12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RS02992 on replicon NC_003296
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003296  RS02992  hypothetical protein  100 
 
 		 521 aa  1064    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  unclonable  0.000000718056  normal  0.615169 
 
 
-
 
NC_002950  PG0382  hypothetical protein  28.6 
 
 		 490 aa  234  4.0000000000000004e-60  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.854093 
 
 
-
 
NC_011732  PCC7424_5586  ATPase  30.34 
 
 		 504 aa  208  2e-52  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3653  ATPas  25.99 
 
 		 487 aa  160  4e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  5.96179e-19  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0254  TIR (Toll-Interleukin 1-resistance) domain containing protein-like protein  33.12 
 
 		 279 aa  82.4  0.00000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0366  hypothetical protein  31.4 
 
 		 262 aa  59.3  0.0000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1624  TIR protein  29.31 
 
 		 330 aa  59.3  0.0000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1450  hypothetical protein  28.69 
 
 		 362 aa  53.9  0.000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.252618  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2207  hypothetical protein  29.41 
 
 		 401 aa  50.4  0.00007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0735  hypothetical protein  30.58 
 
 		 277 aa  48.9  0.0002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0731  hypothetical protein  30.58 
 
 		 325 aa  48.9  0.0002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3064  hypothetical protein  21.81 
 
 		 401 aa  45.8  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>