41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC5_1829 on replicon NC_009135
Organism: Methanococcus maripaludis C5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009635  Maeo_0605  dihydropteroate synthase-related protein  67.49 
 
 
530 aa  728    Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0892  dihydropteroate synthase-related protein  75.33 
 
 
523 aa  823    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1829  dihydropteroate synthase-related protein  100 
 
 
523 aa  1049    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1090  dihydropteroate synthase-related protein  93.5 
 
 
523 aa  988    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0516227  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0827  dihydropteroate synthase-related protein  91.78 
 
 
523 aa  969    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.376775  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0717  dihydropteroate synthase-related protein  35.19 
 
 
482 aa  280  4e-74  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0190  hypothetical protein  33.14 
 
 
493 aa  266  8e-70  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0306  dihydropteroate synthase  32.95 
 
 
489 aa  252  1e-65  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2299  dihydropteroate synthase-related protein  29.17 
 
 
474 aa  201  3.9999999999999996e-50  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2712  dihydropteroate synthase DHPS  28.46 
 
 
471 aa  181  2e-44  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2402  dihydropteroate synthase  28.68 
 
 
471 aa  171  3e-41  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0215  dihydropteroate synthase-related protein  28.32 
 
 
470 aa  163  8.000000000000001e-39  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1673  hypothetical protein  28.14 
 
 
475 aa  154  5e-36  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.293824  hitchhiker  0.0000000161519 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0631  dihydropteroate synthase-related protein  29.13 
 
 
512 aa  145  2e-33  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.498786  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2035  dihydropteroate synthase DHPS  25.28 
 
 
489 aa  144  6e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.00317659  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1581  dihydropteroate synthase, DHPS  25.96 
 
 
481 aa  139  2e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00143208  unclonable  0.000000236622 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0222  dihydropteroate synthase-related protein  30.61 
 
 
498 aa  137  3.0000000000000003e-31  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.70107  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1245  pterin-binding domain-containing protein  22.52 
 
 
465 aa  130  6e-29  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4100  dihydropteroate synthase DHPS  26.01 
 
 
472 aa  126  1e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2394  dihydropteroate synthase DHPS  24.14 
 
 
464 aa  121  3e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5017  dihydropteroate synthase DHPS  22.61 
 
 
471 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00770286 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3143  dihydropteroate synthase DHPS  22.63 
 
 
471 aa  115  1.0000000000000001e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2441  tetrahydromethanopterin biosynthesis protein  22.22 
 
 
460 aa  114  6e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.366822 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5321  dihydropteroate synthase DHPS  25.75 
 
 
471 aa  114  6e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1842  dihydropteroate synthase DHPS  22.26 
 
 
524 aa  113  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2616  pterin-binding domain-containing protein  22.75 
 
 
479 aa  113  1.0000000000000001e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.521784  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6492  dihydropteroate synthase DHPS  22.41 
 
 
462 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.137356 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3075  dihydropteroate synthase DHPS  25.47 
 
 
495 aa  111  3e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2177  dihydropteroate synthase DHPS  22.26 
 
 
524 aa  111  3e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.339932  normal  0.330618 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5941  dihydropteroate synthase DHPS  26.37 
 
 
461 aa  110  5e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0197789 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1793  dihydropteroate synthase DHPS  26.5 
 
 
524 aa  110  6e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.425163  normal  0.963011 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2725  dihydropteroate synthase DHPS  26.3 
 
 
520 aa  108  3e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.63462  normal  0.0704313 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2280  tetrahydromethanopterin S-methyltransferase subunit A  34.69 
 
 
380 aa  60.1  0.00000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.882488 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1211  homocysteine S-methyltransferase  27.32 
 
 
807 aa  48.1  0.0004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0179968  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1570  dihydropteroate synthase  23.46 
 
 
281 aa  45.4  0.002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0385  methyltetrahydrofolate:corrinoid/iron-sulfur protein methyltransferase  26.14 
 
 
265 aa  46.2  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.239751  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0210  dihydropteroate synthase  25.24 
 
 
376 aa  44.7  0.005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0905  dihydropteroate synthase  26.15 
 
 
278 aa  43.9  0.007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0884892  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2646  Dihydropteroate synthase  24.1 
 
 
291 aa  43.9  0.007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.603714  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0743  dihydropteroate synthase  23.89 
 
 
270 aa  43.5  0.008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1676  dihydropteroate synthase  22.34 
 
 
303 aa  43.9  0.008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>