23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_1347 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_1347  hypothetical protein  100 
 
 		 221 aa  431  1e-120  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4081  hypothetical protein  66.11 
 
 		 186 aa  219  1.9999999999999999e-56  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0579  protein of unknown function DUF583  69.28 
 
 		 184 aa  216  2e-55  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0600  hypothetical protein  69.28 
 
 		 184 aa  215  5e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.927633  normal  0.296784 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5284  protein of unknown function DUF583  65.9 
 
 		 171 aa  211  7.999999999999999e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0430  hypothetical protein  62.72 
 
 		 183 aa  201  9.999999999999999e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0688488  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0290  hypothetical protein  61.14 
 
 		 185 aa  199  3e-50  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3896  hypothetical protein  57.3 
 
 		 184 aa  195  5.000000000000001e-49  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1801  hypothetical protein  52 
 
 		 185 aa  166  2e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.316822 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0798  hypothetical protein  71 
 
 		 185 aa  157  9e-38  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.188487  normal  0.0126197 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1225  protein of unknown function DUF583  70 
 
 		 189 aa  154  8e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.933167  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2700  hypothetical protein  50.74 
 
 		 224 aa  140  9.999999999999999e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.503004  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0746  hypothetical protein  39.86 
 
 		 223 aa  102  3e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0151  hypothetical protein  38.26 
 
 		 247 aa  92  7e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1308  protein of unknown function DUF583  41.67 
 
 		 162 aa  87.4  2e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.677275  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2023  hypothetical protein  40.97 
 
 		 156 aa  76.6  0.0000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3818  hypothetical protein  30.43 
 
 		 119 aa  48.1  0.00009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3530  hypothetical protein  30.43 
 
 		 119 aa  47  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1928  hypothetical protein  27.2 
 
 		 220 aa  47.4  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.238689  normal  0.284182 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3835  hypothetical protein  30.43 
 
 		 119 aa  47  0.0002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2201  hypothetical protein  32.91 
 
 		 109 aa  42  0.007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2611  hypothetical protein  31.97 
 
 		 148 aa  42  0.007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.135268  hitchhiker  0.000000504618 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4317  hypothetical protein  25.69 
 
 		 131 aa  41.6  0.009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>