34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan8802_0951 on replicon NC_013161
Organism: Cyanothece sp. PCC 8802



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013161  Cyan8802_0951  chromosome segregation and condensation protein ScpA  100 
 
 
256 aa  514  1.0000000000000001e-145  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0924  chromosome segregation and condensation protein ScpA  99.61 
 
 
256 aa  513  1e-144  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1510  chromosome segregation and condensation protein ScpA  54.69 
 
 
256 aa  271  9e-72  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000966979 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3703  chromosome segregation and condensation protein ScpA  47.33 
 
 
248 aa  207  1e-52  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.971472  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1974  condensin subunit ScpA  44.24 
 
 
278 aa  197  2.0000000000000003e-49  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.776999 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3421  condensin subunit ScpA  45.15 
 
 
274 aa  185  6e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1145  condensin subunit ScpA  41.7 
 
 
284 aa  179  2.9999999999999997e-44  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0595963  hitchhiker  0.00600954 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1848  chromosome segregation and condensation protein ScpA  42.59 
 
 
286 aa  169  6e-41  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.448814  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02231  hypothetical protein  38.76 
 
 
297 aa  145  7.0000000000000006e-34  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1517  hypothetical protein  38.76 
 
 
297 aa  144  2e-33  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2403  putative segregation and condensation protein A  38.7 
 
 
300 aa  139  3.9999999999999997e-32  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.389122  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0290  putative segregation and condensation protein A  38.4 
 
 
307 aa  135  7.000000000000001e-31  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01671  hypothetical protein  35.51 
 
 
296 aa  132  6.999999999999999e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26721  hypothetical protein  38.49 
 
 
300 aa  116  3e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01791  hypothetical protein  31.87 
 
 
277 aa  116  3.9999999999999997e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01681  hypothetical protein  32.64 
 
 
273 aa  113  3e-24  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.450973  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01701  hypothetical protein  33.06 
 
 
273 aa  111  1.0000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0153  hypothetical protein  32.64 
 
 
273 aa  108  1e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2184  chromosome segregation and condensation protein ScpA  30.5 
 
 
255 aa  82.4  0.000000000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0748  chromosome segregation and condensation protein ScpA  29.46 
 
 
238 aa  77  0.0000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0457996  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2737  chromosome segregation and condensation protein ScpA  28.16 
 
 
299 aa  77.8  0.0000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.577112  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1830  chromosome segregation and condensation protein ScpA  26.52 
 
 
250 aa  72  0.000000000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1011  condensin subunit ScpA  28.02 
 
 
253 aa  69.3  0.00000000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.685255 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1498  condensin subunit ScpA  27.67 
 
 
285 aa  66.6  0.0000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00138218  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0593  condensin subunit ScpA  26.36 
 
 
339 aa  59.7  0.00000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2588  chromosome segregation and condensation protein ScpA  23.66 
 
 
405 aa  59.3  0.00000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.342818  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0026  chromosome segregation and condensation protein ScpA  24.6 
 
 
244 aa  57.4  0.0000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1340  chromosome segregation and condensation protein ScpA  23.55 
 
 
386 aa  55.1  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1160  chromosome segregation and condensation protein ScpA  22.73 
 
 
221 aa  52.8  0.000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0528  chromosome segregation and condensation protein ScpA  31.88 
 
 
322 aa  52  0.000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.769453  normal  0.399884 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3001  chromosome segregation and condensation protein ScpA  34.43 
 
 
364 aa  48.1  0.0002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.428168  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0018  chromosome segregation and condensation protein ScpA  20.63 
 
 
202 aa  43.5  0.004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0829  chromosome segregation and condensation protein ScpA  23.79 
 
 
222 aa  43.1  0.005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1382  chromosome segregation and condensation protein ScpA  22.1 
 
 
285 aa  42.4  0.007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0547025  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>