45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_0668 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008390  Bamb_0668  YiaAB two helix domain-containing protein  100 
 
 		 147 aa  293  4e-79  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0691  YiaAB two helix domain-containing protein  95.92 
 
 		 147 aa  263  5e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0352158  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3880  YiaAB two helix membrane protein  97.28 
 
 		 147 aa  245  1e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0307  YiaAB two helix  93.88 
 
 		 147 aa  240  3.9999999999999997e-63  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.965293  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0790  YiaAB two helix domain-containing protein  93.88 
 
 		 147 aa  240  3.9999999999999997e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.725251  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0759  YiaAB two helix domain-containing protein  93.2 
 
 		 147 aa  239  1e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2577  YiaAB two helix domain-containing protein  71.33 
 
 		 356 aa  215  2e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.36234  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1334  hypothetical protein  70.67 
 
 		 150 aa  213  5.9999999999999996e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1416  hypothetical protein  70.67 
 
 		 150 aa  213  5.9999999999999996e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0627339  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0501  hypothetical protein  70.67 
 
 		 150 aa  213  5.9999999999999996e-55  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1256  hypothetical protein  70.67 
 
 		 157 aa  213  8e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.239422  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0229  hypothetical protein  70.67 
 
 		 157 aa  213  8e-55  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0141  hypothetical protein  69.7 
 
 		 166 aa  199  7e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.937216  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1506  YiaAB two helix domain protein  78.2 
 
 		 157 aa  195  1.0000000000000001e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.679887  normal  0.782208 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1574  YiaAB two helix domain protein  68.5 
 
 		 141 aa  187  5e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04112  membrane protein  69.47 
 
 		 144 aa  184  5e-46  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2589  YiaAB two helix domain protein  67.69 
 
 		 144 aa  181  4.0000000000000006e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0119  YiaAB two helix domain-containing protein  62.5 
 
 		 151 aa  180  7e-45  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3809  YiaAB two helix domain-containing protein  62.5 
 
 		 151 aa  180  7e-45  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4097  YiaAB two helix domain-containing protein  62.5 
 
 		 151 aa  180  7e-45  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3478  YiaAB two helix domain protein  64.46 
 
 		 155 aa  171  3.9999999999999995e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0098  YiaAB two helix domain-containing protein  68.29 
 
 		 132 aa  167  5e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.365723  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0334  YiaAB two helix domain protein  69.77 
 
 		 150 aa  167  5e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.786172 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4938  hypothetical protein  57.46 
 
 		 145 aa  157  5e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.102561 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03365  hypothetical protein  57.46 
 
 		 145 aa  157  5e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3885  hypothetical protein  57.46 
 
 		 145 aa  157  5e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0152  hypothetical protein  57.46 
 
 		 145 aa  157  5e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0148  YiaAB two helix domain protein  57.46 
 
 		 145 aa  157  5e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4058  hypothetical protein  57.46 
 
 		 145 aa  157  5e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3765  hypothetical protein  57.46 
 
 		 145 aa  157  5e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.834078  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03414  conserved inner membrane protein  57.46 
 
 		 145 aa  157  5e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3527  hypothetical protein  63.78 
 
 		 135 aa  155  2e-37  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.555314 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0051  YiaAB two helix domain protein  61.48 
 
 		 157 aa  151  2.9999999999999998e-36  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0250987 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00772  YiaAB two helix protein  55.15 
 
 		 156 aa  151  2.9999999999999998e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3616  YiaAB two helix  57.26 
 
 		 147 aa  149  8.999999999999999e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1424  hypothetical protein  65.59 
 
 		 100 aa  121  3e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04713  Rhs element Vgr protein  50.82 
 
 		 564 aa  66.6  0.0000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1085  YiaAB two helix domain-containing protein  26.32 
 
 		 94 aa  42.4  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000192499  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4955  hypothetical protein  31.03 
 
 		 78 aa  41.2  0.005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0351  hypothetical protein  31.03 
 
 		 78 aa  41.2  0.005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0290  hypothetical protein  31.03 
 
 		 78 aa  41.2  0.005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0287  hypothetical protein  31.03 
 
 		 78 aa  41.2  0.005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0296  YiaAB two helix domain-containing protein  31.03 
 
 		 78 aa  41.2  0.005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0299  YiaAB two helix domain-containing protein  31.58 
 
 		 78 aa  40.8  0.006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0348  hypothetical protein  31.03 
 
 		 78 aa  40.8  0.006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>