17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_2207 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_2207  hypothetical protein  100 
 
 		 401 aa  820    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1624  TIR protein  58.16 
 
 		 330 aa  175  9.999999999999999e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0366  hypothetical protein  50.37 
 
 		 262 aa  145  1e-33  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1556  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  32.33 
 
 		 486 aa  117  3e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.388564  hitchhiker  0.00312965 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0254  TIR (Toll-Interleukin 1-resistance) domain containing protein-like protein  46.76 
 
 		 279 aa  115  1.0000000000000001e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0773  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  29.41 
 
 		 481 aa  103  6e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.230608 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2549  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  32.33 
 
 		 489 aa  102  1e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.98894  normal  0.217885 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1450  hypothetical protein  31.88 
 
 		 362 aa  78.2  0.0000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.252618  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1772  WD repeat-containing protein  33.33 
 
 		 981 aa  67  0.0000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011732  PCC7424_5586  ATPase  33.04 
 
 		 504 aa  61.6  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0731  hypothetical protein  31.58 
 
 		 325 aa  58.9  0.0000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0382  hypothetical protein  29.91 
 
 		 490 aa  58.2  0.0000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.854093 
 
 
-
 
NC_004310  BR0735  hypothetical protein  31.58 
 
 		 277 aa  58.9  0.0000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3653  ATPas  33.33 
 
 		 487 aa  58.5  0.0000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  5.96179e-19  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1561  protein of unknown function DUF323  27.41 
 
 		 361 aa  51.2  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02992  hypothetical protein  29.41 
 
 		 521 aa  50.4  0.00005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  unclonable  0.000000718056  normal  0.615169 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2310  TIR protein  31.07 
 
 		 293 aa  47.4  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000002638 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>