More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_3426 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013203  Apar_0182  NAD+ synthetase  59.05 
 
 
676 aa  759    Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1200  NAD synthetase  52.31 
 
 
642 aa  681    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2216  NAD synthetase  53.01 
 
 
652 aa  686    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000808702  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0325  NAD synthetase  51.68 
 
 
645 aa  694    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0404544  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1314  NAD synthetase  54.55 
 
 
635 aa  674    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0103341  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1130  NAD synthetase  55.02 
 
 
635 aa  681    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3426  NAD+ synthetase  100 
 
 
647 aa  1342    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0531  NAD synthetase  48.4 
 
 
647 aa  629  1e-179  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0620  NAD+ synthetase  48.03 
 
 
644 aa  612  9.999999999999999e-175  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.232331  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2679  NAD synthetase  44.93 
 
 
686 aa  566  1e-160  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2164  NAD synthetase  45.07 
 
 
689 aa  560  1e-158  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2204  NAD synthetase  43.43 
 
 
692 aa  546  1e-154  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0453723  normal  0.881972 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2610  NAD synthetase  44.36 
 
 
682 aa  541  9.999999999999999e-153  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0680  NAD synthetase  44.02 
 
 
716 aa  536  1e-151  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.576503 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2169  NAD synthetase  43.95 
 
 
685 aa  536  1e-151  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0634324  hitchhiker  0.00000227772 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2095  NAD synthetase  42.75 
 
 
714 aa  534  1e-150  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2533  NAD synthetase  41.91 
 
 
691 aa  528  1e-149  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0919  NAD synthetase  43.2 
 
 
802 aa  524  1e-147  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3633  NAD+ synthetase  41.03 
 
 
704 aa  525  1e-147  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.400497  hitchhiker  0.00213692 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0483  NAD+ synthetase  42.28 
 
 
679 aa  517  1.0000000000000001e-145  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4517  NAD synthetase  42.81 
 
 
690 aa  518  1.0000000000000001e-145  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.516148 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4405  NAD synthetase  42.43 
 
 
690 aa  514  1e-144  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.863566  normal  0.125329 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1103  NAD synthetase  41.74 
 
 
684 aa  513  1e-144  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.635077 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4035  NAD synthetase  42.28 
 
 
690 aa  513  1e-144  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0650104 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3909  NAD synthase  42.77 
 
 
678 aa  514  1e-144  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1782  NAD+ synthetase  41.64 
 
 
686 aa  506  9.999999999999999e-143  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0217619 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4914  NAD synthetase  42.66 
 
 
683 aa  502  1e-141  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2044  NAD synthetase  40.39 
 
 
681 aa  504  1e-141  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3940  NAD synthetase  41.62 
 
 
680 aa  501  1e-140  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.381812  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0979  NAD synthetase  41.07 
 
 
678 aa  495  1e-139  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.989674  normal  0.179553 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2890  NAD synthetase  41.01 
 
 
679 aa  497  1e-139  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2642  NAD synthetase  40.36 
 
 
680 aa  492  9.999999999999999e-139  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.309043  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5214  NAD+ synthetase  41.27 
 
 
680 aa  494  9.999999999999999e-139  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0536681  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3548  NAD synthetase  40 
 
 
680 aa  491  1e-137  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3543  NAD synthetase  40 
 
 
680 aa  491  1e-137  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3616  NAD synthetase  40 
 
 
680 aa  491  1e-137  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.4812  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2595  NAD synthetase  40.21 
 
 
687 aa  487  1e-136  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.649167  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28360  NAD synthase  38.02 
 
 
846 aa  484  1e-135  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.455485  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12465  NAD synthetase  40.8 
 
 
738 aa  484  1e-135  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000230879  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3271  NAD(+) synthase (glutamine-hydrolyzing)  41.46 
 
 
682 aa  483  1e-135  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4206  NAD synthetase  39.88 
 
 
681 aa  475  1e-132  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3750  NAD synthetase  42.07 
 
 
699 aa  468  9.999999999999999e-131  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0534527 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4906  NAD synthetase  40.77 
 
 
679 aa  464  1e-129  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0664942  hitchhiker  0.00795147 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1400  NAD synthetase  38.88 
 
 
650 aa  425  1e-117  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0507  NAD+ synthetase  34.59 
 
 
600 aa  390  1e-107  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1558  NAD+ synthetase  28.46 
 
 
573 aa  211  5e-53  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0286387  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3480  NAD+ synthetase  29.11 
 
 
587 aa  203  6e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0342868  normal  0.0247199 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1404  NAD synthetase  27.51 
 
 
574 aa  196  8.000000000000001e-49  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0189594  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1869  NAD+ synthetase  28.67 
 
 
575 aa  194  5e-48  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0461361  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2763  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  28.67 
 
 
577 aa  183  8.000000000000001e-45  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11920  glutamine-dependent NAD+ synthase  28.28 
 
 
556 aa  183  1e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0767  NAD+ synthetase  26.08 
 
 
583 aa  182  1e-44  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.296939  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2832  NAD+ synthetase  25.41 
 
 
686 aa  182  2e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0640  NAD+ synthetase  24.75 
 
 
700 aa  181  4e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0635505 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1409  NAD synthetase  27.75 
 
 
561 aa  179  2e-43  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1567  NAD synthetase  27.27 
 
 
576 aa  179  2e-43  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1518  NAD synthetase  27.39 
 
 
576 aa  179  2e-43  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0922  glutamine-dependent NAD(+) synthetase  27.23 
 
 
542 aa  172  2e-41  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.906814  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2417  glutamine-dependent NAD(+) synthetase  25.88 
 
 
626 aa  172  2e-41  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.906393  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1093  NAD+ synthetase  27.23 
 
 
542 aa  172  2e-41  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.588996  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1122  glutamine-dependent NAD(+) synthetase  27.85 
 
 
566 aa  171  6e-41  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.049761  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1882  NAD+ synthetase  28.42 
 
 
552 aa  170  6e-41  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0296  NAD+ synthetase  29.14 
 
 
567 aa  170  6e-41  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.50614  normal  0.755509 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0270  putative NH3-dependent (glutamine-hydrolyzing) NAD(+) synthetase  29.33 
 
 
567 aa  170  8e-41  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_940  glutamine-dependent NAD(+) synthetase  28.16 
 
 
566 aa  169  1e-40  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0951  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  27.06 
 
 
566 aa  167  4e-40  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2553  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabZ  29.03 
 
 
540 aa  166  1.0000000000000001e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0396005 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1045  NAD+ synthetase  26.36 
 
 
658 aa  166  2.0000000000000002e-39  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.700176  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2961  NAD+ synthetase  29 
 
 
545 aa  164  7e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0904337 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1372  NAD+ synthetase  26.92 
 
 
545 aa  162  2e-38  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6745  NAD+ synthetase  25.51 
 
 
688 aa  162  3e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.960806 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0908  NAD+ synthetase  28.28 
 
 
571 aa  160  7e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.31123  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3297  NAD+ synthetase  27.59 
 
 
599 aa  158  3e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0526059 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3650  NAD synthetase  26.9 
 
 
540 aa  156  9e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3593  NAD+ synthetase  26.75 
 
 
577 aa  156  1e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1253  NAD+ synthetase  25.59 
 
 
584 aa  155  2.9999999999999998e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.309377  normal  0.0942675 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0223  NAD+ synthetase  26.67 
 
 
540 aa  154  5e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1011  NAD synthetase  27.55 
 
 
545 aa  153  1e-35  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0196449  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2549  NAD+ synthetase  26.73 
 
 
541 aa  152  1e-35  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.402405  normal  0.0553974 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2309  NAD+ synthetase  26.97 
 
 
562 aa  152  2e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.543638 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0150  NAD+ synthetase  26.18 
 
 
543 aa  152  2e-35  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0246  NAD+ synthetase  26.42 
 
 
571 aa  152  2e-35  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.126728  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0495  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  26.02 
 
 
543 aa  152  3e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1524  NAD+ synthetase  25.95 
 
 
559 aa  150  6e-35  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.14105 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0887  NAD synthetase  27.37 
 
 
545 aa  150  8e-35  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3277  NAD+ synthetase  24.66 
 
 
554 aa  149  1.0000000000000001e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0727  NAD+ synthetase  26.88 
 
 
567 aa  149  1.0000000000000001e-34  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.47874  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0553  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  26.03 
 
 
577 aa  148  2.0000000000000003e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.795829  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1886  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  25.17 
 
 
535 aa  149  2.0000000000000003e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3340  NAD+ synthetase  28.01 
 
 
598 aa  149  2.0000000000000003e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.316593  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1494  NAD+ synthetase  27.11 
 
 
582 aa  148  3e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0582262  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3401  NAD+ synthetase  25.42 
 
 
611 aa  148  3e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1990  NAD+ synthetase  26.05 
 
 
561 aa  148  4.0000000000000006e-34  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0918  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  24.96 
 
 
591 aa  147  5e-34  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.262249  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3108  NAD+ synthetase  25.59 
 
 
591 aa  147  6e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00105483  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2601  NAD(+) synthase (glutamine-hydrolyzing)  24.72 
 
 
597 aa  146  1e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.588325 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0969  NAD(+) synthetase  27.32 
 
 
539 aa  145  2e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0105  NAD synthetase  26.7 
 
 
574 aa  145  3e-33  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.1435  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0311  NAD+ synthetase  26 
 
 
567 aa  144  4e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1699  NAD+ synthetase  27.01 
 
 
561 aa  143  9.999999999999999e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.100102  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>