44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DET0581 on replicon NC_002936
Organism: Dehalococcoides ethenogenes 195



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002936  DET0581  hypothetical protein  100 
 
 
240 aa  493  9.999999999999999e-139  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.168096  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_520  hypothetical protein  85.77 
 
 
240 aa  422  1e-117  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000394535  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0555  DNA alkylation repair enzyme-like protein  82.68 
 
 
240 aa  400  9.999999999999999e-111  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1298  hypothetical protein  50.22 
 
 
235 aa  229  4e-59  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4304  hypothetical protein  52.78 
 
 
218 aa  225  4e-58  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.648821  normal  0.0130561 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2664  hypothetical protein  44.89 
 
 
229 aa  204  8e-52  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0836  hypothetical protein  48.11 
 
 
219 aa  202  4e-51  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.206706 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1596  hypothetical protein  38.86 
 
 
232 aa  158  6e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.186177  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2310  hypothetical protein  38.67 
 
 
227 aa  157  2e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.854868 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2073  hypothetical protein  39.37 
 
 
227 aa  154  2e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2734  hypothetical protein  33.13 
 
 
227 aa  93.2  3e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000970803  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2978  hypothetical protein  33.74 
 
 
227 aa  92.8  4e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000992399  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2946  hypothetical protein  31.9 
 
 
227 aa  90.5  2e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00729869  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2986  hypothetical protein  32.52 
 
 
227 aa  89.4  4e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000288545  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2941  hypothetical protein  31.9 
 
 
227 aa  89.4  5e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000572479  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2940  hypothetical protein  31.9 
 
 
227 aa  89.4  5e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.6684100000000001e-56 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2732  hypothetical protein  31.9 
 
 
227 aa  89.4  5e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0265845  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2299  hypothetical protein  31.9 
 
 
227 aa  89  7e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0222691  hitchhiker  5.32762e-16 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2683  hypothetical protein  31.9 
 
 
227 aa  88.2  1e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000553491  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2660  hypothetical protein  31.9 
 
 
227 aa  87  3e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.113458  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0294  protein of unknown function DUF1061  32.74 
 
 
234 aa  82.4  0.000000000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.508637  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2256  hypothetical protein  28.35 
 
 
234 aa  63.5  0.000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.37928  normal  0.0533483 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3446  hypothetical protein  27.78 
 
 
220 aa  62  0.000000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1553  hypothetical protein  25.13 
 
 
222 aa  59.7  0.00000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.307001 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3386  protein of unknown function DUF1061  23.81 
 
 
235 aa  59.7  0.00000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1291  DNA alkylation repair enzyme  25.76 
 
 
233 aa  57.8  0.0000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.454392  normal  0.402353 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0067  hypothetical protein  24.07 
 
 
223 aa  51.6  0.00001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2658  protein of unknown function DUF1061  22.4 
 
 
236 aa  50.8  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3204  hypothetical protein  24.69 
 
 
227 aa  50.8  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.803331  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2988  hypothetical protein  23.49 
 
 
235 aa  48.1  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000939837  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3313  hypothetical protein  23.49 
 
 
235 aa  48.5  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3335  hypothetical protein  23.49 
 
 
229 aa  48.5  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.694909  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3091  hypothetical protein  23.49 
 
 
235 aa  48.5  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0104599  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0909  hypothetical protein  27.44 
 
 
217 aa  47.4  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.296771  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1043  hypothetical protein  22.42 
 
 
235 aa  47.4  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0529  hypothetical protein  22.22 
 
 
227 aa  45.8  0.0007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0164114  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3305  hypothetical protein  22.29 
 
 
235 aa  45.1  0.0009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0726  hypothetical protein  26.17 
 
 
225 aa  44.7  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0505  hypothetical protein  42.59 
 
 
221 aa  44.3  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.459483  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3298  hypothetical protein  21.69 
 
 
235 aa  43.5  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.910615  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4757  DNA alkylation repair enzyme  23.16 
 
 
234 aa  43.5  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.725796  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3188  hypothetical protein  24.74 
 
 
227 aa  43.1  0.003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5568  hypothetical protein  24.07 
 
 
221 aa  43.1  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.982925  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3273  hypothetical protein  23.81 
 
 
235 aa  42.7  0.005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0179286  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>