18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_1968 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013739  Cwoe_1968  KAP P-loop domain protein  100 
 
 
1137 aa  2300    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.624623 
 
 
-
 
NC_013748  Htur_5045  KAP P-loop domain protein  27.64 
 
 
1093 aa  158  7e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2201  KAP P-loop  25.44 
 
 
1128 aa  81.6  0.00000000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0936  KAP P-loop domain protein  22.15 
 
 
647 aa  73.2  0.00000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2211  KAP P-loop  22.77 
 
 
650 aa  73.2  0.00000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1472  KAP P-loop  22.15 
 
 
644 aa  70.5  0.0000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.628222  normal 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4250  KAP P-loop domain-containing protein  22.74 
 
 
594 aa  60.1  0.0000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000235835 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28360  KAP family P-loop domain protein  21.2 
 
 
564 aa  59.3  0.0000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.143031 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2881  KAP P-loop domain-containing protein  25.05 
 
 
671 aa  57.4  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.660206  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6139  KAP P-loop domain-containing protein  27.01 
 
 
591 aa  57  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1598  KAP P-loop domain protein  22.35 
 
 
749 aa  48.1  0.0008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0661  ATPase  21.43 
 
 
615 aa  48.1  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.204839  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4815  KAP P-loop domain-containing protein  20.34 
 
 
623 aa  48.1  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.678803  normal 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0090  hypothetical protein  26.32 
 
 
706 aa  47.8  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0396414  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2164  KAP P-loop  21.99 
 
 
622 aa  46.6  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0010  KAP P-loop domain-containing protein  29.7 
 
 
728 aa  46.6  0.002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00154725 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0675  KAP P-loop domain-containing protein  23.35 
 
 
513 aa  45.8  0.004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1445  KAP P-loop domain protein  22.61 
 
 
461 aa  45.4  0.006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.48405  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>