18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_2032 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009012  Cthe_2032  hypothetical protein  100 
 
 
2004 aa  4053    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2833  hypothetical protein  98.11 
 
 
115 aa  213  2e-53  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0245785  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1990  hypothetical protein  98.11 
 
 
115 aa  213  2e-53  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.31205  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2859  hypothetical protein  96.74 
 
 
115 aa  159  5.0000000000000005e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000805439  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0670  hypothetical protein  29.88 
 
 
1024 aa  124  1.9999999999999998e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.680595  normal  0.165032 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0101  hypothetical protein  29.01 
 
 
1314 aa  108  2e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.470357 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2132  hypothetical protein  34.8 
 
 
646 aa  97.4  2e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2918  hypothetical protein  30.95 
 
 
873 aa  76.3  0.000000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2884  hypothetical protein  27.35 
 
 
1017 aa  75.9  0.000000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1163  PKD  26.25 
 
 
1189 aa  68.2  0.000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.185385  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1804  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  31.33 
 
 
1482 aa  65.1  0.00000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2426  PKD  23.91 
 
 
1814 aa  55.5  0.00001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.217586  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3268  hypothetical protein  25.45 
 
 
425 aa  50.8  0.0002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0420  PKD  27.43 
 
 
1236 aa  50.4  0.0004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0326903  normal  0.301523 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1944  hypothetical protein  34.69 
 
 
679 aa  49.3  0.0007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.540087  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2598  hypothetical protein  25.59 
 
 
369 aa  47.8  0.002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2923  cell wall surface anchor family protein  25.84 
 
 
746 aa  48.1  0.002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0767  hypothetical protein  25 
 
 
1804 aa  46.2  0.007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>