related protein  60 
 
 
482 aa  41.2  0.004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>