17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_1759 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_1759  band 7 protein  100 
 
 		 384 aa  744    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4132  band 7 protein  56.01 
 
 		 334 aa  346  4e-94  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2357  band 7 protein  55.25 
 
 		 335 aa  335  7.999999999999999e-91  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000807905  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6652  band 7 protein  55.37 
 
 		 354 aa  332  6e-90  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6366  hypothetical protein  42.7 
 
 		 341 aa  267  2.9999999999999995e-70  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5159  band 7 protein  37.64 
 
 		 328 aa  210  3e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3970  band 7 protein  42.91 
 
 		 326 aa  207  3e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.104897  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4338  band 7 protein  42.18 
 
 		 326 aa  203  5e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.461257  normal  0.296553 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4450  band 7 protein  42.18 
 
 		 326 aa  196  7e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.330245 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1041  band 7 protein  31.43 
 
 		 339 aa  141  1.9999999999999998e-32  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0346  band 7 protein  31.72 
 
 		 341 aa  125  9e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00220198  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5758  band 7 protein  29.71 
 
 		 357 aa  124  2e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000720361  unclonable  0.00000000000000102011 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5114  hypothetical protein  29.28 
 
 		 345 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.227587 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0317  band 7 protein  31.82 
 
 		 646 aa  64.3  0.000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5558  band 7 protein  30 
 
 		 498 aa  53.9  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.033343  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5721  band 7 protein  30.82 
 
 		 681 aa  52.8  0.000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0977085  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2366  band 7 protein  32.12 
 
 		 509 aa  50.1  0.00007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000111319  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>