25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_5586 on replicon NC_011732
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011732  PCC7424_5586  ATPase  100 
 
 		 504 aa  1034    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3653  ATPas  52.14 
 
 		 487 aa  496  1e-139  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  5.96179e-19  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0382  hypothetical protein  27.56 
 
 		 490 aa  215  9.999999999999999e-55  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.854093 
 
 
-
 
NC_003296  RS02992  hypothetical protein  30.34 
 
 		 521 aa  208  2e-52  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  unclonable  0.000000718056  normal  0.615169 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0366  hypothetical protein  30.22 
 
 		 262 aa  75.1  0.000000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1624  TIR protein  34 
 
 		 330 aa  67  0.0000000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1450  hypothetical protein  44.74 
 
 		 362 aa  62  0.00000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.252618  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2207  hypothetical protein  33.04 
 
 		 401 aa  61.6  0.00000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0254  TIR (Toll-Interleukin 1-resistance) domain containing protein-like protein  24.87 
 
 		 279 aa  60.1  0.00000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0735  hypothetical protein  25.2 
 
 		 277 aa  47.8  0.0004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0731  hypothetical protein  25.2 
 
 		 325 aa  48.1  0.0004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0731  Holliday junction DNA helicase RuvB  26.81 
 
 		 348 aa  47  0.0007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1702  Holliday junction DNA helicase RuvB  26.2 
 
 		 346 aa  47  0.0008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.131783  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1645  Holliday junction DNA helicase RuvB  26.2 
 
 		 346 aa  47  0.0008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.919299  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0927  Holliday junction DNA helicase RuvB  24.68 
 
 		 333 aa  46.6  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3787  Holliday junction DNA helicase RuvB  26.2 
 
 		 359 aa  46.2  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.32763  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1104  Holliday junction DNA helicase RuvB  26.2 
 
 		 348 aa  46.2  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.911797  normal  0.299108 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1213  Holliday junction DNA helicase RuvB  25.76 
 
 		 346 aa  45.8  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37630  hypothetical protein  24.76 
 
 		 426 aa  46.2  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  unclonable  0.000000306254  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4436  Holliday junction DNA helicase RuvB  26.2 
 
 		 344 aa  45.1  0.003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0751  Holliday junction DNA helicase RuvB  26.2 
 
 		 351 aa  45.1  0.003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.753333 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4803  Holliday junction DNA helicase RuvB  24.89 
 
 		 349 aa  44.7  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1454  Holliday junction DNA helicase RuvB  26.2 
 
 		 338 aa  44.3  0.005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00617754  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2637  Holliday junction DNA helicase RuvB  25 
 
 		 346 aa  43.9  0.007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1662  Holliday junction DNA helicase RuvB  27.43 
 
 		 344 aa  43.5  0.008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.280554  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>