44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_3478 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_3478  YiaAB two helix domain protein  100 
 
 
155 aa  320  4e-87  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1574  YiaAB two helix domain protein  70.73 
 
 
141 aa  184  5e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04112  membrane protein  66.93 
 
 
144 aa  174  4e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3809  YiaAB two helix domain-containing protein  62.88 
 
 
151 aa  173  8e-43  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0119  YiaAB two helix domain-containing protein  62.88 
 
 
151 aa  173  8e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4097  YiaAB two helix domain-containing protein  62.88 
 
 
151 aa  173  8e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2577  YiaAB two helix domain-containing protein  63.28 
 
 
356 aa  171  3.9999999999999995e-42  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.36234  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2589  YiaAB two helix domain protein  62.79 
 
 
144 aa  171  5e-42  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0098  YiaAB two helix domain-containing protein  63.57 
 
 
132 aa  170  6.999999999999999e-42  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.365723  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1256  hypothetical protein  63.28 
 
 
157 aa  169  1e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.239422  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1334  hypothetical protein  63.28 
 
 
150 aa  169  1e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1416  hypothetical protein  63.28 
 
 
150 aa  169  1e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0627339  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0501  hypothetical protein  63.28 
 
 
150 aa  169  1e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0229  hypothetical protein  63.28 
 
 
157 aa  169  1e-41  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0334  YiaAB two helix domain protein  70.25 
 
 
150 aa  166  9e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.786172 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3527  hypothetical protein  60.47 
 
 
135 aa  166  1e-40  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.555314 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0141  hypothetical protein  62.5 
 
 
166 aa  164  4e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.937216  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0691  YiaAB two helix domain-containing protein  64.46 
 
 
147 aa  161  2.0000000000000002e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0352158  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0668  YiaAB two helix domain-containing protein  64.46 
 
 
147 aa  161  3e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1506  YiaAB two helix domain protein  65.29 
 
 
157 aa  159  1e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.679887  normal  0.782208 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0790  YiaAB two helix domain-containing protein  65.29 
 
 
147 aa  153  9e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.725251  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0307  YiaAB two helix  65.29 
 
 
147 aa  153  9e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.965293  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0759  YiaAB two helix domain-containing protein  65.29 
 
 
147 aa  152  1e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3880  YiaAB two helix membrane protein  66.12 
 
 
147 aa  152  1e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00772  YiaAB two helix protein  58.78 
 
 
156 aa  152  2e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3616  YiaAB two helix  55.47 
 
 
147 aa  149  1e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0051  YiaAB two helix domain protein  55.28 
 
 
157 aa  144  5e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0250987 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4938  hypothetical protein  56.8 
 
 
145 aa  143  8.000000000000001e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.102561 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03365  hypothetical protein  56.8 
 
 
145 aa  143  8.000000000000001e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3765  hypothetical protein  56.8 
 
 
145 aa  143  8.000000000000001e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.834078  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0152  hypothetical protein  56.8 
 
 
145 aa  143  8.000000000000001e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4058  hypothetical protein  56.8 
 
 
145 aa  143  8.000000000000001e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03414  conserved inner membrane protein  56.8 
 
 
145 aa  143  8.000000000000001e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0148  YiaAB two helix domain protein  56.8 
 
 
145 aa  143  8.000000000000001e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3885  hypothetical protein  56.8 
 
 
145 aa  143  9e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1424  hypothetical protein  62.34 
 
 
100 aa  96.7  1e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04713  Rhs element Vgr protein  49.18 
 
 
564 aa  60.5  0.000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0299  YiaAB two helix domain-containing protein  32.79 
 
 
78 aa  41.2  0.005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4955  hypothetical protein  32.79 
 
 
78 aa  41.2  0.005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0351  hypothetical protein  32.79 
 
 
78 aa  41.2  0.005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0296  YiaAB two helix domain-containing protein  32.79 
 
 
78 aa  41.2  0.005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0290  hypothetical protein  32.79 
 
 
78 aa  41.2  0.005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0287  hypothetical protein  32.79 
 
 
78 aa  41.2  0.005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0348  hypothetical protein  32.79 
 
 
78 aa  41.2  0.006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>