More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_3292 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007963  Csal_3292  chromosome segregation DNA-binding protein  100 
 
 		 306 aa  593  1e-168  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5439  parB-like partition protein  60.66 
 
 		 290 aa  338  5.9999999999999996e-92  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4009  chromosome segregation DNA-binding protein  55.38 
 
 		 304 aa  338  5.9999999999999996e-92  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0625805 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0001  parB-like partition protein  60.33 
 
 		 290 aa  335  5.999999999999999e-91  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000184934 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5303  parB-like partition protein  60.33 
 
 		 290 aa  335  5.999999999999999e-91  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.157969  normal  0.0415765 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4615  chromosome segregation DNA-binding protein  59.34 
 
 		 289 aa  333  2e-90  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5208  parB-like partition protein  59.34 
 
 		 290 aa  327  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3883  parB-like partition protein  61.87 
 
 		 295 aa  319  3.9999999999999996e-86  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0441095  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73330  chromosome partitioning protein Spo0J  59.67 
 
 		 290 aa  319  3.9999999999999996e-86  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3082  ParB-like partition protein  56.39 
 
 		 291 aa  315  5e-85  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0110147  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6364  chromosome partitioning protein Spo0J  59.02 
 
 		 290 aa  315  7e-85  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52240  chromosome partition ParB  60.46 
 
 		 294 aa  313  1.9999999999999998e-84  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5607  ParB family protein  58.63 
 
 		 290 aa  311  9e-84  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3652  ParB family protein  55.88 
 
 		 292 aa  307  1.0000000000000001e-82  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0209333  unclonable  0.00000847343 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5129  ParB-like partition protein  57.33 
 
 		 290 aa  307  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.968152 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5738  chromosome segregation DNA-binding protein  58.36 
 
 		 290 aa  307  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00193091  normal  0.451266 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3760  parB-like partition proteins  56.21 
 
 		 294 aa  306  2.0000000000000002e-82  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0200998  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4755  ParB family protein  54.25 
 
 		 292 aa  304  2.0000000000000002e-81  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3933  chromosome segregation DNA-binding protein  54.19 
 
 		 292 aa  303  2.0000000000000002e-81  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000290836  hitchhiker  0.00288573 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4025  chromosome segregation DNA-binding protein  54.19 
 
 		 292 aa  303  3.0000000000000004e-81  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.006539  normal  0.910655 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4138  chromosome segregation DNA-binding protein  54.19 
 
 		 292 aa  302  4.0000000000000003e-81  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.001205  hitchhiker  0.000138083 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3853  parB-like partition protein  54.05 
 
 		 292 aa  301  1e-80  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0431793  unclonable  0.00000203867 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3964  parB-like partition protein  52.9 
 
 		 292 aa  300  2e-80  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.20429  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4373  parB-like partition protein  52.9 
 
 		 292 aa  296  2e-79  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000487851  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4515  parB-like partition protein  52.9 
 
 		 292 aa  296  2e-79  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0559335  normal  0.0103959 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4318  parB-like partition protein  52.9 
 
 		 292 aa  296  2e-79  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0394503  hitchhiker  0.000000000117233 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4374  parB-like partition protein  52.9 
 
 		 292 aa  296  2e-79  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000285839  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3313  ParB-like partition protein  55.23 
 
 		 286 aa  294  1e-78  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.267567  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4303  parB-like partition proteins  51.96 
 
 		 290 aa  292  4e-78  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.279457  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4906  parB-like partition protein  51.46 
 
 		 296 aa  291  7e-78  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00066278  normal  0.174016 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4248  parB-like partition protein  51.94 
 
 		 294 aa  291  1e-77  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00203372  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4494  ParB family protein  52.12 
 
 		 294 aa  290  2e-77  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00131449  hitchhiker  0.00000708734 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0195  chromosome partitioning protein  51.62 
 
 		 290 aa  286  2.9999999999999996e-76  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2128  ParB-like partition protein  51.62 
 
 		 288 aa  285  5e-76  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4053  parB-like partition proteins  54.58 
 
 		 293 aa  285  8e-76  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5044  parB family protein  52.63 
 
 		 300 aa  285  9e-76  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04091  ParB family protein  53.92 
 
 		 292 aa  283  2.0000000000000002e-75  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00869743  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0207  parB-like partition protein  52.94 
 
 		 283 aa  280  2e-74  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4470  parB-like partition protein  50.83 
 
 		 294 aa  277  1e-73  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000450981  hitchhiker  0.00000000228393 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2595  parB-like partition protein  51.16 
 
 		 280 aa  277  2e-73  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0581078  normal  0.0919239 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3278  chromosome segregation DNA-binding protein  50.99 
 
 		 305 aa  275  8e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.325017  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0113  parB-like partition protein  50.66 
 
 		 297 aa  274  1.0000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2959  parB-like partition proteins  50.66 
 
 		 297 aa  274  1.0000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0096  parB-like partition proteins  50.66 
 
 		 305 aa  274  1.0000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2877  parB-like partition proteins  54.28 
 
 		 287 aa  271  7e-72  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.754153  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3979  ParB family protein  50 
 
 		 295 aa  270  2e-71  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0625323  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1596  putative stage 0 sporulation protein J  50 
 
 		 295 aa  270  2e-71  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.265363  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2947  stage 0 sporulation protein J, putative  50 
 
 		 295 aa  270  2e-71  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0187  chromosome partitioning protein ParB  50 
 
 		 295 aa  270  2e-71  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0323647  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3317  stage 0 sporulation protein J, putative  49.67 
 
 		 295 aa  270  2e-71  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3006  putative stage 0 sporulation protein J  50 
 
 		 295 aa  270  2e-71  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3902  parB-like partition protein  50 
 
 		 295 aa  270  2e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4053  ParB family protein  50 
 
 		 295 aa  270  2e-71  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3364  putative stage 0 sporulation protein J  50 
 
 		 295 aa  270  2e-71  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0031  chromosome segregation DNA-binding protein  50.33 
 
 		 295 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3036  parB-like partition protein  49.35 
 
 		 310 aa  267  2e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3965  parB-like partition protein  50.81 
 
 		 307 aa  263  2e-69  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4106  chromosome segregation DNA-binding protein  48.87 
 
 		 284 aa  263  3e-69  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000709761  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2752  chromosome segregation DNA-binding protein  50.33 
 
 		 286 aa  261  6.999999999999999e-69  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000743085  normal  0.651861 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2438  parB-like partition proteins  52.72 
 
 		 297 aa  259  5.0000000000000005e-68  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.291744  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0096  parB-like partition protein  50.99 
 
 		 297 aa  258  8e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0087  parB-like partition proteins  50.66 
 
 		 305 aa  256  3e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.183022  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0097  parB-like partition protein  50.98 
 
 		 297 aa  255  8e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.328689  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3520  parB-like partition protein  47.42 
 
 		 303 aa  254  1.0000000000000001e-66  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000243626 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02929  chromosome partitioning protein  48.87 
 
 		 309 aa  254  1.0000000000000001e-66  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0004  ParB family protein  51.32 
 
 		 282 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.177803  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3325  putative chromosome partitioning protein PARB  46.45 
 
 		 303 aa  253  3e-66  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00569301  normal  0.133715 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3195  parB-like partition protein  47.42 
 
 		 303 aa  253  3e-66  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3067  putative chromosome partitioning protein ParB  46.75 
 
 		 294 aa  248  7e-65  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1473  chromosome partitioning protein  49.2 
 
 		 310 aa  246  3e-64  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1399  parB-like partition protein  50 
 
 		 310 aa  246  4e-64  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00430  chromosome partitioning protein  47.67 
 
 		 293 aa  245  8e-64  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002022  chromosome (plasmid) partitioning protein ParB/stage 0 sporulation protein J  44.81 
 
 		 293 aa  243  3.9999999999999997e-63  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000100798  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2520  ParB family protein  48.49 
 
 		 293 aa  242  6e-63  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000102448  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2174  parB-like partition proteins  44.08 
 
 		 289 aa  239  5e-62  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000145902  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3780  chromosome segregation DNA-binding protein  51.79 
 
 		 303 aa  236  3e-61  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000296744 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2767  parB-like partition proteins  51.68 
 
 		 285 aa  236  4e-61  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  unclonable  0.000000194668  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2815  parB-like partition protein  50 
 
 		 294 aa  234  1.0000000000000001e-60  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.121053  normal  0.211024 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0001  hypothetical protein  45.91 
 
 		 291 aa  234  1.0000000000000001e-60  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.115851  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3211  parB family protein  50 
 
 		 294 aa  234  1.0000000000000001e-60  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010115  COXBURSA331_0033  ParB-like partition domain-containing protein  45.77 
 
 		 289 aa  234  1.0000000000000001e-60  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009726  CBUD_A0065  chromosome partitioning protein  45.77 
 
 		 315 aa  234  2.0000000000000002e-60  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.446293  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3503  chromosome segregation DNA-binding protein  50.49 
 
 		 300 aa  231  1e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.156732 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2663  parB-like partition protein  44.85 
 
 		 300 aa  229  4e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0851711  normal  0.479198 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2805  hypothetical protein  46.01 
 
 		 289 aa  226  5.0000000000000005e-58  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0053  parB-like partition proteins  45.45 
 
 		 313 aa  226  5.0000000000000005e-58  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3354  chromosome segregation DNA-binding protein  50 
 
 		 300 aa  225  6e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0078  chromosome segregation DNA-binding protein  44.06 
 
 		 311 aa  225  8e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2951  hypothetical protein  45.59 
 
 		 301 aa  225  9e-58  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2887  parB-like partition proteins  44.19 
 
 		 296 aa  224  1e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1225  chromosome segregation DNA-binding protein  44.19 
 
 		 301 aa  224  1e-57  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0198  parB-like partition protein  46.47 
 
 		 302 aa  224  1e-57  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.395189 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0007  parB-like partition proteins  43.48 
 
 		 292 aa  224  2e-57  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3738  parB-like partition proteins  42.39 
 
 		 305 aa  222  4.9999999999999996e-57  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.927057  normal  0.412058 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1396  parB-like partition protein  47.6 
 
 		 362 aa  222  4.9999999999999996e-57  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0186141  hitchhiker  0.0000927483 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1319  chromosome segregation DNA-binding protein  45.96 
 
 		 375 aa  221  9.999999999999999e-57  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3458  chromosome partitioning protein parB  45.21 
 
 		 299 aa  221  9.999999999999999e-57  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0051  parB-like partition protein  44.38 
 
 		 311 aa  221  9.999999999999999e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2513  hypothetical protein  44.92 
 
 		 263 aa  220  1.9999999999999999e-56  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1068  parB-like partition proteins  42.95 
 
 		 303 aa  221  1.9999999999999999e-56  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.701967  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>