39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_3301 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010001  Cphy_3301  membrane-bound metal-dependent hydrolase  100 
 
 
130 aa  255  1e-67  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2203  hypothetical protein  36.22 
 
 
171 aa  59.7  0.00000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00120723  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2241  hypothetical protein  36.22 
 
 
171 aa  59.7  0.00000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000136831  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1771  hypothetical protein  36.22 
 
 
169 aa  59.3  0.00000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.380735  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1028  putative metal-dependent hydrolase, membrane-bound  38.16 
 
 
196 aa  55.5  0.0000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.508363  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2634  membrane-bound metal-dependent hydrolase  33.33 
 
 
167 aa  53.5  0.000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1203  putative metal-dependent hydrolase, membrane-bound  36.77 
 
 
196 aa  53.1  0.000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000395811  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1715  hypothetical protein  37.38 
 
 
196 aa  53.1  0.000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.28693  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1914  membrane-bound metal-dependent hydrolase  36.94 
 
 
196 aa  52.8  0.000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.109701  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1973  hypothetical protein  36.94 
 
 
196 aa  52.8  0.000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1949  hypothetical protein  36.94 
 
 
196 aa  52.8  0.000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1809  hypothetical protein  36.94 
 
 
196 aa  52.8  0.000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2023  hypothetical protein  36.94 
 
 
199 aa  52  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1850  hypothetical protein  36.94 
 
 
199 aa  52  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00111152  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1418  hypothetical protein  36.94 
 
 
199 aa  52  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.597703  normal  0.0132689 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1450  hypothetical protein  36.94 
 
 
199 aa  51.6  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1435  hypothetical protein  36.94 
 
 
199 aa  52  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1532  membrane-bound metal-dependent hydrolase  34.58 
 
 
168 aa  51.6  0.000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000376224  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2446  hypothetical protein  36.04 
 
 
196 aa  50.1  0.000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01685  hypothetical protein  36.04 
 
 
196 aa  50.1  0.000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.540311  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1904  hypothetical protein  36.04 
 
 
196 aa  50.1  0.000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.727123 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01697  predicted inner membrane protein regulated by LexA  36.04 
 
 
196 aa  50.1  0.000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.728151  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1463  hypothetical protein  36.04 
 
 
196 aa  50.1  0.000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1686  hypothetical protein  37.5 
 
 
182 aa  50.1  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0482652  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1963  hypothetical protein  35.78 
 
 
192 aa  50.1  0.00001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.175154  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2124  hypothetical protein  36.7 
 
 
182 aa  50.1  0.00001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000163059  hitchhiker  0.000408284 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2650  hypothetical protein  37.5 
 
 
182 aa  50.1  0.00001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.141384  normal  0.0513814 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1796  hypothetical protein  37.5 
 
 
182 aa  50.1  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2194  hypothetical protein  35.78 
 
 
191 aa  47.4  0.00007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1901  hypothetical protein  34.86 
 
 
191 aa  45.1  0.0004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0571  membrane-bound metal-dependent hydrolase  25.17 
 
 
196 aa  44.3  0.0005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.240779  n/a   
 
 
-
 
NC_013207  Aaci_3112  membrane-bound metal-dependent hydrolase  25.17 
 
 
196 aa  44.3  0.0005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2446  membrane-bound metal-dependent hydrolase  37.8 
 
 
156 aa  43.1  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3150  hypothetical protein  36.17 
 
 
182 aa  42.4  0.002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.552218  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4895  membrane-bound metal-dependent hydrolase  37.89 
 
 
345 aa  42.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1380  membrane-bound metal-dependent hydrolase  36.17 
 
 
182 aa  42.4  0.002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1266  putative metal-dependent hydrolase, membrane-bound  36.17 
 
 
182 aa  42.4  0.002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1169  membrane-bound metal-dependent hydrolase  28.46 
 
 
204 aa  41.6  0.004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0032  membrane-bound metal-dependent hydrolase  36.26 
 
 
368 aa  40.8  0.007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>