36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_0143 on replicon NC_011885
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011885  Cyan7425_0143  transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 		 825 aa  1698    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.514651 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3339  transcriptional regulator, XRE family  38.01 
 
 		 733 aa  508  9.999999999999999e-143  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0528  XRE family transcriptional regulator  30.96 
 
 		 738 aa  310  5.9999999999999995e-83  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.932255  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0711  transcriptional regulator, XRE family  29.27 
 
 		 527 aa  54.7  0.000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2611  XRE family transcriptional regulator  36.25 
 
 		 135 aa  51.6  0.00006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0796411  hitchhiker  0.0000000000000114 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2577  XRE family transcriptional regulator  36.25 
 
 		 135 aa  51.6  0.00006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0918178  hitchhiker  0.000133769 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1447  putative transcription regulator protein  39.29 
 
 		 84 aa  50.4  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3260  transcriptional regulator, XRE family  46.15 
 
 		 513 aa  48.1  0.0007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0795644  normal  0.23679 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2910  dynamin family protein  34.78 
 
 		 605 aa  47  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.518789  normal  0.400566 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0337  conserved hypothetical protein, predicted ATP/GTP-binding protein  37.04 
 
 		 605 aa  47  0.001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1286  transcriptional regulator, XRE family  41.67 
 
 		 197 aa  47.8  0.001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0709374  normal  1 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5314  hypothetical protein  27.54 
 
 		 952 aa  47.8  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1396  hypothetical protein  41.18 
 
 		 794 aa  46.6  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.318277 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1070  hypothetical protein  41.18 
 
 		 798 aa  46.2  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0611355 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0094  transcriptional regulator, XRE family  42.31 
 
 		 85 aa  46.6  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.850445  normal  0.0181777 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3970  XRE family transcriptional regulator  44.9 
 
 		 135 aa  47  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2672  transcriptional regulator, XRE family  36.84 
 
 		 118 aa  46.6  0.002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000679525  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4397  XRE family transcriptional regulator  44.9 
 
 		 135 aa  47  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.78876 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3946  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  42.31 
 
 		 91 aa  45.8  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1545  GTP-binding protein  43.9 
 
 		 569 aa  45.4  0.004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.712051  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1535  transcriptional regulator, LacI family  46.15 
 
 		 465 aa  45.4  0.004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.38669  decreased coverage  0.00974115 
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0039  DNA-binding protein  44.23 
 
 		 95 aa  45.4  0.005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.514774  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1414  XRE family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 179 aa  45.1  0.005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0298473 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0970  Cro/CI family transcriptional regulator  39.22 
 
 		 95 aa  45.1  0.006  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0726306  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0681  putative transcriptionl regulator HipB  37.5 
 
 		 134 aa  45.1  0.006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2151  putative transcriptionl regulator HipB  37.5 
 
 		 136 aa  45.1  0.006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.690845  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2236  putative transcriptionl regulator HipB  37.5 
 
 		 136 aa  45.1  0.006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.74282  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2003  HipB domain-containing protein  37.5 
 
 		 134 aa  45.1  0.006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3036  dynamin family protein  46.34 
 
 		 614 aa  45.1  0.006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0241135  normal  0.688737 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2994  dynamin family protein  46.34 
 
 		 614 aa  45.1  0.006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.214598  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1592  HipB domain-containing protein  37.5 
 
 		 134 aa  45.1  0.006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0436  GTP-binding protein  43.9 
 
 		 569 aa  44.7  0.007  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5326  transcriptional regulator, XRE family  36.84 
 
 		 68 aa  44.7  0.007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.134062 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5958  XRE family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 134 aa  44.3  0.009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0591  XRE family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 113 aa  44.3  0.009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4224  XRE family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 161 aa  44.3  0.01  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>