More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_5293 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_5293  polyketide biosynthesis enoyl-CoA hydratase  100 
 
 
249 aa  518  1e-146  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.409025  normal  0.329942 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1216  polyketide biosynthesis enoyl-CoA hydratase  55.91 
 
 
260 aa  293  3e-78  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.307804  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2611  polyketide biosynthesis enoyl-CoA hydratase  55.91 
 
 
260 aa  293  3e-78  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.285185  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1382  polyketide biosynthesis enoyl-CoA hydratase  55.91 
 
 
260 aa  293  3e-78  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.465754  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0183  polyketide biosynthesis enoyl-CoA hydratase  55.91 
 
 
260 aa  293  3e-78  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.260328  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1468  polyketide biosynthesis enoyl-CoA hydratase  55.91 
 
 
260 aa  293  3e-78  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0875156  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1116  polyketide biosynthesis enoyl-CoA hydratase  55.91 
 
 
260 aa  293  3e-78  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0703433  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1668  polyketide biosynthesis enoyl-CoA hydratase  54.92 
 
 
248 aa  290  2e-77  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.850605  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0459  polyketide biosynthesis enoyl-CoA hydratase  56.45 
 
 
248 aa  286  2e-76  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.432018  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1416  polyketide biosynthesis enoyl-CoA hydratase  54.66 
 
 
249 aa  282  3.0000000000000004e-75  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2882  Beta-ketoacyl synthase  53.44 
 
 
2462 aa  277  1e-73  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.17345 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1421  FkbH like protein  42.08 
 
 
3811 aa  189  4e-47  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2598  KR domain protein  39.27 
 
 
7149 aa  159  3e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1169  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.06 
 
 
256 aa  150  2e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.179198  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2516  polyketide biosynthesis enoyl-CoA hydratase  33.91 
 
 
250 aa  132  5e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2606  polyketide biosynthesis enoyl-CoA hydratase  33.91 
 
 
250 aa  132  5e-30  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2971  polyketide biosynthesis enoyl-CoA hydratase  33.91 
 
 
250 aa  132  5e-30  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.528602  hitchhiker  0.0000066729 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4549  enoyl-CoA hydratase  28.5 
 
 
276 aa  97.4  2e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.273916  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2057  short chain enoyl-CoA hydratase / enoyl-CoA hydratase  30.67 
 
 
278 aa  93.2  4e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0685085  normal  0.0230217 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5145  putative enoyl-CoA hydratase/isomerase  25.96 
 
 
260 aa  92.4  6e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.149843 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6846  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.04 
 
 
266 aa  91.3  1e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.763233  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1016  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  27.46 
 
 
255 aa  90.5  2e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2735  enoyl-CoA hydratase  30.95 
 
 
264 aa  90.9  2e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3800  enoyl-CoA hydratase/isomerase  26.56 
 
 
287 aa  89.4  5e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.964787  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4601  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.77 
 
 
256 aa  89  6e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19110  enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase  28.37 
 
 
280 aa  87.8  1e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.184392  normal  0.138145 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1419  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  26.83 
 
 
266 aa  87.8  1e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.317109  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1457  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.2 
 
 
287 aa  87.4  2e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.221294  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2864  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.96 
 
 
258 aa  87.4  2e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2808  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  27.8 
 
 
262 aa  87.8  2e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000172921  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4553  enoyl-CoA hydratase  28.11 
 
 
261 aa  87  3e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0511055  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0750  enoyl-CoA hydratase/isomerase  25.79 
 
 
265 aa  86.7  3e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.276485 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0753  enoyl-CoA hydratase  25.79 
 
 
265 aa  85.9  5e-16  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.33751 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1671  enoyl-CoA hydratase  28.1 
 
 
265 aa  86.3  5e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0787983  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3551  short chain enoyl-CoA hydratase  25.21 
 
 
259 aa  86.3  5e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2583  enoyl-CoA hydratase/isomerase  26.41 
 
 
269 aa  86.3  5e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.601041  normal  0.0270036 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7128  enoyl-CoA hydratase  27.16 
 
 
265 aa  85.9  6e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1893  enoyl-CoA hydratase  30.85 
 
 
266 aa  85.5  8e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56250  putative enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.7 
 
 
257 aa  85.5  8e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0434  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.36 
 
 
266 aa  85.1  9e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5521  enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.97 
 
 
273 aa  85.1  9e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3132  enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.72 
 
 
279 aa  85.1  9e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.510281  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0597  short chain enoyl-CoA hydratase  24.55 
 
 
262 aa  85.1  0.000000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.00392493  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3370  enoyl-CoA hydratase/isomerase  26.55 
 
 
258 aa  84.7  0.000000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2804  enoyl-CoA hydratase/isomerase  25.33 
 
 
252 aa  84.3  0.000000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0776808  normal  0.568197 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2248  enoyl-CoA hydratase/isomerase  21.6 
 
 
274 aa  84  0.000000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000000226427  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2760  enoyl-CoA hydratase/isomerase  25.33 
 
 
252 aa  84.3  0.000000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.85821  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0110  enoyl-CoA hydratase/isomerase  23.85 
 
 
264 aa  84  0.000000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.411949 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2796  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.76 
 
 
287 aa  83.6  0.000000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.538415 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4351  enoyl-CoA hydratase  25.19 
 
 
282 aa  83.2  0.000000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3030  enoyl-CoA hydratase/isomerase  27.47 
 
 
257 aa  82.8  0.000000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.045049 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1780  enoyl-CoA hydratase/isomerase  26.92 
 
 
255 aa  83.2  0.000000000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.540838  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3100  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.3 
 
 
264 aa  82.8  0.000000000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000599217 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6902  enoyl-CoA hydratase/isomerase  26.36 
 
 
258 aa  82.8  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.174698  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1942  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  26.92 
 
 
255 aa  82.4  0.000000000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0063  enoyl-CoA hydratase  26.87 
 
 
262 aa  82.4  0.000000000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3010  enoyl-CoA hydratase  24.55 
 
 
258 aa  82.4  0.000000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.0000686819  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2899  enoyl-CoA hydratase  25.45 
 
 
258 aa  82  0.000000000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00000000596096  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5150  enoyl-CoA hydratase  29.05 
 
 
264 aa  82  0.000000000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.258357  normal  0.801479 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1871  enoyl-CoA hydratase  25.38 
 
 
258 aa  82  0.000000000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2368  short chain enoyl-CoA hydratase  28.19 
 
 
258 aa  82  0.000000000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.600058  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33170  enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase  28.09 
 
 
251 aa  81.6  0.00000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.119109  normal  0.701419 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11088  enoyl-CoA hydratase  25.12 
 
 
257 aa  81.6  0.00000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0399052  normal  0.611468 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0371  enoyl-CoA hydratase  26.7 
 
 
264 aa  81.6  0.00000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000104919  unclonable  0.0000000309848 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4083  enoyl-CoA hydratase  26.87 
 
 
250 aa  81.6  0.00000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00898216  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2627  enoyl-CoA hydratase  25 
 
 
257 aa  80.9  0.00000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000218794  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4899  putative enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.22 
 
 
257 aa  80.5  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.588442  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2866  short chain enoyl-CoA hydratase  25.11 
 
 
257 aa  80.9  0.00000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.18512  normal  0.106284 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1234  enoyl-CoA hydratase  25.34 
 
 
258 aa  80.5  0.00000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.134815  normal  0.668233 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1587  enoyl-CoA hydratase  27.46 
 
 
257 aa  80.5  0.00000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1563  enoyl-CoA hydratase  27.46 
 
 
257 aa  80.5  0.00000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2790  enoyl-CoA hydratase/isomerase  24.89 
 
 
252 aa  80.5  0.00000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.490827  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5774  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  26.56 
 
 
267 aa  80.1  0.00000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0590322  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2850  enoyl-CoA hydratase  24.55 
 
 
258 aa  80.1  0.00000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  unclonable  0.00000000000104318  normal  0.652493 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4640  enoyl-CoA hydratase  25.21 
 
 
257 aa  80.1  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.774216  normal  0.012557 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3272  enoyl-CoA hydratase  28.57 
 
 
266 aa  80.1  0.00000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0614086 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2877  enoyl-CoA hydratase/isomerase  26.51 
 
 
273 aa  80.1  0.00000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0257108  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3263  enoyl-CoA hydratase/isomerase  25.91 
 
 
267 aa  80.1  0.00000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0768349  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4172  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  26.87 
 
 
258 aa  79.7  0.00000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.863442  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4526  enoyl-CoA hydratase  26.46 
 
 
258 aa  79.7  0.00000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.3326  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0715  enoyl-CoA hydratase  24.05 
 
 
257 aa  79.7  0.00000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.000436418  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4163  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  22.31 
 
 
248 aa  79.7  0.00000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.941221  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3400  enoyl-CoA hydratase/isomerase  27.1 
 
 
269 aa  79.7  0.00000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.213114  normal  0.431531 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0603  enoyl-CoA hydratase  27.17 
 
 
267 aa  79.3  0.00000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0110461  normal  0.0769343 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1122  short chain enoyl-CoA hydratase  25.43 
 
 
262 aa  79.3  0.00000000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0294  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  27 
 
 
261 aa  79  0.00000000000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  hitchhiker  0.0000157616  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2136  enoyl-CoA hydratase  23.41 
 
 
260 aa  79  0.00000000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.259318  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4231  enoyl-CoA hydratase  25.23 
 
 
257 aa  79  0.00000000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.89202 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2378  enoyl-CoA hydratase  23.95 
 
 
257 aa  79  0.00000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0269514  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4387  enoyl-CoA hydratase  25.23 
 
 
257 aa  79  0.00000000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4156  enoyl-CoA hydratase  25.23 
 
 
257 aa  79  0.00000000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1512  enoyl-CoA hydratase  25.73 
 
 
264 aa  79  0.00000000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.288144  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0908  enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.32 
 
 
258 aa  79  0.00000000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.415627  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2248  enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.08 
 
 
258 aa  78.6  0.00000000000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0855864 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0151  enoyl-CoA hydratase  26.89 
 
 
260 aa  78.6  0.00000000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.236072 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2034  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  26.37 
 
 
266 aa  78.6  0.00000000000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.868532  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0828  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  23.25 
 
 
255 aa  77.8  0.0000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.724185  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3622  enoyl-CoA hydratase  26.47 
 
 
268 aa  78.2  0.0000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.538204  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2902  enoyl-CoA hydratase  27.85 
 
 
263 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00341422  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17850  enoyl-CoA hydratase  26.99 
 
 
265 aa  77.8  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>