19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_1906 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_1906  hypothetical protein  100 
 
 		 287 aa  587  1e-167  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1908  hypothetical protein  41.38 
 
 		 277 aa  225  6e-58  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0347  hypothetical protein  33.11 
 
 		 276 aa  157  2e-37  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.238012 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0511  hypothetical protein  32.06 
 
 		 294 aa  136  4e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.194479  normal  0.142642 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3072  Anti-sigma-K factor RskA  30.66 
 
 		 274 aa  135  6.0000000000000005e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.865859  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4472  hypothetical protein  28.43 
 
 		 297 aa  120  1.9999999999999998e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.370126 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12213  hypothetical protein  24.57 
 
 		 264 aa  94.4  2e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2946  hypothetical protein  25.86 
 
 		 262 aa  93.2  4e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00896315  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0341  hypothetical protein  23.66 
 
 		 259 aa  62.4  0.000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3578  hypothetical protein  34.78 
 
 		 264 aa  55.1  0.000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1668  hypothetical protein  36.11 
 
 		 240 aa  54.3  0.000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0134215  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0544  hypothetical protein  29.79 
 
 		 255 aa  47.8  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0977193 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5902  hypothetical protein  30.59 
 
 		 242 aa  45.8  0.0007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.617501 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4572  hypothetical protein  25.6 
 
 		 258 aa  45.8  0.0007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3291  hypothetical protein  24.07 
 
 		 248 aa  44.7  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3520  hypothetical protein  32.81 
 
 		 172 aa  43.5  0.004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1665  hypothetical protein  21.77 
 
 		 142 aa  43.5  0.004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.171553 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0625  Anti-sigma K factor RskA  39.39 
 
 		 206 aa  42.7  0.007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.793553 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1598  hypothetical protein  35.37 
 
 		 258 aa  42.4  0.009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.240945  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>