125 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_3098 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007963  Csal_3098  SmpA/OmlA  100 
 
 
143 aa  295  2e-79  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4509  outer membrane lipoprotein OmlA  48.96 
 
 
173 aa  99  2e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.292937  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4199  SmpA/OmlA  48.96 
 
 
173 aa  99.4  2e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0701  SmpA/OmlA domain-containing protein  37.91 
 
 
178 aa  98.2  4e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.410018  hitchhiker  0.0000863527 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0759  SmpA/OmlA  44.76 
 
 
175 aa  96.7  1e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.321771 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2737  small protein A (tmRNA-binding)-like  42.15 
 
 
131 aa  95.1  3e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000000974363  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43020  outer membrane lipoprotein OmlA  45 
 
 
171 aa  90.9  5e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0476  SmpA/OmlA  38.38 
 
 
233 aa  90.9  6e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4732  SmpA/OmlA domain-containing protein  45.45 
 
 
178 aa  90.5  7e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.592236  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3628  SmpA/OmlA domain-containing protein  46.25 
 
 
172 aa  90.1  8e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4731  SmpA/OmlA domain protein  45.45 
 
 
178 aa  89.7  1e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00865323 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4597  SmpA/OmlA domain-containing protein  45.45 
 
 
178 aa  90.1  1e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0944638 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1906  SmpA/OmlA domain-containing protein  44.44 
 
 
117 aa  88.2  3e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2051  SmpA/OmlA domain protein  40.62 
 
 
120 aa  87.4  7e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5485  outer membrane lipoprotein OmlA  42.86 
 
 
187 aa  85.9  2e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1124  hypothetical protein  41.35 
 
 
342 aa  85.1  3e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.167997  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63030  outer membrane lipoprotein OmlA precursor  43.3 
 
 
176 aa  85.1  3e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0475  SmpA/OmlA domain-containing protein  37.74 
 
 
182 aa  84.3  5e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0935  SmpA/OmlA  38.4 
 
 
160 aa  84.3  6e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.970773 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0776  SmpA/OmlA  31.65 
 
 
281 aa  82.8  0.000000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.880566  hitchhiker  0.000137115 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2736  SmpA/OmlA domain-containing protein  42.7 
 
 
273 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.724762 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0545  SmpA/OmlA domain-containing protein  41.57 
 
 
265 aa  82  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0731757  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0571  SmpA/OmlA domain-containing protein  41.57 
 
 
265 aa  82  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.253801 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1728  SmpA/OmlA domain protein  39.39 
 
 
135 aa  81.3  0.000000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1654  SmpA/OmlA  33.93 
 
 
185 aa  80.9  0.000000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2622  small protein A  35.71 
 
 
161 aa  80.1  0.000000000000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.627483  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2746  putative lipoprotein transmembrane  41.57 
 
 
219 aa  79.7  0.00000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2769  hypothetical protein  40.4 
 
 
113 aa  79.7  0.00000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0179366  normal  0.124588 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1195  SmpA/OmlA  37.25 
 
 
196 aa  79.3  0.00000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1207  outer membrane lipoprotein, putatitve  40.45 
 
 
267 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.87413  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1058  SmpA/OmlA domain protein  39.39 
 
 
113 aa  77.8  0.00000000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.276511  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02469  hypothetical protein  39.39 
 
 
113 aa  77.8  0.00000000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.10509  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2775  hypothetical protein  39.39 
 
 
113 aa  77.8  0.00000000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000494062  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2901  hypothetical protein  39.39 
 
 
113 aa  77.8  0.00000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.301484  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1067  hypothetical protein  39.39 
 
 
113 aa  77.8  0.00000000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.261293  normal  0.540177 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3857  hypothetical protein  39.39 
 
 
113 aa  77.8  0.00000000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00570631  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3456  outer membrane lipoprotein, putatitve  39.33 
 
 
251 aa  77.4  0.00000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0374  SmpA/OmlA family lipoprotein  39.33 
 
 
242 aa  77.4  0.00000000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2457  outer membrane lipoprotein, putatitve  39.33 
 
 
276 aa  77  0.00000000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3419  SmpA/OmlA family lipoprotein  39.33 
 
 
263 aa  77.4  0.00000000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.458143  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3454  SmpA/OmlA family lipoprotein  39.33 
 
 
263 aa  77.4  0.00000000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.146935  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2644  SmpA/OmlA family lipoprotein  39.33 
 
 
263 aa  77.4  0.00000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3006  hypothetical protein  39.39 
 
 
113 aa  77  0.00000000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00281492  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1233  SmpA/OmlA family lipoprotein  39.33 
 
 
279 aa  77  0.00000000000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0167  SmpA/OmlA  37.08 
 
 
268 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0650  SmpA/OmlA domain-containing protein  37.08 
 
 
268 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1605  Outer membrane lipoprotein OmlA  34.95 
 
 
148 aa  76.3  0.0000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.730668  normal  0.548797 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0966  outer membrane lipoprotein  37.74 
 
 
117 aa  76.3  0.0000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0617  SmpA/OmlA domain-containing protein  37.08 
 
 
268 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.381857  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3736  outer membrane lipoprotein, SmpA/OmlA  38.2 
 
 
272 aa  76.3  0.0000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.214192 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3097  hypothetical protein  38.38 
 
 
113 aa  75.9  0.0000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.525418  normal  0.376087 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2575  SmpA/OmlA domain protein  42.67 
 
 
218 aa  75.9  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2880  hypothetical protein  37.37 
 
 
112 aa  75.1  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.183731 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3299  hypothetical protein  38.54 
 
 
114 aa  75.1  0.0000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.405859  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2900  hypothetical protein  37.37 
 
 
112 aa  75.1  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.748981 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3012  hypothetical protein  37.37 
 
 
112 aa  75.1  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2830  hypothetical protein  37.37 
 
 
112 aa  75.1  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.015187  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2898  hypothetical protein  37.37 
 
 
112 aa  75.1  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3219  hypothetical protein  42.05 
 
 
112 aa  73.9  0.0000000000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2985  SmpA/OmlA domain protein  41.33 
 
 
218 aa  73.9  0.0000000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3826  SmpA/OmlA family protein  33.61 
 
 
144 aa  73.6  0.0000000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.336392  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3687  hypothetical protein  37.25 
 
 
112 aa  73.6  0.0000000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0028904  normal  0.0506936 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4609  SmpA/OmlA  38.3 
 
 
170 aa  72.8  0.000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1069  SmpA/OmlA domain-containing protein  32.65 
 
 
199 aa  73.2  0.000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0962  hypothetical protein  40 
 
 
111 aa  72.8  0.000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.719201  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2890  hypothetical protein  40 
 
 
113 aa  72.8  0.000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000014061  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0727  hypothetical protein  40.23 
 
 
111 aa  72.4  0.000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.405452  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0754  SmpA/OmlA  37.5 
 
 
170 aa  71.2  0.000000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0407  SmpA/OmlA domain protein  35.51 
 
 
186 aa  71.2  0.000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1375  hypothetical protein  38.95 
 
 
113 aa  70.9  0.000000000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000233732  normal  0.0312807 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2977  hypothetical protein  38.95 
 
 
113 aa  70.9  0.000000000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.140554  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3923  SmpA/OmlA domain-containing protein  32.98 
 
 
183 aa  70.5  0.000000000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3271  SmpA/OmlA domain protein  32.98 
 
 
183 aa  70.5  0.000000000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0222  small protein A (tmRNA-binding)-like protein  32 
 
 
183 aa  70.1  0.000000000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0572  putative outer membrane lipoprotein  27.73 
 
 
288 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3790  SmpA/OmlA domain-containing protein  35.37 
 
 
204 aa  70.1  0.00000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3366  SmpA/OmlA domain-containing protein  32.32 
 
 
110 aa  68.9  0.00000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.0061494  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2836  SmpA/OmlA  39.19 
 
 
207 aa  68.6  0.00000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0377  small protein A  34.69 
 
 
136 aa  67.8  0.00000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.861991  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1271  SmpA/OmlA domain-containing protein  35.45 
 
 
182 aa  67.8  0.00000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.175523  normal  0.212441 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1886  SmpA/OmlA domain-containing protein  36.67 
 
 
124 aa  67.8  0.00000000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0252  SmpA/OmlA domain protein  39.74 
 
 
228 aa  67.8  0.00000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3384  SmpA/OmlA domain protein  26.89 
 
 
276 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000148479 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0437  hypothetical protein  32.67 
 
 
104 aa  67.4  0.00000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0413  hypothetical protein  32.67 
 
 
104 aa  67.4  0.00000000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2385  small protein A  37.38 
 
 
163 aa  67.4  0.00000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.750326  normal  0.621044 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2975  SmpA/OmlA  39.19 
 
 
258 aa  67.4  0.00000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.977187  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4554  SmpA/OmlA domain-containing protein  34.67 
 
 
185 aa  67  0.00000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2949  SmpA/OmlA domain-containing protein  29.41 
 
 
174 aa  67  0.00000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1232  SmpA/OmlA domain-containing protein  32.82 
 
 
174 aa  67  0.00000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2592  SmpA/OmlA domain-containing protein  31.46 
 
 
297 aa  66.6  0.00000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000116933 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1097  SmpA/OmlA domain-containing protein  33.33 
 
 
167 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1285  SmpA/OmlA domain-containing protein  35.35 
 
 
164 aa  66.2  0.0000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.522478  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6008  SmpA/OmlA domain-containing protein  38.36 
 
 
193 aa  66.2  0.0000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.792796 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004297  lipoprotein SmpA a component of the essential YaeT outer-membrane protein assembly complex  37.11 
 
 
119 aa  65.9  0.0000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2476  lipoprotein, small protein A  33.04 
 
 
118 aa  65.5  0.0000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.214006  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2773  SmpA/OmlA domain-containing protein  28.68 
 
 
174 aa  65.5  0.0000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.664934  normal  0.104565 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2851  SmpA/OmlA domain-containing protein  28.68 
 
 
174 aa  65.5  0.0000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0230  SmpA/OmlA domain-containing protein  38.46 
 
 
249 aa  65.9  0.0000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01128  hypothetical protein  37.11 
 
 
119 aa  65.9  0.0000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>