240 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_2033 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_2033  aIF-2BI family translation initiation factor  100 
 
 		 354 aa  728    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1289  methylthioribose-1-phosphate isomerase  59.21 
 
 		 364 aa  409  1e-113  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0889723  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0639  aIF-2BI family translation initiation factor  56.47 
 
 		 372 aa  358  6e-98  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.249987  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2613  translation initiation factor, aIF-2BI family  52.19 
 
 		 349 aa  354  2e-96  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0394  methylthioribose-1-phosphate isomerase  52.41 
 
 		 348 aa  349  4e-95  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0332  methylthioribose-1-phosphate isomerase  51.2 
 
 		 348 aa  341  1e-92  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0379  methylthioribose-1-phosphate isomerase  51.2 
 
 		 348 aa  341  1e-92  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0347  methylthioribose-1-phosphate isomerase  51.2 
 
 		 347 aa  341  1e-92  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0441  methylthioribose-1-phosphate isomerase  50.6 
 
 		 348 aa  341  1e-92  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0319  methylthioribose-1-phosphate isomerase  50.9 
 
 		 347 aa  340  2e-92  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0327  methylthioribose-1-phosphate isomerase  50.3 
 
 		 348 aa  340  2.9999999999999998e-92  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0316  methylthioribose-1-phosphate isomerase  51.06 
 
 		 348 aa  338  7e-92  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0846  methylthioribose-1-phosphate isomerase  52.58 
 
 		 356 aa  338  9.999999999999999e-92  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4924  methylthioribose-1-phosphate isomerase  50 
 
 		 348 aa  335  5.999999999999999e-91  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.64519  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0254  aIF-2BI family translation initiation factor  51.6 
 
 		 346 aa  335  9e-91  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1741  methylthioribose-1-phosphate isomerase  51.04 
 
 		 355 aa  324  1e-87  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1519  aIF-2BI family translation initiation factor  49.28 
 
 		 350 aa  322  4e-87  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.889993  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4098  methylthioribose-1-phosphate isomerase  47.6 
 
 		 351 aa  319  3.9999999999999996e-86  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.463174  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3789  methylthioribose-1-phosphate isomerase  47.6 
 
 		 351 aa  317  2e-85  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.700016  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4322  aIF-2BI family translation initiation factor  49.25 
 
 		 346 aa  316  4e-85  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.394096  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4159  methylthioribose-1-phosphate isomerase  47.31 
 
 		 351 aa  315  5e-85  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.109098  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3942  methylthioribose-1-phosphate isomerase  46.65 
 
 		 351 aa  315  6e-85  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1360  translation initiation factor, aIF-2BI family  51.64 
 
 		 342 aa  315  6e-85  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0559648  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4251  methylthioribose-1-phosphate isomerase  46.65 
 
 		 351 aa  315  6e-85  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3379  aIF-2BI family translation initiation factor  48.18 
 
 		 346 aa  314  9.999999999999999e-85  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3774  methylthioribose-1-phosphate isomerase  48.48 
 
 		 351 aa  313  1.9999999999999998e-84  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3861  methylthioribose-1-phosphate isomerase  46.94 
 
 		 349 aa  313  1.9999999999999998e-84  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.583783  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4139  methylthioribose-1-phosphate isomerase  47.6 
 
 		 353 aa  313  1.9999999999999998e-84  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.196624  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4053  methylthioribose-1-phosphate isomerase  48.48 
 
 		 351 aa  313  1.9999999999999998e-84  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0072  translation initiation factor 2B subunit I  49.4 
 
 		 346 aa  313  2.9999999999999996e-84  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.25912 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0810  aIF-2BI family translation initiation factor  47.52 
 
 		 349 aa  306  4.0000000000000004e-82  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1099  methylthioribose-1-phosphate isomerase  46.31 
 
 		 353 aa  305  7e-82  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.767768 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0703  translation initiation factor 2B subunit I  50.91 
 
 		 351 aa  304  1.0000000000000001e-81  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000787843 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0510  aIF-2BI family translation initiation factor  47.59 
 
 		 346 aa  303  4.0000000000000003e-81  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0016  aIF-2BI family translation initiation factor  48.38 
 
 		 343 aa  303  4.0000000000000003e-81  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.570831  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0016  aIF-2BI family translation initiation factor  48.38 
 
 		 343 aa  303  4.0000000000000003e-81  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.339634  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3560  translation initiation factor, aIF-2BI family  46.36 
 
 		 357 aa  299  5e-80  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2349  aIF-2BI family translation initiation factor  45.51 
 
 		 358 aa  295  9e-79  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.944221  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3596  translation initiation factor, aIF-2BI family  46.97 
 
 		 346 aa  293  2e-78  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.82629  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2731  methylthioribose-1-phosphate isomerase  48.48 
 
 		 349 aa  292  5e-78  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0228866  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3753  translation initiation factor, aIF-2BI family  49.25 
 
 		 346 aa  288  1e-76  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0518  aIF-2BI family translation initiation factor  48.45 
 
 		 334 aa  287  2e-76  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.294825  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3646  translation initiation factor, aIF-2BI family  49.25 
 
 		 346 aa  287  2e-76  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1491  translation initiation factor, aIF-2BI family  47.72 
 
 		 353 aa  286  5e-76  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.626941  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1175  translation initiation factor 2B subunit I  46.85 
 
 		 354 aa  286  5e-76  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2064  aIF-2BI family translation initiation factor  46.25 
 
 		 346 aa  285  7e-76  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000777983  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_459  methylthioribose-1-phosphate isomerase  47.52 
 
 		 332 aa  284  2.0000000000000002e-75  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.14852  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0648  aIF-2BI family translation initiation factor  46.88 
 
 		 348 aa  282  6.000000000000001e-75  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.674044  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18480  putative translation initiation factor, aIF-2BI family  45.11 
 
 		 355 aa  281  1e-74  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0224403  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1643  translation initiation factor  48.64 
 
 		 344 aa  281  1e-74  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.226672  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3749  putative translation initiation factor, aIF-2BI/5-methylthioribose-1-phosphate isomerase  45.18 
 
 		 354 aa  280  2e-74  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0621  translation initiation factor 2B subunit I  47.11 
 
 		 342 aa  280  3e-74  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0997628  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0494  translation initiation factor 2B subunit I  46.27 
 
 		 332 aa  277  2e-73  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.93452  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2877  eIF-2B alpha/beta/delta-related uncharacterized proteins  42.9 
 
 		 350 aa  276  6e-73  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00735  methylthioribose-1-phosphate isomerase  43.28 
 
 		 354 aa  273  3e-72  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.214802  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4687  methylthioribose-1-phosphate isomerase  46.69 
 
 		 350 aa  272  6e-72  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3544  methylthioribose-1-phosphate isomerase  46.89 
 
 		 347 aa  272  8.000000000000001e-72  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0964  translation initiation factor, aIF-2BI family  46.53 
 
 		 351 aa  271  1e-71  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.518904  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6765  translation initiation factor, aIF-2BI family  44.69 
 
 		 369 aa  271  1e-71  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0169  aIF-2BI family translation initiation factor  46.41 
 
 		 345 aa  270  2e-71  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00178496 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0191  translation initiation factor, aIF-2BI family  43.1 
 
 		 348 aa  269  4e-71  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2235  translation initiation factor, aIF-2BI family  42.77 
 
 		 350 aa  268  1e-70  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4334  eIF-2B alpha/beta/delta-related uncharacterized protein  44.31 
 
 		 337 aa  266  5.999999999999999e-70  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1381  translation initiation factor, aIF-2BI family  44.38 
 
 		 362 aa  264  1e-69  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.705402  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2170  aIF-2BI family translation initiation factor  47.38 
 
 		 344 aa  264  2e-69  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0156  eIF-2B alpha/beta/delta-related uncharacterized protein  42.61 
 
 		 354 aa  264  2e-69  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.232234  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3765  translation initiation factor, aIF-2BI family  46.87 
 
 		 345 aa  264  2e-69  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0692423  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3816  methylthioribose-1-phosphate isomerase  46.87 
 
 		 350 aa  262  4.999999999999999e-69  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.732544 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0485  aIF-2BI family translation initiation factor  42.98 
 
 		 353 aa  262  6e-69  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.646058  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1881  aIF-2BI family translation initiation factor  45.99 
 
 		 345 aa  262  8.999999999999999e-69  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2124  methylthioribose-1-phosphate isomerase  42.38 
 
 		 354 aa  259  5.0000000000000005e-68  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.369854  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1944  translation initiation factor 2B subunit I  45.59 
 
 		 352 aa  259  6e-68  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00466755  normal  0.570212 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0503  translation initiation factor, aIF-2BI family  40.29 
 
 		 350 aa  258  9e-68  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2078  methylthioribose-1-phosphate isomerase  45.34 
 
 		 353 aa  257  2e-67  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.424406 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0779  S-methyl-5-thioribose-1-phosphate isomerase  43.37 
 
 		 346 aa  258  2e-67  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.404257  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0419  translation initiation factor 2B subunit I family (IF-2BI)  42.24 
 
 		 347 aa  256  4e-67  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.04546  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1186  translation initiation factor, aIF-2BI family  46.27 
 
 		 345 aa  256  5e-67  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000144196  normal  0.031954 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2312  translation initiation factor, aIF-2BI family  44.03 
 
 		 378 aa  255  7e-67  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0076  translation initiation factor 2B subunit I  42.86 
 
 		 355 aa  255  9e-67  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1534  translation initiation factor, aIF-2BI family  43.29 
 
 		 348 aa  254  1.0000000000000001e-66  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2043  methylthioribose-1-phosphate isomerase  41.44 
 
 		 354 aa  255  1.0000000000000001e-66  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0929  translation initiation factor, aIF-2BI family  43.77 
 
 		 344 aa  253  2.0000000000000002e-66  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.119435  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1706  eIF-2B alpha/beta/delta-related uncharacterized proteins  41.12 
 
 		 349 aa  253  4.0000000000000004e-66  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.307709  normal  0.360385 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4317  translation initiation factor, aIF-2BI family  46.06 
 
 		 339 aa  252  6e-66  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1992  translation initiation factor 2B subunit I  39.82 
 
 		 348 aa  252  8.000000000000001e-66  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.337411 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4339  translation initiation factor, aIF-2BI family  46.06 
 
 		 339 aa  250  2e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0999  aIF-2BI family translation initiation factor  42.2 
 
 		 327 aa  250  2e-65  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.260098  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0246  eIF-2B alpha/beta/delta-related uncharacterized proteins  41.44 
 
 		 345 aa  250  2e-65  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1015  translation initiation factor, aIF-2BI family  43.47 
 
 		 350 aa  249  4e-65  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.253315  unclonable  0.0000000000388932 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0893  translation initiation factor, putative, aIF-2BI family  43.47 
 
 		 350 aa  249  4e-65  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.592347  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1646  translation initiation factor, aIF-2BI family  43.86 
 
 		 340 aa  248  1e-64  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1647  translation initiation factor, aIF-2BI family  43.03 
 
 		 329 aa  248  1e-64  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4186  translation initiation factor 2B subunit I  45.34 
 
 		 339 aa  248  2e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3396  methylthioribose-1-phosphate isomerase  44.91 
 
 		 349 aa  247  3e-64  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2173  translation initiation factor IF-2B subunit alpha  41.4 
 
 		 366 aa  247  3e-64  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2717  methylthioribose-1-phosphate isomerase  44.91 
 
 		 349 aa  247  3e-64  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.143544  normal  0.136837 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1036  translation initiation factor, aIF-2BI family  44.31 
 
 		 347 aa  246  6e-64  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.313313  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1844  initiation factor 2B alpha/beta/delta  39.76 
 
 		 335 aa  244  1.9999999999999999e-63  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1203  translation initiation factor, aIF-2BI family  41.62 
 
 		 358 aa  243  3.9999999999999997e-63  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.178333 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2269  translation initiation factor 2B subunit I  40.8 
 
 		 349 aa  239  5.999999999999999e-62  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>