55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_0963 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007963  Csal_0963  membrane protein-like protein  100 
 
 
122 aa  244  2e-64  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.186902  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3127  hypothetical protein  47.11 
 
 
121 aa  114  5e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3228  hypothetical protein  46.67 
 
 
121 aa  113  6.9999999999999995e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.604318  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3030  hypothetical protein  50.98 
 
 
121 aa  108  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3097  hypothetical protein  48.76 
 
 
122 aa  97.4  6e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.252756  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2138  hypothetical protein  41.82 
 
 
128 aa  97.1  7e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0323108 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0362  hypothetical protein  38.21 
 
 
125 aa  97.1  8e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.179708  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3132  hypothetical protein  36.89 
 
 
115 aa  92.4  2e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.754417  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3238  hypothetical protein  38.02 
 
 
120 aa  91.7  3e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.616877  normal  0.598672 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1256  membrane protein-like protein  35.83 
 
 
128 aa  89.7  1e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.18345  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1016  hypothetical protein  40.66 
 
 
112 aa  89.4  2e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4347  hypothetical protein  39.62 
 
 
125 aa  84.7  3e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.37521 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0526  membrane protein-like  41.41 
 
 
119 aa  83.6  8e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000156824  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2838  membrane protein-like  38.26 
 
 
122 aa  79.3  0.00000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2514  membrane protein-like  37.9 
 
 
126 aa  77.4  0.00000000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.607723  normal  0.251926 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0879  membrane protein-like protein  39.62 
 
 
134 aa  76.3  0.0000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.704776 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1218  transmembrane protein  30.17 
 
 
118 aa  70.5  0.000000000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2483  transmembrane protein  30.91 
 
 
122 aa  65.9  0.0000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.226347 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0836  hypothetical protein  31.36 
 
 
127 aa  64.7  0.0000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.890554  hitchhiker  0.00606656 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2121  hypothetical protein  36.7 
 
 
131 aa  63.9  0.0000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.626034 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4348  hypothetical protein  32.61 
 
 
137 aa  61.6  0.000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.67611  normal  0.378671 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0677  hypothetical protein  39.56 
 
 
134 aa  60.8  0.000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0434  membrane protein  35.8 
 
 
130 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.455263  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0413  membrane protein  35.8 
 
 
130 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0113586 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2673  membrane protein  35.8 
 
 
130 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.766452  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0419  hypothetical protein  34.83 
 
 
133 aa  55.1  0.0000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0644826 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0352  membrane protein  34.57 
 
 
130 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0361  membrane protein  34.57 
 
 
130 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.485952 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3551  hypothetical protein  27.64 
 
 
131 aa  53.1  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0392282  hitchhiker  0.000178904 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0407  hypothetical protein  27.64 
 
 
131 aa  52.8  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3532  membrane protein  30.68 
 
 
130 aa  53.1  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.22213  normal  0.443182 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3248  hypothetical protein  31.25 
 
 
129 aa  52.8  0.000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3220  putative transmembrane protein  39.51 
 
 
124 aa  52.8  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.300525  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2873  hypothetical protein  39.51 
 
 
124 aa  52.4  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0329049 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2756  hypothetical protein  31.25 
 
 
129 aa  52.8  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2705  hypothetical protein  31.25 
 
 
129 aa  52.8  0.000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3684  hypothetical protein  31.25 
 
 
129 aa  52.8  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1797  hypothetical protein  31.25 
 
 
129 aa  52.8  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3657  hypothetical protein  31.25 
 
 
129 aa  52.8  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3715  hypothetical protein  31.25 
 
 
129 aa  52.8  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0337  membrane protein  38.57 
 
 
130 aa  51.6  0.000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.173405  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2943  hypothetical protein  39.51 
 
 
124 aa  52  0.000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3239  hypothetical protein  35.51 
 
 
130 aa  51.6  0.000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2984  hypothetical protein  30 
 
 
129 aa  51.2  0.000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1050  putative transmembrane protein  30.89 
 
 
128 aa  48.9  0.00002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3102  transmembrane protein  36.14 
 
 
129 aa  49.3  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.766019  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2750  hypothetical protein  24.79 
 
 
131 aa  47  0.00009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4291  hypothetical protein  29.47 
 
 
136 aa  46.6  0.0001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0704  putative transmembrane protein  28.69 
 
 
126 aa  45.1  0.0003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.231746  normal  0.452741 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0778  putative transmembrane protein  28.57 
 
 
128 aa  44.7  0.0004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0313812 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5551  putative transmembrane protein  32.05 
 
 
130 aa  44.3  0.0005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.272582  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0741  putative transmembrane protein  27.73 
 
 
128 aa  44.3  0.0006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0778968  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0894  membrane protein-like protein  25.24 
 
 
125 aa  42.7  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.952804 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0827  hypothetical protein  29.79 
 
 
137 aa  42  0.003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1100  putative transmembrane protein  28.45 
 
 
149 aa  41.2  0.004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.664506  normal  0.414294 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>