47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_1403 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_1403  hypothetical protein  100 
 
 		 772 aa  1583    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.142579  normal  0.0825928 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4081  hypothetical protein  26.62 
 
 		 706 aa  158  3e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0596135  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1523  outer membrane protein precursor MtrB  22.68 
 
 		 703 aa  140  7e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.415633  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2700  outer membrane protein precursor MtrB  23.8 
 
 		 699 aa  140  7e-32  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.140373  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3127  outer membrane protein precursor MtrB  22.93 
 
 		 698 aa  138  5e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000335103 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1776  outer membrane protein precursor MtrB  23.26 
 
 		 697 aa  137  9e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1587  outer membrane protein precursor MtrB  23.23 
 
 		 695 aa  134  5e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.14869  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1206  outer membrane protein precursor MtrB  23.02 
 
 		 693 aa  134  9e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00712734  normal  0.823248 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2767  outer membrane protein precursor MtrB  22.92 
 
 		 695 aa  132  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.38459  decreased coverage  0.0000000195366 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2527  outer membrane protein precursor MtrB  22.35 
 
 		 699 aa  130  1.0000000000000001e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1476  outer membrane protein precursor MtrB  22.88 
 
 		 704 aa  129  2.0000000000000002e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0583388  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1576  outer membrane protein precursor MtrB  22.62 
 
 		 695 aa  129  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0247408  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1610  outer membrane protein precursor MtrB  22.62 
 
 		 695 aa  129  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.170793 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2580  outer membrane protein precursor MtrB  22.53 
 
 		 695 aa  125  4e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0892811  normal  0.0284758 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2512  outer membrane protein precursor MtrB  22.53 
 
 		 695 aa  124  6e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.481344  hitchhiker  0.00380912 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2678  outer membrane protein precursor MtrB  22.38 
 
 		 695 aa  123  1.9999999999999998e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0120666 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2380  hypothetical protein  22.99 
 
 		 681 aa  109  2e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.573716  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3685  outer membrane protein  20.7 
 
 		 669 aa  84.3  0.000000000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3129  outer membrane protein  20.98 
 
 		 668 aa  81.3  0.00000000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0228  outer membrane protein  20.21 
 
 		 669 aa  81.3  0.00000000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2819  outer membrane protein  23.2 
 
 		 674 aa  79.3  0.0000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.216315  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0232  outer membrane protein  20.58 
 
 		 668 aa  78.2  0.0000000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3627  hypothetical protein  21.97 
 
 		 835 aa  77.8  0.0000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1403  outer membrane protein  20.74 
 
 		 668 aa  77.8  0.0000000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1428  outer membrane protein  20.87 
 
 		 662 aa  75.9  0.000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0626  outer membrane protein  20.66 
 
 		 662 aa  72.8  0.00000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2639  outer membrane protein precursor MtrB  19.75 
 
 		 695 aa  71.2  0.00000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.381518  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2150  outer membrane protein  21.14 
 
 		 669 aa  70.9  0.0000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0260254  normal  0.662224 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003778  outer membrane protein  21.01 
 
 		 660 aa  69.3  0.0000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2693  outer membrane protein, putative  21.93 
 
 		 706 aa  69.7  0.0000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0351  outer membrane protein  20.64 
 
 		 668 aa  69.3  0.0000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.132929 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1212  outer membrane protein, putative  20.05 
 
 		 698 aa  68.6  0.0000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0398  hypothetical protein  22.93 
 
 		 807 aa  62.4  0.00000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.513046 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1529  outer membrane protein, putative  21.37 
 
 		 711 aa  58.5  0.0000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1306  outer membrane protein  22.25 
 
 		 672 aa  58.2  0.0000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000179151 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2924  outer membrane protein  21.49 
 
 		 672 aa  57.4  0.0000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2520  outer membrane protein, putative  22.22 
 
 		 703 aa  53.1  0.00002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.383126  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3676  outer membrane protein  19.85 
 
 		 667 aa  53.5  0.00002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0267  outer membrane protein  20.15 
 
 		 667 aa  52.4  0.00003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2762  outer membrane protein, putative  21.16 
 
 		 716 aa  50.4  0.0001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00885909  hitchhiker  0.000163865 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1592  outer membrane protein, putative  21.16 
 
 		 716 aa  48.5  0.0004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000338536  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1615  outer membrane protein, putative  20.51 
 
 		 716 aa  47.4  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.208848  normal  0.197166 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2229  outer membrane protein  19.29 
 
 		 667 aa  47  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00516967  hitchhiker  0.0011455 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1581  outer membrane protein, putative  21.16 
 
 		 716 aa  47.4  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0408477  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2507  outer membrane protein, putative  23.15 
 
 		 712 aa  44.7  0.007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0767045  decreased coverage  0.000584641 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2959  putative outer membrane protein precursor  22.11 
 
 		 830 aa  44.3  0.008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3860  hypothetical protein  23.55 
 
 		 573 aa  44.3  0.009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00093801  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>