37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_1506 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_1506  YiaAB two helix domain protein  100 
 
 		 157 aa  315  1e-85  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.679887  normal  0.782208 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0141  hypothetical protein  72.67 
 
 		 166 aa  220  6e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.937216  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2577  YiaAB two helix domain-containing protein  79.67 
 
 		 356 aa  206  8e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.36234  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1256  hypothetical protein  75.19 
 
 		 157 aa  204  5e-52  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.239422  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1334  hypothetical protein  75.19 
 
 		 150 aa  204  5e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1416  hypothetical protein  75.19 
 
 		 150 aa  204  5e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0627339  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0501  hypothetical protein  75.19 
 
 		 150 aa  204  5e-52  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0229  hypothetical protein  75.19 
 
 		 157 aa  204  5e-52  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0691  YiaAB two helix domain-containing protein  75.91 
 
 		 147 aa  202  2e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0352158  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0668  YiaAB two helix domain-containing protein  76.64 
 
 		 147 aa  201  3e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4097  YiaAB two helix domain-containing protein  62.42 
 
 		 151 aa  191  4e-48  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0119  YiaAB two helix domain-containing protein  62.42 
 
 		 151 aa  191  4e-48  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3809  YiaAB two helix domain-containing protein  62.42 
 
 		 151 aa  191  4e-48  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1574  YiaAB two helix domain protein  70.08 
 
 		 141 aa  189  9e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0790  YiaAB two helix domain-containing protein  71.92 
 
 		 147 aa  187  4e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.725251  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0307  YiaAB two helix  71.92 
 
 		 147 aa  187  4e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.965293  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0759  YiaAB two helix domain-containing protein  71.23 
 
 		 147 aa  186  1e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3880  YiaAB two helix membrane protein  75.91 
 
 		 147 aa  183  7e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2589  YiaAB two helix domain protein  66.67 
 
 		 144 aa  177  2.9999999999999997e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3478  YiaAB two helix domain protein  65.29 
 
 		 155 aa  174  5e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04112  membrane protein  67.21 
 
 		 144 aa  174  6e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0334  YiaAB two helix domain protein  70.99 
 
 		 150 aa  173  7e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.786172 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0098  YiaAB two helix domain-containing protein  66.39 
 
 		 132 aa  164  4e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.365723  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00772  YiaAB two helix protein  53.15 
 
 		 156 aa  155  3e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3527  hypothetical protein  62.99 
 
 		 135 aa  155  3e-37  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.555314 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03365  hypothetical protein  57.04 
 
 		 145 aa  154  4e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4938  hypothetical protein  57.04 
 
 		 145 aa  154  4e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.102561 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0148  YiaAB two helix domain protein  57.04 
 
 		 145 aa  154  4e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3885  hypothetical protein  57.04 
 
 		 145 aa  154  4e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0152  hypothetical protein  57.04 
 
 		 145 aa  154  4e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4058  hypothetical protein  57.04 
 
 		 145 aa  154  4e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3765  hypothetical protein  57.04 
 
 		 145 aa  154  4e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.834078  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03414  conserved inner membrane protein  57.04 
 
 		 145 aa  154  4e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0051  YiaAB two helix domain protein  60.66 
 
 		 157 aa  149  1e-35  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0250987 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3616  YiaAB two helix  53.6 
 
 		 147 aa  145  2.0000000000000003e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1424  hypothetical protein  73.42 
 
 		 100 aa  122  3e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04713  Rhs element Vgr protein  57.38 
 
 		 564 aa  68.9  0.00000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>