40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_6984 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_6984  protein of unknown function DUF450  100 
 
 		 362 aa  746    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00893267  hitchhiker  0.0000001532 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3124  protein of unknown function DUF450  58.22 
 
 		 363 aa  442  1e-123  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.579922  normal  0.419432 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1227  hypothetical protein  56.62 
 
 		 356 aa  427  1e-118  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.888396  normal  0.616229 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5317  protein of unknown function DUF450  57.94 
 
 		 364 aa  421  1e-117  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0984182  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0499  hypothetical protein  57.63 
 
 		 357 aa  404  1.0000000000000001e-112  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0768136  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1591  hypothetical protein  53.41 
 
 		 365 aa  397  1e-109  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.330641 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1326  hypothetical protein  53.19 
 
 		 361 aa  369  1e-101  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3692  hypothetical protein  50.14 
 
 		 362 aa  364  1e-99  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.877955 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03510  prophage Lp2 protein 6  49.45 
 
 		 426 aa  360  2e-98  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2922  protein of unknown function DUF450  52.5 
 
 		 374 aa  358  9.999999999999999e-98  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1887  hypothetical protein  50 
 
 		 356 aa  358  9.999999999999999e-98  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.132794  normal  0.576975 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1839  hypothetical protein  50 
 
 		 356 aa  358  9.999999999999999e-98  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00358423  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1853  hypothetical protein  50 
 
 		 356 aa  358  9.999999999999999e-98  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1111  hypothetical protein  49.86 
 
 		 357 aa  356  2.9999999999999997e-97  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4039  hypothetical protein  49.3 
 
 		 353 aa  353  2.9999999999999997e-96  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.400799  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0961  hypothetical protein  47.49 
 
 		 354 aa  351  1e-95  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0478229  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4924  hypothetical protein  50.28 
 
 		 361 aa  349  4e-95  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3617  hypothetical protein  46.26 
 
 		 363 aa  330  2e-89  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3528  protein of unknown function DUF450  46.09 
 
 		 375 aa  328  8e-89  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0402721  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1269  protein of unknown function DUF450  45.66 
 
 		 356 aa  327  2.0000000000000001e-88  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0165219  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3350  protein of unknown function DUF450  46.13 
 
 		 363 aa  325  9e-88  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3361  putative restriction endonuclease or methylase  46.88 
 
 		 355 aa  318  7e-86  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3005  hypothetical protein  45.17 
 
 		 351 aa  312  6.999999999999999e-84  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.826636  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0242  protein of unknown function DUF450  43.09 
 
 		 370 aa  305  1.0000000000000001e-81  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4251  protein of unknown function DUF450  44.08 
 
 		 378 aa  293  3e-78  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0837  conserved hypothetical protein (DUF450 domain protein)  42.33 
 
 		 347 aa  246  4e-64  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.0000053845  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0250  hypothetical protein  36.29 
 
 		 380 aa  232  8.000000000000001e-60  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.178621  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0709  hypothetical protein  37.16 
 
 		 382 aa  213  4.9999999999999996e-54  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0839  hypothetical protein  37.64 
 
 		 281 aa  200  3.9999999999999996e-50  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.51863  normal  0.567303 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0657  prophage Lp2 protein 6  48.1 
 
 		 245 aa  197  2.0000000000000003e-49  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0309  hypothetical protein  30.12 
 
 		 395 aa  152  8e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4887  hypothetical protein  30.53 
 
 		 387 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.180443  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0879  type I restriction enzyme r protein (hsdr_n)  29.06 
 
 		 394 aa  97.8  2e-19  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  hitchhiker  0.000202052  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0842  hypothetical protein  58.11 
 
 		 85 aa  94  4e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.210656 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0515  protein of unknown function DUF450  35 
 
 		 360 aa  87  4e-16  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0510  hypothetical protein  35.76 
 
 		 349 aa  80.1  0.00000000000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0986  hypothetical protein  34.43 
 
 		 372 aa  57.8  0.0000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.432153  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2571  protein of unknown function DUF450  25.25 
 
 		 268 aa  50.8  0.00004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.280266  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1333  protein of unknown function DUF450  29.01 
 
 		 995 aa  46.6  0.0007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.126844  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0296  hypothetical protein  27.78 
 
 		 375 aa  44.3  0.004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>