33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_1176 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_1176  CheC-like protein  100 
 
 		 148 aa  288  2e-77  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1446  CheX protein (uncharacterized ORF in chemotaxis operon)  35.25 
 
 		 152 aa  71.2  0.000000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.238883  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0126  CheC-like protein  31.3 
 
 		 154 aa  62.4  0.000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000893437  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2134  CheC domain protein  33.33 
 
 		 158 aa  62  0.000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2279  CheC domain protein  33.06 
 
 		 154 aa  62  0.000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0352491  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2263  CheC domain protein  40.24 
 
 		 152 aa  61.6  0.000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000104148  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1282  CheC domain-containing protein  40.24 
 
 		 155 aa  62  0.000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.233529  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1173  CheC domain-containing protein  40.24 
 
 		 155 aa  62  0.000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.362697  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0484  CheC domain-containing protein  36.26 
 
 		 155 aa  53.5  0.0000009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0634  CheC domain protein  36.56 
 
 		 160 aa  53.5  0.000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1932  CheC domain protein  28.79 
 
 		 157 aa  51.2  0.000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0227289  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0826  CheC domain-containing protein  37.8 
 
 		 155 aa  50.8  0.000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0151  CheC domain-containing protein  35.59 
 
 		 156 aa  49.7  0.00001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.176363  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1196  chemotaxis protein CheX, putative  35.9 
 
 		 160 aa  48.9  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.5213  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1493  chemotaxis protein CheX  31.2 
 
 		 154 aa  48.1  0.00004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0567  hypothetical protein  34.15 
 
 		 157 aa  48.1  0.00004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00522543  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1768  inhibitor of MCP methylation-like protein  30.77 
 
 		 159 aa  47  0.00009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0985649  hitchhiker  0.00193959 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1531  CheC, inhibitor of MCP methylation  35.23 
 
 		 357 aa  47  0.0001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.226498  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3283  inhibitor of MCP methylation CheC-like protein  32.2 
 
 		 166 aa  46.6  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2308  CheC-like protein  33.75 
 
 		 154 aa  46.2  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0281  chemotaxis protein CheX, putative  27.48 
 
 		 155 aa  46.2  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.180055  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2679  chemotaxis protein CheX, putative  32.61 
 
 		 155 aa  44.3  0.0006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.513529 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2921  hypothetical protein  36.25 
 
 		 184 aa  44.3  0.0006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2875  CheC domain protein  31.82 
 
 		 171 aa  43.9  0.0008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1768  CheC-like protein  26.35 
 
 		 165 aa  43.1  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1817  chemotaxis protein CheX, putative  28.15 
 
 		 154 aa  43.5  0.001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0966  inhibitor of MCP methylation CheC-like protein  30.51 
 
 		 166 aa  43.5  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3060  hypothetical protein  30.19 
 
 		 166 aa  42.7  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00029683  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2232  CheC domain protein  29.46 
 
 		 158 aa  42.4  0.002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0308  hypothetical protein  29.93 
 
 		 162 aa  42.4  0.002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000030204  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1829  hypothetical protein  34.09 
 
 		 168 aa  40.8  0.006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.666718  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1092  putative chemotaxis protein CheX  31.03 
 
 		 159 aa  40.4  0.008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.391751 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0404  hypothetical protein  38.75 
 
 		 168 aa  40.4  0.008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.639025  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>