32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_1850 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_1850  hypothetical protein  100 
 
 		 361 aa  744    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3930  hypothetical protein  93.07 
 
 		 361 aa  699    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.939193  normal  0.0133603 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2512  hypothetical protein  75.51 
 
 		 359 aa  547  1e-155  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3788  hypothetical protein  72.59 
 
 		 350 aa  528  1e-149  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4550  hypothetical protein  70.06 
 
 		 346 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.33073  normal  0.671741 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4327  hypothetical protein  69.77 
 
 		 346 aa  507  9.999999999999999e-143  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.513809  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4039  hypothetical protein  69.77 
 
 		 346 aa  495  1e-139  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0438234  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3486  hypothetical protein  69.48 
 
 		 346 aa  491  9.999999999999999e-139  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000698946 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0216  hypothetical protein  67.75 
 
 		 346 aa  491  9.999999999999999e-139  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000223625  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4293  hypothetical protein  60.64 
 
 		 347 aa  417  9.999999999999999e-116  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2312  hypothetical protein  52.81 
 
 		 352 aa  398  9.999999999999999e-111  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3945  hypothetical protein  51.71 
 
 		 350 aa  382  1e-105  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.402122 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1892  hypothetical protein  51.71 
 
 		 350 aa  382  1e-105  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3580  hypothetical protein  51.43 
 
 		 350 aa  380  1e-104  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.792546 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2138  hypothetical protein  50.57 
 
 		 350 aa  374  1e-102  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0606225 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6046  hypothetical protein  44.24 
 
 		 344 aa  286  4e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.588241  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11100  leucyl aminopeptidase (aminopeptidase T)  27.86 
 
 		 316 aa  81.3  0.00000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0394  hypothetical protein  25.07 
 
 		 347 aa  73.2  0.000000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2293  hypothetical protein  26.11 
 
 		 309 aa  67.4  0.0000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.885941 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2649  hypothetical protein  25.09 
 
 		 319 aa  63.2  0.000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0396  hypothetical protein  23.9 
 
 		 338 aa  56.2  0.0000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1162  hypothetical protein  27.94 
 
 		 324 aa  53.1  0.000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.607054  normal  0.216639 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3067  hypothetical protein  25.93 
 
 		 317 aa  52.4  0.00001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0528  aminopeptidase  25.54 
 
 		 316 aa  51.6  0.00002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3010  Leucyl aminopeptidase (aminopeptidase T)-like protein  29.01 
 
 		 314 aa  51.2  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0472619 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3024  hypothetical protein  25.87 
 
 		 374 aa  50.8  0.00004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1947  hypothetical protein  27.88 
 
 		 329 aa  48.1  0.0003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000506957 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2557  aminopeptidase  23.65 
 
 		 317 aa  47.8  0.0003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.495596  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3641  leucyl aminopeptidase (aminopeptidase T)-like protein  26.98 
 
 		 374 aa  48.1  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000266351  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1671  aminopeptidase (leucyl aminopeptidase, aminopeptidase T) 1  24.21 
 
 		 316 aa  47.4  0.0004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.837825 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0213  hypothetical protein  24.42 
 
 		 315 aa  46.6  0.0006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0343  hypothetical protein  26.02 
 
 		 318 aa  43.9  0.004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>