29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_0317 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_1093  band 7 protein  64.32 
 
 		 650 aa  832    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.807858  normal  0.192088 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0317  band 7 protein  100 
 
 		 646 aa  1321    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5247  band 7 protein  49.57 
 
 		 691 aa  566  1e-160  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1605  band 7 protein  49.57 
 
 		 691 aa  566  1e-160  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.608323  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2967  hypothetical protein  47.28 
 
 		 689 aa  553  1e-156  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2133  band 7 protein  45.17 
 
 		 647 aa  536  1e-151  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.938391 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5721  band 7 protein  32.82 
 
 		 681 aa  342  1e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0977085  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0083  Band 7 protein  32.49 
 
 		 830 aa  305  2.0000000000000002e-81  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.148744  hitchhiker  0.00195276 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2023  band 7 protein  30.28 
 
 		 658 aa  298  2e-79  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7328  band 7 protein  30.63 
 
 		 660 aa  297  3e-79  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.081025 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0142  band 7 protein  35.05 
 
 		 673 aa  297  4e-79  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7215  hypothetical protein  31.55 
 
 		 659 aa  285  2.0000000000000002e-75  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1917  von Willebrand factor, type A  34.77 
 
 		 1204 aa  245  9.999999999999999e-64  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.137165 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3347  band 7 protein  25.91 
 
 		 539 aa  146  2e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.953991  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2366  band 7 protein  36.07 
 
 		 509 aa  58.9  0.0000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000111319  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1223  band 7 protein  39.42 
 
 		 507 aa  56.6  0.000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0712  band 7 protein  35.4 
 
 		 496 aa  53.9  0.000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.350479 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4145  hypothetical protein  41.1 
 
 		 103 aa  52  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.946953  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2467  band 7 protein  21.98 
 
 		 318 aa  51.2  0.00006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0849083 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2032  band 7 protein  25.5 
 
 		 303 aa  50.8  0.00008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.953686 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0355  putative cellulose-binding protein  35.48 
 
 		 431 aa  49.7  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.647615  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3386  band 7 protein  32.67 
 
 		 311 aa  49.3  0.0002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0131502  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3018  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  22.22 
 
 		 261 aa  48.5  0.0004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.126407  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0465  band 7 protein  31.68 
 
 		 311 aa  47  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.163647  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0416  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  31.82 
 
 		 310 aa  46.6  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00860785  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1759  band 7 protein  31.18 
 
 		 384 aa  46.2  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0334  band 7 protein  35.09 
 
 		 507 aa  45.8  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000207972  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0578  band 7 protein  29.53 
 
 		 500 aa  45.4  0.003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0697036  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3100  band 7 protein  23.65 
 
 		 318 aa  44.3  0.007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>