22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMT9312_0107 on replicon NC_007577
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9312



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007577  PMT9312_0107  hypothetical protein  100 
 
 
128 aa  257  3e-68  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.519753  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01201  hypothetical protein  92.97 
 
 
128 aa  243  6e-64  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01191  hypothetical protein  92.19 
 
 
128 aa  241  1.9999999999999999e-63  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.15525  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01161  hypothetical protein  72.66 
 
 
128 aa  199  9.999999999999999e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0704273  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01171  hypothetical protein  52.54 
 
 
134 aa  129  2.0000000000000002e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.792165 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1471  hypothetical protein  49.57 
 
 
133 aa  125  3e-28  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02121  hypothetical protein  47.46 
 
 
123 aa  122  2e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2341  hypothetical protein  50 
 
 
135 aa  121  3e-27  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1188  AP-4-A phosphorylase II-like protein  50.43 
 
 
130 aa  120  7e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.13202  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0351  hypothetical protein  49.58 
 
 
134 aa  118  3e-26  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01741  hypothetical protein  48.72 
 
 
133 aa  116  9e-26  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.134787  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0582  hypothetical protein  45.9 
 
 
137 aa  111  3e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.837008  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2583  hypothetical protein  46.83 
 
 
127 aa  110  5e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3523  hypothetical protein  46.03 
 
 
127 aa  109  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0034  hypothetical protein  45.97 
 
 
127 aa  105  2e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.308035  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3380  hypothetical protein  45.69 
 
 
126 aa  104  5e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.6614 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0805  hypothetical protein  46.15 
 
 
127 aa  103  1e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3193  hypothetical protein  45.9 
 
 
129 aa  102  2e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.522367  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2280  tetrahydromethanopterin S-methyltransferase subunit A  30.77 
 
 
380 aa  52  0.000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.882488 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0815  thymidylate synthase  33.65 
 
 
508 aa  47.8  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.148226 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0726  thymidylate synthase  34.91 
 
 
512 aa  44.3  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1276  thymidylate synthase  31.68 
 
 
508 aa  44.3  0.0006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0565083 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>